Cari amici, vi sentite persi quando vi trovate di fronte a vari anticorpi di controllo del caricamento e di marcatura degli epitopi durante l'immunoblotting proteico? Controllo del caricamento le proteine ​​sono codificate da geni housekeeping negli organismi e sono espresse stabilmente in più tessuti. Sono utilizzate per verificare se gli esperimenti immunologici procedono normalmente e come standard di rilevamento semi-quantitativo per l'espressione proteica. Quindi, come si scelgono correttamente gli anticorpi di controllo del caricamento? È possibile fare riferimento ai seguenti punti.

I. Origine delle specie campione

  1. Per campioni di tessuti o cellule di mammiferi, in genere si scelgono β-actina, α-tubulina, GAPDH, Lamin-B, Istone H3, Na+/K+-ATPasi.
  2. Per i campioni derivati ​​da piante, in genere si scelgono actina vegetale, Rubisco, ecc.
  3. Per altri campioni meno studiati, scegliere la proteina appropriata come riferimento interno consultando la letteratura o i database pertinenti.
II. Peso molecolare della proteina bersaglio

Assicurarsi che il peso molecolare della proteina target differisca da quello del controllo di caricamento di oltre 5KDa per prevenire interferenze durante il rilevamento. Ad esempio, se la proteina target è 40KDa, non è opportuno scegliere β-actina (42KDa) come controllo di caricamento. Si consideri di utilizzare GAPDH (36KDa) o β-tubulina (55KDa) come controllo di caricamento.

III. Sito di espressione della proteina di riferimento interna

Pertanto, la scelta del controllo del caricamento la proteina varia a seconda del sito di estrazione della proteina. Ad esempio, quando si estraggono separatamente proteine ​​citoplasmatiche e nucleari anziché proteine ​​totali, scegliere il controllo di caricamento proteine ​​espresse nel sito corrispondente. Ad esempio, H3 è espresso in modo elevato e stabile nel nucleo cellulare e teoricamente non espresso nel citoplasma. Quindi, per l'estrazione delle proteine ​​citoplasmatiche, H3 non dovrebbe essere utilizzato come proteina di riferimento interna. Invece, scegli β-actina, GAPDH, α-tubulina, ecc., che sono espresse nel citoplasma come proteine ​​di riferimento interne.

Nota: evitare le seguenti situazioni quando si utilizza caricamento di anticorpi di controllo

Localizzazione subcellulare

Proteina di controllo del caricamento

Peso molecolare (KDa)

Appunti

Citoplasma, cellula intera

β-actina

42

Non adatto per estratti nucleari. La β-actina è un componente dei complessi di rimodellamento della cromatina; potrebbe non essere adatto a situazioni in cui vi siano differenze di età significative tra i soggetti della ricerca.

α-tubulina

55

Non adatto per situazioni in cui ci sono differenze di età significative tra i soggetti della ricerca. L'espressione della tubulina cambia con farmaci antimicrobici e antimitotici, quindi non è adatto quando si aggiungono farmaci antitumorali e antimicotici.

β-tubulina

55

GAPDH

36

L'ipossia cellulare causerà un aumento dell'espressione di GAPDH, quindi non è adatta per studi correlati all'ossigeno. Fattori come il diabete possono portare a un aumento dell'espressione di GAPDH.

Vinculina

117

Può essere utilizzato per proteine ​​ad alto peso molecolare.

Mitocondri

Serie COXIV

15-17

Questa serie di proteine ​​è concentrata principalmente a 15-17 KDa. Se il peso molecolare della proteina bersaglio è vicino, prendere in considerazione altri anticorpi di controllo del caricamento.

HSP60

60

Nucleo

Tipo di prodotto

31-37

Questa serie di proteine ​​è concentrata principalmente a 31-37 KDa.

Lamina B1

66

Non adatto per cellule staminali embrionali, non adatto come controllo di caricamento negli esperimenti sull'apoptosi.

PCNA

36

Non adatto alle cellule non proliferanti.

TBP

33-43

Il TBP è pari a 37-43 KDa negli esseri umani e a 33-36 KDa nei topi e nei ratti, non adatto per esperimenti sull'apoptosi.

AA1

65-70

Istone H3

17

La maggior parte delle proteine ​​ha un peso molecolare di circa 17KDa. Se il peso molecolare della proteina bersaglio è vicino, prendere in considerazione altri anticorpi di controllo loadong.

Sangue intero, siero, plasma

Transferrina

77

L'espressione è influenzata da determinati stati patologici e trattamenti, come l'acido retinoico.

Albumina

66

Il contenuto è estremamente elevato, prestare attenzione a ridurre il caricamento del campione negli esperimenti WB.

Gli anticorpi di marcatura funzionano meglio se usati insieme

Negli esperimenti che studiano le interazioni proteiche, come il pull-down, i tag epitopici possono essere fusi al terminale N o C della proteina bersaglio tramite metodi di biologia molecolare. I tag epitopici comunemente utilizzati includono His, HA, Myc e GST. Questi tag epitopici solitamente non influenzano l'attività biologica e la localizzazione intracellulare della proteina bersaglio. L'emergere dei tag epitopici ha fornito praticità per la ricerca scientifica e la produzione industriale.

Tag epitopo

Sequenza di tag

Peso molecolare (KDa)

Etichetta HA

YPYDVPDYA

1.1

Etichetta Myc

EQKLISEEDL

1.2

Etichetta bandiera

DYKDDDDK

1

Etichetta GST

-

26

Etichetta GFP

-

26.9

Etichetta V5

GKPIPNPLLGLDST

1.4

Cervo

GIOCO D'AZZARDO

1.8

Etichetta elettronica

GAPVPYPDPLEPR

1.4

Informazioni sul prodotto

Tipo

Nome del prodotto

Peso molecolare (KDa)

Numero di prodotto

Controllo del caricamento dell'anticorpo

β-actina, mAb di topo

42

30101ES

β-actina, coniglio pAb

42

30102ES

GAPDH (clone:1A6), anticorpo monoclonale del topo

36

30201ES

GAPDH, coniglio pAb

36

30202ES

α-tubulina, mAb di topo

50-55

30304ES

β-tubulina, mAb di topo

50-55

30301ES

β-tubulina, coniglio pAb

50-55

30302ES

Indagine