1、Antecedentes
O rRNA é responsável por uma alta proporção do RNA total em organismos, mas pode fornecer pouca informação efetiva. Esses Rnas produzirão um grande número de dados inválidos, o que é de pouca importância para o estudo da obtenção de informações biológicas. Enquanto isso, o rRNA com uma alta proporção torna o mRNA relativamente abundante em transcritos baixos, afetando assim a detecção de transcritos com baixa abundância. Portanto, no sequenciamento de RNA convencional (RNA-SEQ), a remoção efetiva do rRNA é essencial para atingir o sequenciamento de RNA com boa relação custo-benefício.
2、Descrição do produto
（1）Série MaxUp, Kit de Depleção de rRNA
A série MaxUp de reagentes de remoção de rRNA é baseada na digestão de RNase H para remover o RNA ribossômico (rRNA) do RNA total de uma amostra para reter o RNA mensageiro (mRNA) e outros Rnas não codificantes. Os tipos de amostra são ricos, a quantidade inicial é ampla, todo o processo leva menos de 2h e o tempo de operação manual é inferior a 10min. Ao mesmo tempo, o rRNA pode ser removido com eficiência tanto para amostras convencionais quanto para amostras de baixa qualidade (como FFPE), melhorando significativamente as informações de dados eficazes no sequenciamento de dados e realizando o sequenciamento econômico de amostras de RNA.
（2）Processos de remoção de rRNA da série MaxUp
Atualmente, a eliminação de RNase é o principal método de remoção de rRNA, especialmente para algumas amostras de degradação de RNA (como amostras FFPE), a eliminação de RNase pode mostrar suas vantagens.
Figura 1. Diagrama esquemático do princípio de remoção de rRNA da série MaxUp
3、Exibição de desempenho do produto
（1）Amostras de plantas
RNase H foi usada para digerir e remover RNA ribossômico do RNA total de plantas, e qPCR foi usado para comparar as mudanças de expressão do gene rRNA e do gene mRNA antes e depois da remoção. Os resultados mostraram que este produto poderia efetivamente remover rRNA de plantas.
FIG. 2. 1μg de RNA da folha de Arabidopsis foi usado para remoção de rRNA, e qPCR foi usado para comparar as mudanças de expressão do gene rRNA e do gene mRNA antes e depois da remoção
（2）Amostra humana/rato/camundongo
A RNase H foi usada para digerir e remover o RNA ribossômico do RNA total das plantas, construir uma biblioteca e enviar o sequenciamento. A análise de dados mostrou que este produto poderia remover eficientemente o rRNA dessas amostras.
Figura 3. 1μg de RNA total de humanos, camundongos e ratos foi coletado como amostras, e os resíduos de rRNA foram analisados por sequenciamento após a remoção do rRNA
（3）Amostras de RNA de baixa qualidade (por exemplo, RNA FFPE)
Amostras de baixa qualidade tendem a ter uma grande proporção de sequências ITS/ETS (consulte FFPE RNA: DV200=20% na figura a seguir), e essa parte das sequências também produzirá um grande número de dados inválidos, então, ao adicionar sondas ITS/ETS em amostras de baixa qualidade, as sequências alvo podem ser enriquecidas de forma ainda mais eficaz. Além da sonda para o pré-rRNA 45S convencional, o design da sonda para a região ITS/ETS 45S humana também é adicionado neste produto, o que garante que a remoção de rRNA em amostras de baixa qualidade pode ser mais eficiente sem afetar o efeito de remoção de rRNA em amostras convencionais.
Figura 4.Comparação de resíduos de rRNA e resíduos de ITS/ETS antes e depois da adição de sondas de ITS/ETS
4、Informações sobre pedidos
| Etipo | Pnome do produto | Código do produto | Especificações do produto |
| remoção de rRNA conjunto | Hieff NGSTM Kit de depleção de rRNA humano MaxUp (rRNA e ITS/ETS) | 12257ES08/24/96 | 24/08/96T |
| 12254ES08/24/96 | 8/24T/96T |