A Pesquisa Completa do Transcriptoma
[Sequenciamento do Transcriptoma Completo - Pesquisa sobre a Regulação Direcionada e a Relação de Interação entre RNA Não-codificante e mRNA]
O sequenciamento de alto rendimento do transcriptoma completo adota o método de construção de biblioteca específica de fita depletada de ribossoma e o método de construção de biblioteca de triagem de enriquecimento de pequenos fragmentos, que pode atingir a construção de biblioteca, sequenciamento, análise de informações, análise conjunta e ceRNA, etc. de RNA codificador e RNA não codificador. dessa forma pode obter todas as informações de dados de transcrição de RNA relacionadas a processos biológicos específicos (como desenvolvimento, doença, etc.) de forma rápida, abrangente e precisa. Por meio da análise de dados, a pesquisa sobre o mecanismo de regulação biológica pode ser estendida a um modelo tridimensional combinando "rede e multinível", o que é útil para interpretar de forma abrangente os fenômenos biológicos.
Existem duas maneiras de sequenciamento do transcriptoma completo: uma é LncRNA-Seq + RNA pequeno, e a outra é LncRNA-Seq + RNA pequeno + CircRNA, que pode obter informações mais abrangentes do CircRNA.
1. Sequenciamento do transcriptoma completo com duas bibliotecas: LncRNA-Seq + Small RNA
2.Sequenciamento do transcriptoma completo com três bibliotecas: LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA
Solução de matéria-prima do transcriptoma completo
| Classificação | Categoria Animal | Categoria de planta | Categoria Bacteriana e Fúngica | |||
| Tipo de amostra | Tecido/célula animal | Célula | Sangue total | Tecido vegetal | Tecido fúngico | Bactérias e fungos cultivados |
| Extração de RNA | Método das esferas magnéticas: 18605/18607/18606; Método das colunas: 19221/19211; Método Trizol: 10606/19202 | Método das esferas magnéticas: 18600/18604; Método da coluna: 19231 | Método da coluna: 19241; Método Trizol: 19201 | Método das esferas magnéticas: 18534/18535/18537; Método da coluna: 19291ES/19292ES | Método das esferas magnéticas: 18534/18535/18537; Método da coluna: 19291ES/19292ES | Método da coluna: 19301 (fungos precisam adicionar Lisozima 10403) |
| Extração de miRNA | Método da coluna: 19331 | Método da coluna: 19331 | Método da coluna: 19332 | Método da coluna: 19331 | — | — |
| Construção da biblioteca miRNA | De se esperar | |||||
| Remoção de rRNA | RNase Remoção enzimática H: 12257; remoção rápida de 3 minutos: 12258 (remoção de fonte humana); remoção por método de esferas magnéticas: 12266 (tipo universal de mamífero)/12267 tipo universal de ave/12268 galinha doméstica/12269 peixe-zebra/12270 Drosophila/12275 ostra/12278 planária/12285 abelha/12286 aranha-orbóide dourada/12289 carrapato/12290 Aedes albopictus/12287 nematoide | RNase Remoção enzimática H: 12257; remoção rápida de 3 minutos: 12258 (remoção humana, adequada para patógenos) | RNase Remoção enzimática H, incluindo remoção de globina: 12257 + 12806; RNase H remoção enzimática de globina: 13572; remoção rápida de 3 minutos: 12258 + 12260 | RNase H remoção enzimática: 12254; Método de remoção de esferas magnéticas: 12262 angiospermas | Método de remoção de esferas magnéticas: 12271 tipo universal de fungos | Método de remoção de esferas magnéticas: 12264 tipo universal bacteriano/12265 tipo universal procariótico |
| Construção de biblioteca | Kit de construção de biblioteca de RNA não pré-misturado: kit de construção de biblioteca de RNA de modo duplo 12308 (compatível com Illumina e MGI); Kit de construção de biblioteca de RNA pré-misturado: kit de construção de biblioteca de RNA de modo duplo 12310 (compatível com Illumina e MGI)/12340 (sem actinomicina D, dUTP)/12341 (sem actinomicina D, dTTP) | |||||
Pesquisa LncRNA
O RNA não codificante longo (LncRNA) é um tipo de RNA não codificante com função regulatória única que atraiu muita atenção nos últimos anos. O comprimento do LncRNA é maior que 200nt, ele não codifica proteínas e sua conservação entre espécies é ruim.Algumas de suas estruturas de sequência são semelhantes ao mRNA (contendo cauda poliA e splicing alternativo), enquanto outras não têm essas características. Atualmente, a geração e o mecanismo funcional do LncRNA ainda não são totalmente compreendidos, no entanto, muitos LncRNAs com funções biológicas importantes (como ocorrência de câncer, silenciamento do cromossomo X e formação de redes regulatórias complexas com outros fatores regulatórios) foram descobertos.
