아가로스는 아가 또는 아가를 함유한 해초에서 추출한 정제된 선형 갈락탄 친수성 콜로이드입니다. 구조적으로는 3,6-안하이드로-α-L-갈락토피라노실 잔기에 연결된 β-D-갈락토피라노실(1-4)로 구성된 선형 폴리머입니다. 겔 시약으로서 겔 전기영동이나 블로팅 방법(예: Northern 또는 Southern)을 통한 일상적인 핵산 분석에 일반적으로 사용되며, 방사형 면역 확산(RID) 실험과 같은 단백질 응용 분야에도 적합합니다.
아가로스 겔 전기영동은 겔 준비, 샘플 로딩, 전기영동을 포함하여 아가로스를 지지 매체로 사용하는 전기영동 방법입니다. 다른 지지 물질 전기영동과의 분석 원리의 주요 차이점은 "분자 체"와 "전기영동"의 이중 역할을 한다는 것입니다. 겔을 전기장에 놓으면 하전된 핵산이 겔 기공을 통해 양극으로 이동합니다. 적절한 시간 동안 다른 조건에서 전기영동한 후, 크기와 형태가 다른 핵산 단편이 겔의 다른 위치에 위치하여 분리가 이루어집니다.
그림 1 핵산 전기영동 실험 작업 단계
그림 2 전기영동 이동 방향 다이어그램
올바른 아가로스를 선택하는 방법은?
아가로스의 기본 매개변수를 기준으로 판단합니다.
- 황산염 함량 - 순도의 지표
- 겔 강도 - 겔을 분해하는 데 필요한 외부 힘
- 겔점 - 수용성 아가로스 용액이 냉각되어 겔을 형성하는 온도.
- 전기삼투(EEO) - 액체가 젤을 관통하는 일종의 전기 운동입니다. 아가로스 젤 내의 음이온 그룹은 매트릭스에 흡착되어 이동하지 않지만, 해리된 양이온은 음극으로 이동하여 전기삼투를 생성합니다. 샘플의 전기영동 이동은 일반적으로 양극으로 이동하기 때문에 EEO로 인한 내부 대류는 분리 효율을 방해할 수 있습니다. 아가로스의 기본 매개변수에 따르면, 고품질 아가로스 젤은 기공이 투명해야 하고, 깨지기 쉽지 않아야 하며, 고순도(저황산염 함량), 고겔 강도, 비교적 높은 겔점(실온에서 빠른 응고), 낮은 EEO와 같은 특성을 가져야 합니다.
아가로스의 분리범위를 기준으로 판단:
아가로스 겔은 분리 범위가 넓고 DNA 겔 회수, DNA 분리, DNA가 재조합되었는지, 플라스미드 등이 잘려졌는지 확인하는 데 일반적으로 사용됩니다. 다양한 크기의 대상 단편은 다양한 농도의 아가로스에 해당합니다. 고농도가 작은 단편을 분리하는 데 적합하다는 원칙에 따라 다음 표를 참조하여 필요에 맞는 최적의 겔 농도를 찾을 수 있습니다.
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아가로스 농도 ( % ) |
≥3 |
2-3 |
1-2 |
0.7-1 |
≤0.7 |
|
DNA 단편 크기(bp) |
≤200 |
200~700 |
700-1500 |
1500~5000 |
≥5000 |
YEASEN 고품질 아가로스 - 귀하의 요구 사항을 충족하는 다양한 응용 시나리오를 포괄합니다.
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제품 이름 |
제품 번호 |
제품 사양 |
응용 프로그램 시나리오 |
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10208ES60/76 |
100g / 500g |
일상 핵산 전기영동 |
제품의 장점
낮은 전기침투(EEO ≤ 0.13)로 인해 뛰어난 밴드 분리, 명확한 구분 및 빠른 이동이 가능합니다.
젤 모공은 투명하고 곧으며, 젤 강도가 높고 깨질 가능성이 적습니다.
고품질 아가로스 사용 방법
아가로스 겔의 농도는 일반적으로 0.7%~2% 사이에서 선택됩니다. 농도가 높을수록 겔의 분자 기공 크기가 작아지고 DNA 이동 속도가 느려지고 분해능이 높아집니다. 반대로 농도가 낮을수록 DNA 이동 속도가 빨라지고 분해능이 낮아집니다. 다양한 실험 목적에 따라 적절한 겔 농도와 호환되는 전기영동 완충액을 선택합니다.
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아가로스 농도 |
유효 분리 범위(bp) |
추천 버퍼 |
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0.5% |
2,000~50,000 |
1×태이 |
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0.8% |
800~10,000 |
1×태이 |
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1.0% |
400~8,000 |
1×태이 |
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1.2% |
300~7,000 |
1×태이 |
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1.5% |
200~3,000명 |
1×TAE/0.5×TBE |
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2.0% |
100~2,000명 |
1×TAE/0.5×TBE |
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3.0% |
25-1,000 |
0.5×TBE |
출판된 문헌(일부)
- Li Z, Wang M, Fang H, et al. 나노플라스틱에 의해 유도된 항생제 내성 플라스미드의 고체-액체 계면 흡착은 수생 생태계의 유전자 오염을 악화시킨다. Environ Pollut. 2023. doi:10.1016/j.envpol.2022.120456. IF=10.366(10208ES)
- Wang M, Zhang S, Zheng G, et al. Card14의 기능 이득 돌연변이는 IL-17A에 대한 각질세포 반응 증가를 통해 자발적인 건선 유사 피부 염증을 유발합니다. 면역. 2018;49(1):66-79.e5. doi:10.1016/j.immuni.2018.05.012. IF =19. 734
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관련 제품 선택 가이드
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제품 포지셔닝 |
제품 이름 |
제품 번호 |
제품 사양 |
응용 프로그램 시나리오 |
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핵산 염색 |
10202ES76 |
500 μL |
수용성이며 EB와 동일한 분광 특성을 갖고 있으며 300 nm UV 광 여기에서 감지됩니다. |
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DNA 마커 |
10501ES60/80 |
100T/10×100T |
100~2000bp |
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골드밴드 DL5000 DNA 마커 |
10504ES60/80 |
100T/10×100T |
100~5000bp |
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10507ES60/80 |
100T/10×100T |
100~1,500bp |
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10510ES60/80 |
100T/10×100T |
250-12,000bp |