संपूर्ण ट्रांसक्रिप्टोम अनुसंधान
[संपूर्ण ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण - गैर-कोडिंग आरएनए और एमआरएनए के बीच लक्षित विनियमन और अंतःक्रिया संबंध पर शोध]
संपूर्ण ट्रांसक्रिप्टोम उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण राइबोसोम-रहित स्ट्रैंड-विशिष्ट लाइब्रेरी निर्माण विधि और छोटे टुकड़े संवर्धन स्क्रीनिंग लाइब्रेरी निर्माण विधि को अपनाता है, जो कोडिंग आरएनए और गैर-कोडिंग आरएनए के लाइब्रेरी निर्माण, अनुक्रमण, सूचना विश्लेषण, संयुक्त विश्लेषण और सीईआरएनए आदि को प्राप्त कर सकता है। इस तरह से यह हो सकता है प्राप्त विशिष्ट जैविक प्रक्रियाओं (जैसे विकास, बीमारी, आदि) से संबंधित संपूर्ण आरएनए ट्रांसक्रिप्ट डेटा जानकारी को शीघ्रता से, व्यापक रूप से और सटीक रूप से प्राप्त करना। डेटा विश्लेषण के माध्यम से, जैविक विनियमन तंत्र पर शोध को "नेटवर्क और बहु-स्तर" के संयोजन वाले त्रि-आयामी मॉडल तक बढ़ाया जा सकता है, जो जैविक घटनाओं की व्यापक व्याख्या करने में सहायक है।
संपूर्ण ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण के दो तरीके हैं, एक है LncRNA-Seq + Small RNA, और दूसरा है LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA, जिससे CircRNA की अधिक व्यापक जानकारी प्राप्त की जा सकती है।
1. दो लाइब्रेरी के साथ संपूर्ण ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण: LncRNA-Seq + लघु RNA
2.तीन लाइब्रेरी के साथ संपूर्ण ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण: LncRNA-Seq + लघु RNA + CircRNA
संपूर्ण ट्रांसक्रिप्टोम कच्चा माल समाधान
| वर्गीकरण | पशु श्रेणी | पौधों की श्रेणी | जीवाणु और कवक श्रेणी | |||
| नमूना प्रकार | पशु ऊतक/कोशिका | कक्ष | संपूर्ण रक्त | पादप ऊतक | फंगल ऊतक | संवर्धित बैक्टीरिया और कवक |
| आरएनए निष्कर्षण | चुंबकीय मनका विधि: 18605/18607/18606; स्तंभ विधि: 19221/19211; ट्राइज़ोल विधि: 10606/19202 | चुंबकीय मनका विधि: 18600/18604; स्तंभ विधि: 19231 | स्तंभ विधि: 19241; ट्राइज़ोल विधि: 19201 | चुंबकीय मनका विधि: 18534/18535/18537; स्तंभ विधि: 19291ES/19292ES | चुंबकीय मनका विधि: 18534/18535/18537; स्तंभ विधि: 19291ES/19292ES | कॉलम विधि: 19301 (कवक को लाइसोजाइम जोड़ने की आवश्यकता है 10403) |
| miRNA निष्कर्षण | स्तंभ विधि: 19331 | स्तंभ विधि: 19331 | स्तंभ विधि: 19332 | स्तंभ विधि: 19331 | — | — |
| miRNA लाइब्रेरी निर्माण | अपेक्षित होना | |||||