Rota Técnica de Sequenciamento de LncRNA
Solução de matéria-prima para sequenciamento de LncRNA
| Classificação | Categoria Animal | Plantar Categoria | Categoria Bacteriana e Fúngica | |||
| Tipo de amostra | Tecido/célula animal | Célula | Sangue total | Tecido vegetal | Tecido fúngico | Bactérias e fungos cultivados |
| Extração de RNA | Método das esferas magnéticas: 18605/18607/18606; Método das colunas: 19221/19211; Método do trizol: 10606/19202 | Método das esferas magnéticas: 18600/18604; Método da coluna: 19231 | Método da coluna: 19241; Método do trizol: 19201 | Método das esferas magnéticas: 18534/18535/18537; Método da coluna: 19291ES/19292ES | Método das esferas magnéticas: 18534/18535/18537; Método da coluna: 19291ES/19292ES | Método da coluna: 19301 (fungos precisam adicionar lywallzyme 10403) |
| Remoção de rRNA | RNase H remoção enzimática: 12257; Remoção rápida de 3 minutos: 12258 (remoção de fonte humana); Remoção por método de esferas magnéticas: 12266 (tipo universal de mamífero)/12267 tipo universal de ave/12268 galinha doméstica/12269 peixe-zebra/12270 Drosophila/12275 ostra/12278 planária/12285 abelha/12286 aranha-orbóide dourada/12289 carrapato/12290 Aedes albopictus/12287 nematoide | RNase H remoção enzimática: 12257; remoção rápida de 3 minutos: 12258 (remoção humana, adequada para patógenos) | RNase H remoção enzimática, incluindo remoção de globina: 12257 + 12806; RNase H remoção enzimática de globina: 13572; remoção rápida de 3 minutos: 12258 + 12260 | RNase H remoção enzimática: 12254; Método de remoção de esferas magnéticas: 12262 angiospermas | Método de remoção de esferas magnéticas: 12271 tipo universal de fungos | Método de remoção de esferas magnéticas: 12264 tipo universal bacteriano/12265 tipo universal procariótico |
| Construção de biblioteca | Kit de construção de biblioteca de RNA não pré-misturado: kit de construção de biblioteca de RNA de modo duplo 12308 (compatível com Illumina e MGI); Kit de construção de biblioteca de RNA pré-misturado: kit de construção de biblioteca de RNA de modo duplo 12310 (compatível com Illumina e MGI)/12340 (sem actinomicina D, dUTP) | |||||
Pesquisa do transcriptoma eucariótico
A pesquisa do transcriptoma eucariótico usa a tecnologia de RNA-seq para obter o mRNA total que pode ser transcrito por células específicas em um determinado estado funcional.Em seguida, os dados brutos baixados são emendados e montados, o nível de expressão genética é contado e a análise diferencial e a análise de enriquecimento funcional são realizadas. Ele pode não apenas obter a maioria das informações genéticas da espécie, mas também estudar a diferença de expressão genética e a mudança da via funcional no nível geral e revelar o mecanismo molecular de processos biológicos específicos.
