1、पृष्ठभूमि

जीवों में कुल आरएनए का एक उच्च अनुपात rRNA का होता है, लेकिन यह बहुत कम प्रभावी जानकारी प्रदान कर सकता है। ये आरएनए बड़ी संख्या में अमान्य डेटा उत्पन्न करेंगे, जो जैविक जानकारी प्राप्त करने के अध्ययन के लिए बहुत कम महत्व रखते हैं। इस बीच, उच्च अनुपात वाला rRNA, ट्रांसक्रिप्ट में mRNA की अपेक्षाकृत प्रचुरता को कम कर देता है, जिससे कम प्रचुरता वाले ट्रांसक्रिप्ट का पता लगाना प्रभावित होता है। इसलिए, पारंपरिक आरएनए अनुक्रमण (आरएनए-एसईक्यू) में, आरएनए के लागत-प्रभावी अनुक्रमण को प्राप्त करने के लिए आरआरएनए का प्रभावी निष्कासन आवश्यक है।

2、उत्पाद विवरण

(1)मैक्सअप श्रृंखला,आरआरएनए कमी किट

आरआरएनए हटाने वाले अभिकर्मकों की मैक्सअप श्रृंखला, मैसेंजर आरएनए (एमआरएनए) और अन्य गैर-कोडिंग आरएनए को बनाए रखने के लिए नमूने के कुल आरएनए से राइबोसोमल आरएनए (आरआरएनए) को हटाने के लिए आरएनएसे एच पाचन पर आधारित है। नमूना प्रकार समृद्ध हैं, प्रारंभिक मात्रा व्यापक है, पूरी प्रक्रिया में 2 घंटे से कम समय लगता है, और मैनुअल ऑपरेशन का समय 10 मिनट से कम है। साथ ही, पारंपरिक नमूनों और कम गुणवत्ता वाले नमूनों (जैसे एफएफपीई) दोनों के लिए आरआरएनए को कुशलतापूर्वक हटाया जा सकता है, जिससे डेटा अनुक्रमण में प्रभावी डेटा जानकारी में काफी सुधार होता है, और आरएनए नमूनों की लागत प्रभावी अनुक्रमण का एहसास होता है।

(2)मैक्सअप श्रृंखला rRNA हटाने की प्रक्रिया

वर्तमान में, RNase उन्मूलन rRNA हटाने की मुख्य विधि है, विशेष रूप से कुछ RNA क्षरण नमूनों (जैसे FFPE नमूने) के लिए, RNase उन्मूलन इसके फायदे दिखा सकता है।

चित्र 1. मैक्सअप श्रृंखला rRNA निष्कासन सिद्धांत का योजनाबद्ध आरेख

3、उत्पाद प्रदर्शन प्रदर्शन

(1)पौधे के नमूने

पौधों से कुल आरएनए से राइबोसोमल आरएनए को पचाने और निकालने के लिए आरएनएएस एच का उपयोग किया गया था, और हटाने से पहले और बाद में आरआरएनए जीन और एमआरएनए जीन के अभिव्यक्ति परिवर्तनों की तुलना करने के लिए क्यूपीसीआर का उपयोग किया गया था। परिणामों से पता चला कि यह उत्पाद पौधों से आरआरएनए को प्रभावी ढंग से हटा सकता है।

चित्र 2. 1μg अरेबिडोप्सिस पत्ती आरएनए का उपयोग आरआरएनए हटाने के लिए किया गया था, और हटाने से पहले और बाद में आरआरएनए जीन और एमआरएनए जीन के अभिव्यक्ति परिवर्तनों की तुलना करने के लिए क्यूपीसीआर का उपयोग किया गया था

(2)मानव/चूहा/माउस नमूना

आरएनएएस एच का उपयोग पौधों से कुल आरएनए से राइबोसोमल आरएनए को पचाने और हटाने, लाइब्रेरी बनाने और अनुक्रमण भेजने के लिए किया गया था। डेटा विश्लेषण से पता चला कि यह उत्पाद ऐसे नमूनों से आरआरएनए को कुशलतापूर्वक हटा सकता है।

चित्र 3. मानव, चूहे और चूहे के 1μg कुल RNA को नमूने के रूप में लिया गया, और rRNA अवशेषों का rRNA हटाने के बाद अनुक्रमण द्वारा विश्लेषण किया गया

(3)निम्न गुणवत्ता वाले आरएनए नमूने (जैसे एफएफपीई आरएनए)

निम्न-गुणवत्ता वाले नमूनों में ITS/ETS अनुक्रमों का एक बड़ा अनुपात होता है (निम्नलिखित चित्र में FFPE RNA: DV200=20% देखें), और अनुक्रमों का यह हिस्सा बड़ी संख्या में अमान्य डेटा भी उत्पन्न करेगा, इसलिए निम्न-गुणवत्ता वाले नमूनों में ITS/ETS जांच जोड़कर, लक्ष्य अनुक्रमों को और अधिक प्रभावी ढंग से समृद्ध किया जा सकता है। पारंपरिक 45S प्री-आरआरएनए के लिए जांच के अलावा, इस उत्पाद में मानव 45S ITS/ETS क्षेत्र के लिए जांच डिज़ाइन भी जोड़ा गया है, जो यह सुनिश्चित करता है कि पारंपरिक नमूनों में rRNA हटाने के प्रभाव को प्रभावित किए बिना कम गुणवत्ता वाले नमूनों में rRNA निष्कासन अधिक कुशल हो सकता है।

चित्र 4.आईटीएस/ईटीएस जांचों को जोड़ने से पहले और बाद में आरआरएनए अवशेषों और आईटीएस/ईटीएस अवशेषों की तुलना

4、ऑर्डरिंग जानकारी

टीप्रकार

पीउत्पाद का नाम

उत्पाद कोड

उत्पाद विनिर्देश

आरआरएनए निष्कासन किट

हिएफ़ एनजीएसटीएम मैक्सअप ह्यूमन आरआरएनए डेप्लेशन किट (आरआरएनए और आईटीएस/ईटीएस)

12257ईएस08/24/96

8/24/96टी

हिएफ़ एनजीएसटीएम मैक्सअप आरआरएनए डिप्लेशन किट (प्लांट)

12254ईएस08/24/96

8/24टी/96टी

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