| आरआरएनए हटाना | आरएनएसे एच एंजाइमेटिक निष्कासन: 12257; 3 मिनट में तीव्र निष्कासन: 12258 (मानव स्रोत निष्कासन); चुंबकीय मोती विधि निष्कासन: 12266 (स्तनधारी सार्वभौमिक प्रकार)/12267 एवियन सार्वभौमिक प्रकार/12268 घरेलू मुर्गी/12269 ज़ेब्राफ़िश/12270 ड्रोसोफिला /12275 सीप/12278 प्लैनेरियन/12285 मधुमक्खी/12286 गोल्डन ऑर्ब-वेब स्पाइडर/12289 टिक/12290 एडीज़ एल्बोपिक्टस/12287 नेमाटोड | आरएनएसे एच एंजाइमेटिक निष्कासन: 12257; 3 मिनट में तीव्र निष्कासन: 12258 (मानव निष्कासन, रोगाणु के लिए उपयुक्त) | आरएनएसे एच एंजाइमेटिक निष्कासन, ग्लोबिन निष्कासन सहित: 12257 + 12806; आरएनसे एच ग्लोबिन का एंजाइमेटिक निष्कासन: 13572; 3 मिनट में तीव्र निष्कासन: 12258 + 12260 | आरएनएसे एच एंजाइमेटिक निष्कासन: 12254; चुंबकीय मोती विधि निष्कासन: 12262 एंजियोस्पर्म | चुंबकीय मोती विधि हटाने: 12271 कवक सार्वभौमिक प्रकार | चुंबकीय मोती विधि हटाने: 12264 जीवाणु सार्वभौमिक प्रकार / 12265 प्रोकैरियोटिक सार्वभौमिक प्रकार |
| पुस्तकालय निर्माण | गैर-प्रीमिक्स्ड आरएनए लाइब्रेरी निर्माण किट: 12308 दोहरे मोड आरएनए लाइब्रेरी निर्माण किट (इलुमिना और एमजीआई के साथ संगत); प्रीमिक्स्ड आरएनए लाइब्रेरी निर्माण किट: 12310 दोहरे मोड आरएनए लाइब्रेरी निर्माण किट (इलुमिना और एमजीआई के साथ संगत) / 12340 (एक्टिनोमाइसिन डी, डीयूटीपी के बिना) / 12341 (एक्टिनोमाइसिन डी, डीटीटीपी के बिना) | |||||
एलएनसीआरएनए अनुसंधान
लंबा गैर-कोडिंग आरएनए (एलएनसीआरएनए) एक प्रकार का गैर-कोडिंग आरएनए है जिसमें अद्वितीय विनियामक कार्य होता है जिसने हाल के वर्षों में व्यापक ध्यान आकर्षित किया है। एलएनसीआरएनए की लंबाई 200 एनटी से अधिक है, यह प्रोटीन को एनकोड नहीं करता है, और प्रजातियों के बीच इसका संरक्षण खराब है।इसकी कुछ अनुक्रम संरचनाएँ mRNA (पॉलीए टेल और वैकल्पिक स्प्लिसिंग युक्त) के समान हैं, जबकि अन्य में ये विशेषताएँ नहीं हैं। वर्तमान में, LncRNA की पीढ़ी और कार्यात्मक तंत्र अभी तक पूरी तरह से समझा नहीं गया है, हालाँकि, महत्वपूर्ण जैविक कार्यों (जैसे कैंसर की घटना, एक्स गुणसूत्र को शांत करना और अन्य नियामक कारकों के साथ जटिल नियामक नेटवर्क का निर्माण) वाले कई LncRNAs की खोज की गई है।
LncRNA अनुक्रमण तकनीकी मार्ग
LncRNA अनुक्रमण कच्चा माल समाधान
| वर्गीकरण | पशु श्रेणी | पौधा वर्ग | जीवाणु और कवक श्रेणी | |||
| नमूना प्रकार | पशु ऊतक/कोशिका | कक्ष | संपूर्ण रक्त | पादप ऊतक | फफूंद ऊतक | संवर्धित बैक्टीरिया और कवक |
| आरएनए निष्कर्षण | चुंबकीय मनका विधि: 18605/18607/18606; स्तंभ विधि: 19221/19211; ट्राइज़ोल विधि: 10606/19202 | चुंबकीय मनका विधि: 18600/18604; स्तंभ विधि: 19231 | स्तंभ विधि: 19241; ट्राइज़ोल विधि: 19201 | चुंबकीय मनका विधि: 18534/18535/18537; स्तंभ विधि: 19291ES/19292ES | चुंबकीय मनका विधि: 18534/18535/18537; स्तंभ विधि: 19291ES/19292ES | कॉलम विधि: 19301 (कवक को लाइवालजाइम 10403 जोड़ने की आवश्यकता है) |
| आरआरएनए हटाना | आरएनएसे एच एंजाइमेटिक निष्कासन: 12257; 3 मिनट में तेजी से हटाना: 12258 (मानव स्रोत हटाना); चुंबकीय मोती विधि हटाना: 12266 (स्तनधारी सार्वभौमिक प्रकार)/12267 एवियन सार्वभौमिक प्रकार/12268 घरेलू चिकन/12269 ज़ेब्राफिश/12270 ड्रोसोफिला /12275 सीप/12278 प्लैनेरियन/12285 मधुमक्खी/12286 गोल्डन ऑर्ब-वेब स्पाइडर/12289 टिक/12290 एडीस एल्बोपिक्टस/12287 नेमाटोड | आरएनएसे एच एंजाइमी निष्कासन: 12257; 3 मिनट में तीव्र निष्कासन: 12258 (मानव निष्कासन, रोगाणु के लिए उपयुक्त) | आरएनएसे एच एंजाइमेटिक निष्कासन, ग्लोबिन निष्कासन सहित: 12257 + 12806; आरएनसे एच ग्लोबिन का एंजाइमेटिक निष्कासन: 13572; 3 मिनट में तीव्र निष्कासन: 12258 + 12260 | आरएनएसे एच एंजाइमी निष्कासन: 12254; चुंबकीय मोती विधि निष्कासन: 12262 एंजियोस्पर्म | चुंबकीय मोती विधि हटाने: 12271 कवक सार्वभौमिक प्रकार | चुंबकीय मोती विधि हटाने: 12264 जीवाणु सार्वभौमिक प्रकार / 12265 प्रोकैरियोटिक सार्वभौमिक प्रकार |
| पुस्तकालय निर्माण | गैर-प्रीमिक्स्ड आरएनए लाइब्रेरी निर्माण किट: 12308 दोहरे मोड आरएनए लाइब्रेरी निर्माण किट (इलुमिना और एमजीआई के साथ संगत); प्रीमिक्स्ड आरएनए लाइब्रेरी निर्माण किट: 12310 दोहरे मोड आरएनए लाइब्रेरी निर्माण किट (इलुमिना और एमजीआई के साथ संगत) / 12340 (एक्टिनोमाइसिन डी, डीयूटीपी के बिना) | |||||
यूकेरियोटिक ट्रांसक्रिप्टोम अनुसंधान
यूकेरियोटिक ट्रांसक्रिप्टोम अनुसंधान में कुल mRNA प्राप्त करने के लिए RNA-seq प्रौद्योगिकी का उपयोग किया जाता है, जिसे एक निश्चित कार्यात्मक अवस्था में विशिष्ट कोशिकाओं द्वारा प्रतिलेखित किया जा सकता है।फिर, डाउनलोड किए गए कच्चे डेटा को विभाजित और इकट्ठा किया जाता है, जीन अभिव्यक्ति स्तर की गणना की जाती है, और अंतर विश्लेषण और कार्यात्मक संवर्धन विश्लेषण किया जाता है। यह न केवल प्रजातियों की अधिकांश जीन जानकारी प्राप्त कर सकता है, बल्कि समग्र स्तर पर जीन अभिव्यक्ति अंतर और कार्यात्मक मार्ग परिवर्तन का भी अध्ययन कर सकता है, और विशिष्ट जैविक प्रक्रियाओं के आणविक तंत्र को प्रकट कर सकता है।
यूकेरियोटिक ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण तकनीकी मार्ग
यूकेरियोटिक ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण कच्चा माल समाधान
| वर्गीकरण | पशु श्रेणी | पौधों की श्रेणी | फफूंद श्रेणी | |||
| नमूना प्रकार | पशु ऊतक/कोशिका | कक्ष | संपूर्ण रक्त | पादप ऊतक | फंगल ऊतक | संवर्धित कवक |
| आरएनए निष्कर्षण | चुंबकीय मनका विधि: 18605/18607/18606; स्तंभ विधि: 19221/19211; ट्राइज़ोल विधि: 10606/19202 | चुंबकीय मनका विधि: 18600/18604; स्तंभ विधि: 19231 | स्तंभ विधि: 19241; ट्राइज़ोल विधि: 19201 | चुंबकीय मनका विधि: 18534/18535/18537; स्तंभ विधि: 19291ES/19292ES | चुंबकीय मनका विधि: 18534/18535/18537; स्तंभ विधि: 19291ES/19292ES | स्तंभ विधि: 19301 (लाइसोजाइम 10403 जोड़ें) |
| mRNA कैप्चर | 12629 mRNA आइसोलेशन मास्टर किट | 12629 mRNA आइसोलेशन मास्टर किट | 12629 mRNA आइसोलेशन मास्टर किट | 12629 mRNA आइसोलेशन मास्टर किट | 12629 mRNA आइसोलेशन मास्टर किट | 12629 mRNA आइसोलेशन मास्टर किट |
| पुस्तकालय निर्माण | गैर-पूर्वमिश्रित आरएनए लाइब्रेरी किट: 12308 डुअल-मोड आरएनए लाइब्रेरी किट (इलुमिना और एमजीआई संगत) mRNA कैप्चर के साथ गैर-प्रीमिक्स्ड RNA लाइब्रेरी किट: 12309 डुअल-मोड RNA लाइब्रेरी किट (इलुमिना और MGI संगत) प्रीमिक्स्ड आरएनए लाइब्रेरी किट: 12310 डुअल-मोड आरएनए लाइब्रेरी किट (इलुमिना और एमजीआई संगत) / 12340 (एक्टिनोमाइसिन डी, डीयूटीपी के बिना) | |||||
circRNA अनुसंधान
[circRNA अनुक्रमण - circRNA की विभेदक अभिव्यक्ति जैविक प्रक्रियाओं को कैसे प्रभावित करती है, इस पर शोध]
सर्कुलर आरएनए (सर्कआरएनए) एक विशेष प्रकार का गैर-कोडिंग आरएनए विश्लेषण है। अनुक्रमण एक अनुक्रमण प्लेटफ़ॉर्म का उपयोग करके किया जाता है ताकि संदर्भ जीनोम वाले नमूनों के लिए स्रोत जीन की सटीक सर्कआरएनए पहचान और विश्लेषण किया जा सके। सर्कआरएनए अनुक्रमण का उपयोग चिकित्सा और कृषि अनुसंधान क्षेत्रों में तेजी से व्यापक रूप से किया जा रहा है। उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण के आधार पर और मुख्यधारा के डेटाबेस और सर्कआरएनए पहचान सॉफ़्टवेयर पर भरोसा करते हुए, ट्रांसक्रिप्शनल विनियमन में सर्कआरएनए के महत्वपूर्ण कार्यों का गहराई से पता लगाने के लिए परियोजना प्रजातियों की सर्कआरएनए जानकारी का विश्लेषण किया जाता है।
circRNA अनुसंधान कच्चा माल समाधान
| वर्गीकरण | पशु श्रेणी | पौधों की श्रेणी | जीवाणु और कवक श्रेणी | |||
| नमूना प्रकार | पशु ऊतक/कोशिका | कक्ष | संपूर्ण रक्त | पादप ऊतक | फंगल ऊतक | संवर्धित बैक्टीरिया और कवक |
| आरएनए निष्कर्षण | चुंबकीय मनका विधि: 18605/18607/18606; स्तंभ विधि: 19221/19211; ट्राइज़ोल विधि: 10606/19202 | चुंबकीय मनका विधि: 18600/18604; स्तंभ विधि: 19231 | स्तंभ विधि: 19241; ट्राइज़ोल विधि: 19201 | चुंबकीय मनका विधि: 18534/18535/18537; स्तंभ विधि: 19291ES/19292ES | चुंबकीय मनका विधि: 18534/18535/18537; स्तंभ विधि: 19291ES/19292ES | स्तंभ विधि: 19301 (कवक को लाइसोजाइम 10403 मिलाना होगा) |
| आरआरएनए हटाना | आरएनएसे एच एंजाइमी निष्कासन: 12257; 3 मिनट में तीव्र निष्कासन: 12258 (मानव स्रोत निष्कासन); चुंबकीय मनका विधि निष्कासन: 12266 (स्तनधारी सार्वभौमिक प्रकार)/12267 एवियन सार्वभौमिक प्रकार/12268 घरेलू मुर्गी/12269 ज़ेब्राफ़िश/12270 ड्रोसोफिला /12275 सीप/12278 प्लैनेरियन/12285 मधुमक्खी/12286 गोल्डन ऑर्ब-वेब मकड़ी/12289 टिक/12290 एडीज़ एल्बोपिक्टस/12287 नेमाटोड | आरएनएसे एच एंजाइमी निष्कासन: 12257; 3 मिनट में तीव्र निष्कासन: 12258 (मानव निष्कासन, रोगाणु के लिए उपयुक्त) | आरएनएसे एच एंजाइमेटिक निष्कासन, ग्लोबिन निष्कासन सहित: 12257 + 12806; आरएनसे एच ग्लोबिन का एंजाइमेटिक निष्कासन: 13572; 3 मिनट में तीव्र निष्कासन: 12258 + 12260 | आरएनएसे एच एंजाइमी निष्कासन: 12254; चुंबकीय मोती विधि निष्कासन: 12262 एंजियोस्पर्म | चुंबकीय मोती विधि हटाने: 12271 कवक सार्वभौमिक प्रकार | चुंबकीय मोती विधि हटाने: 12264 जीवाणु सार्वभौमिक प्रकार / 12265 प्रोकैरियोटिक सार्वभौमिक प्रकार |
| रेखीय आरएनए पाचन | 14606 RNase R रेखीय RNA अणुओं को हटाने के लिए | 14606 RNase R रेखीय RNA अणुओं को हटाने के लिए | 14606 RNase R रेखीय RNA अणुओं को हटाने के लिए | 14606 RNase R रेखीय RNA अणुओं को हटाने के लिए | 14606 RNase R रेखीय RNA अणुओं को हटाने के लिए | 14606 RNase R रेखीय RNA अणुओं को हटाने के लिए |
| पुस्तकालय निर्माण | गैर-प्रीमिक्स्ड आरएनए लाइब्रेरी निर्माण किट: 12308 दोहरे मोड आरएनए लाइब्रेरी निर्माण किट (इलुमिना और एमजीआई के साथ संगत); प्रीमिक्स्ड आरएनए लाइब्रेरी निर्माण किट: 12310 दोहरे मोड आरएनए लाइब्रेरी निर्माण किट (इलुमिना और एमजीआई के साथ संगत) / 12340 (एक्टिनोमाइसिन डी, डीयूटीपी के बिना) | |||||
मेटाट्रांसक्रिप्टोम
[मेटाट्रांसक्रिप्टोम - सूक्ष्म पारिस्थितिकीय सूक्ष्म वातावरण में सक्रिय सूक्ष्मजीवों के गतिशील परिवर्तनों को कैप्चर करना]
मेटाट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण: समग्र स्तर पर एक विशिष्ट वातावरण में सभी जीनोम के प्रतिलेखन और विनियमन नियमों का अध्ययन करता है।सूक्ष्म पारिस्थितिकीय सूक्ष्म वातावरण में समस्त आरएनए को अनुसंधान वस्तु के रूप में लेते हुए, यह उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण को संयोजित करके, प्रतिलेखन स्तर पर जटिल सूक्ष्मजीव समुदायों में होने वाले परिवर्तनों का अध्ययन करता है तथा भूमिका निभाने वाले सक्रिय जीनों का पता लगाता है।
मेटाट्रांसक्रिप्टोम अनुसंधान कच्चा माल समाधान
| नमूना प्रकार | संवर्धित बैक्टीरिया और कवक | नैदानिक नमूने |
| आरएनए निष्कर्षण | कॉलम विधि: 19301 (कवक को लाइवालजाइम 10403 जोड़ने की आवश्यकता है) | स्तंभ विधि: 19321 (वायरल डीएनए/आरएनए निष्कर्षण); चुंबकीय मनका विधि: 18521 (वायरल डीएनए/आरएनए निष्कर्षण); 18306 (रोगज़नक़ डीएनए/आरएनए निष्कर्षण) |
| आरआरएनए हटाना | 3 मिनट में तेजी से हटाना: 12258 (मानव स्रोत हटाना) | 3 मिनट में तेजी से हटाना: 12258 (मानव स्रोत हटाना) |
| पुस्तकालय निर्माण | विकल्प 1. कुल आरएनए लाइब्रेरी निर्माण: 12308ES दोहरे मोड आरएनए लाइब्रेरी निर्माण किट (इलुमिना और एमजीआई के साथ संगत); विकल्प 2. सीडीएनए एंजाइमेटिक पाचन लाइब्रेरी निर्माण: 13488ES सीडीएनए संश्लेषण मॉड्यूल + 12316ES तीव्र एंजाइमेटिक पाचन लाइब्रेरी निर्माण किट | विकल्प 1. कुल आरएनए लाइब्रेरी निर्माण: 12308ES दोहरे मोड आरएनए लाइब्रेरी निर्माण किट (इलुमिना और एमजीआई के साथ संगत); विकल्प 2.सीडीएनए एंजाइमेटिक पाचन लाइब्रेरी निर्माण: 13488ES सीडीएनए संश्लेषण मॉड्यूल + 12316ES रैपिड एंजाइमेटिक पाचन लाइब्रेरी निर्माण किट |
उत्पाद अनुशंसा
| प्रोडक्ट का नाम | सूची की संख्या | विनिर्देश |
| हिएफ़ एनजीएस टीएम इवोमैक्स आरएनए लाइब्रेरी प्रेप किट (dUTP) | 12340ईएस24/96 | 24 टी/ 96 टी |
| हिएफ़ एनजीएसटीएम इवोमैक्स आरएनए लाइब्रेरी तैयारी किट (डीएनटीपी) | 12341ईएस24/96 | 24 टी/ 96 टी |
| हिएफ़ एनजीएसटीएम अल्टिमा डुअल-मोड आरएनए लाइब्रेरी प्रेप किट (इलुमिना और एमजीआई) | 12308ईएस24/96 | 24 टी/ 96 टी |
| हिएफ़ एनजीएसटीएम अल्टिमा डुअल-मोड आरएनए लाइब्रेरी प्रेप किट (प्रीमिक्स्ड संस्करण) | 12310ईएस24/96 | 24 टी/ 96 टी |
| हिएफ़ एनजीएसटीएम mRNA आइसोलेशन मास्टर किट V2 | 12629ईएस24/96 | 24 टी/ 96 टी |
| हिएफ़ एनजीएसटीएम मैक्सअप ह्यूमन आरआरएनए डेप्लेशन किट (आरआरएनए और आईटीएस/ईटीएस) | 12257ईएस24/96 | 24 टी/ 96 टी |
| हिएफ़ एनजीएसटीएम मैक्सअप आरआरएनए डिप्लेशन किट (प्लांट) | 12254ईएस24/96 | 24 टी/ 96 टी |
| हिएफ़ एनजीएसटीएम वन-स्टेप आरआरएनए रिमूवल किट (मानव, 100-1,000 एनजी) | 12258ईएस24/96 | 24 टी/ 96 टी |
| हिएफ़ एनजीएसटीएम मैगएसपी आरआरएनए रिमूवल किट (बैक्टीरिया (जी- और जी+)) शुद्धिकरण मोतियों के साथ | 12264ईएस24/96 | 24 टी/ 96 टी |