Rota Técnica de Sequenciamento do Transcriptoma Eucariótico
Solução de matéria-prima para sequenciamento do transcriptoma eucariótico
| Classificação | Categoria Animal | Categoria de planta | Categoria Fungal | |||
| Tipo de amostra | Tecido/célula animal | Célula | Sangue total | Tecido vegetal | Tecido fúngico | Fungos Cultivados |
| Extração de RNA | Método das esferas magnéticas: 18605/18607/18606; Método das colunas: 19221/19211; Método do trizol: 10606/19202 | Método das esferas magnéticas: 18600/18604; Método da coluna: 19231 | Método da coluna: 19241; Método do trizol: 19201 | Método das esferas magnéticas: 18534/18535/18537; Método da coluna: 19291ES/19292ES | Método das esferas magnéticas: 18534/18535/18537; Método da coluna: 19291ES/19292ES | Método da coluna: 19301 (adicionar lisozima 10403) |
| Captura de mRNA | Kit mestre de isolamento de mRNA 12629 | Kit mestre de isolamento de mRNA 12629 | Kit mestre de isolamento de mRNA 12629 | Kit mestre de isolamento de mRNA 12629 | Kit mestre de isolamento de mRNA 12629 | Kit mestre de isolamento de mRNA 12629 |
| Construção de biblioteca | Kit de biblioteca de RNA não pré-misturado: Kit de biblioteca de RNA de modo duplo 12308 (compatível com Illumina e MGI) Kit de biblioteca de RNA não pré-misturado com captura de mRNA: Kit de biblioteca de RNA de modo duplo 12309 (compatível com Illumina e MGI) Kit de biblioteca de RNA pré-misturado: Kit de biblioteca de RNA de modo duplo 12310 (compatível com Illumina e MGI)/12340 (sem actinomicina D, dUTP) | |||||
Pesquisa circRNA
[Sequenciamento de circRNA - Pesquisa sobre como a expressão diferencial de circRNA afeta os processos biológicos]
O RNA circular (circRNA) é um tipo especial de análise de RNA não codificador. O sequenciamento é realizado usando uma plataforma de sequenciamento para conduzir a identificação precisa do circRNA e a análise dos genes de origem para amostras com um genoma de referência. O sequenciamento do circRNA é cada vez mais amplamente usado em campos de pesquisa médica e agrícola. Com base no sequenciamento de alto rendimento e contando com bancos de dados convencionais e software de identificação do circRNA, as informações do circRNA das espécies do projeto são analisadas para explorar profundamente as funções importantes do circRNA na regulação transcricional.
Solução de matéria-prima para pesquisa circRNA
| Classificação | Categoria Animal | Categoria de planta | Categoria Bacteriana e Fúngica | |||
| Tipo de amostra | Tecido/célula animal | Célula | Sangue total | Tecido vegetal | Tecido fúngico | Bactérias e fungos cultivados |
| Extração de RNA | Método das esferas magnéticas: 18605/18607/18606; Método das colunas: 19221/19211; Método do trizol: 10606/19202 | Método das esferas magnéticas: 18600/18604; Método da coluna: 19231 | Método da coluna: 19241; Método do trizol: 19201 | Método das esferas magnéticas: 18534/18535/18537; Método da coluna: 19291ES/19292ES | Método das esferas magnéticas: 18534/18535/18537; Método da coluna: 19291ES/19292ES | Método da coluna: 19301 (fungos precisam adicionar lisozima 10403) |
| Remoção de rRNA | RNase H remoção enzimática: 12257; remoção rápida de 3 minutos: 12258 (remoção de fonte humana); remoção por método de esferas magnéticas: 12266 (tipo universal de mamífero)/12267 tipo universal de ave/12268 galinha doméstica/12269 peixe-zebra/12270 Drosophila/12275 ostra/12278 planária/12285 abelha/12286 aranha-orbóide dourada/12289 carrapato/12290 Aedes albopictus/12287 nematoide | RNase H remoção enzimática: 12257; remoção rápida de 3 minutos: 12258 (remoção humana, adequada para patógenos) | RNase H remoção enzimática, incluindo remoção de globina: 12257 + 12806; RNase H remoção enzimática de globina: 13572; remoção rápida de 3 minutos: 12258 + 12260 | RNase H remoção enzimática: 12254; Método de remoção de esferas magnéticas: 12262 angiospermas | Método de remoção de esferas magnéticas: 12271 tipo universal de fungos | Método de remoção de esferas magnéticas: 12264 tipo universal bacteriano/12265 tipo universal procariótico |
| Digestão Linear de RNA | 14606 RNase R para remover moléculas de RNA linear | 14606 RNase R para remover moléculas de RNA linear | 14606 RNase R para remover moléculas de RNA linear | 14606 RNase R para remover moléculas de RNA linear | 14606 RNase R para remover moléculas de RNA linear | 14606 RNase R para remover moléculas de RNA linear |
| Construção de biblioteca | Kit de construção de biblioteca de RNA não pré-misturado: kit de construção de biblioteca de RNA de modo duplo 12308 (compatível com Illumina e MGI); Kit de construção de biblioteca de RNA pré-misturado: kit de construção de biblioteca de RNA de modo duplo 12310 (compatível com Illumina e MGI)/12340 (sem actinomicina D, dUTP) | |||||
Metatranscriptoma
[Metatranscriptoma - Capturando as mudanças dinâmicas de microrganismos ativos no microambiente microecológico]
Sequenciamento do metatranscriptoma: estuda as regras de transcrição e regulação de todos os genomas em um ambiente específico em nível geral.Tomando todo o RNA no microambiente microecológico como objeto de pesquisa, ele combina sequenciamento de alto rendimento para estudar as mudanças de comunidades microbianas complexas no nível transcricional e extrair os genes ativos que desempenham um papel.
Solução de matéria-prima para pesquisa de metatranscriptoma
| Tipo de amostra | Bactérias e fungos cultivados | Amostras clínicas |
| Extração de RNA | Método da coluna: 19301 (fungos precisam adicionar lywallzyme 10403) | Método de coluna: 19321 (extração de DNA/RNA viral); Método de esferas magnéticas: 18521 (extração de DNA/RNA viral); 18306 (extração de DNA/RNA patogênico) |
| Remoção de rRNA | Remoção rápida de 3 minutos: 12258 (remoção de fonte humana) | Remoção rápida de 3 minutos: 12258 (remoção de fonte humana) |
| Construção de biblioteca | Opção 1. Construção de biblioteca de RNA total: kit de construção de biblioteca de RNA de modo duplo 12308ES (compatível com Illumina e MGI); Opção 2. Construção de biblioteca de digestão enzimática de cDNA: módulo de síntese de cDNA 13488ES + kit de construção de biblioteca de digestão enzimática rápida 12316ES | Opção 1. Construção de biblioteca de RNA total: kit de construção de biblioteca de RNA de modo duplo 12308ES (compatível com Illumina e MGI); Opção 2.Construção de biblioteca de digestão enzimática de cDNA: módulo de síntese de cDNA 13488ES + kit de construção de biblioteca de digestão enzimática rápida 12316ES |
Recomendação de produto
| Nome do produto | Número de catálogo | Especificação |
| Hieff NGS TM Kit de preparação de biblioteca de RNA EvoMax (dUTP) | 12340ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Hieff NGSTM Kit de preparação de biblioteca de RNA EvoMax (dNTP) | 12341ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Hieff NGSTM Kit de preparação de biblioteca de RNA de modo duplo Ultima (Illumina e MGI) | 12308ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Hieff NGSTM Kit de preparação de biblioteca de RNA de modo duplo Ultima (versão pré-misturada) | 12310ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Hieff NGSTM Kit mestre de isolamento de mRNA V2 | 12629ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Hieff NGSTM Kit de depleção de rRNA humano MaxUp (rRNA e ITS/ETS) | 12257ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Hieff NGSTM Kit de depleção de rRNA MaxUp (planta) | 12254ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Hieff NGSTM Kit de remoção de rRNA em uma etapa (humano, 100-1.000 ng) | 12258ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Hieff NGSTM Kit de remoção de rRNA MagSP (bactérias (G- e G+)) com esferas de purificação | 12264ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |