С января 2024 года область репродуктивной генетики постепенно достигла ряда важных этапов, и четыре экспертных консенсуса относительно направления скрининга носителей появились для совместной поддержки перевода клинического применения скрининга. Наборы для генетического обнаружения NGS многих компаний по обнаружению были последовательно одобрены для продажи, а репродуктивное генетическое обнаружение ускорило эру «сертификации», значительно расширив сферу применения технологии NGS в пренатальной диагностике и ознаменовав еще один ключевой шаг для технологии NGS в построении системы профилактики и контроля врожденных дефектов в Китае.

11 января 2024 года продукт Annoyoda CNV-seq был одобрен для одновременного выявления хромосомной анеуплоидии и вариации CNV в образцах амниотической жидкости и заполнения внутреннего пробела;

21 февраля 2024 года набор для обнаружения амниотической жидкости BGI CNV-seq получил свидетельство о регистрации медицинского устройства, что продолжает открывать новую главу в профилактике и контроле врожденных дефектов после того, как в 2022 году был сертифицирован набор для обнаружения абортивных тканей CNV-Seq;

21 марта 2024 года «Набор для анализа вариаций числа копий хромосом (обратимое секвенирование терминации концов)» компании Berry Gene был одобрен Управлением по контролю за продуктами питания и лекарственными средствами Китая (NMPA) для продажи.

11 апреля 2024 года метод анализа вариаций числа копий хромосом на основе технологии микрочипов (CMA) Джея Йимата официально одобрил сертификат регистрации NMPA.

Общие категории репродуктивного генетического обнаружения NGS

Категория

Неинвазивное пренатальное генетическое тестирование – НИПТ

Технология секвенирования вариаций числа копий генома - CNV-seq

Полное секвенирование экзома - WES

Полное секвенирование генома - WGS

Генетическое тестирование на имплантацию эмбриона (ПГТ-А, ПГТ-М, ПГТ-СР)

Скрининг носителей NGS-тестирование

Тип образца

Периферическая кровь беременных женщин

Амниотическая жидкость, ворсины, пуповинная кровь, абортированная ткань, периферическая кровь

Образцы геномной ДНК, цельная кровь, образцы тканей и т. д.

Кровь, ткани, амниотическая жидкость и т. д.

Эмбриональные клетки, стадия бластоцисты, экстратрофобласт

Периферическая кровь, эмбриональные клетки

ДИАПАЗОН ОБНАРУЖЕНИЯ

Анеуплоидия всей хромосомы

Анеуплоидия всей хромосомы, крупные делеции/дупликации и CNV по всему геному

Аномальное число хромосом, вариация числа копий (CNV), вариация одного основания (SNV) и вариация вставки/делеции небольшого фрагмента (indel)

Анеуплоидия целых хромосом, известные моногенные генетические нарушения в семье, структурные хромосомные аномалии (транслокации, инверсии и т. д.)

Аутосомно-рецессивные заболевания, заболевания, сцепленные с Х-хромосомой, и аутосомно-доминантные заболевания.

Показания

Программа планового скрининга, в основном для беременных женщин

Абортированная, мертворожденная или мертворожденная плодная ткань, требующая идентификации генетической этиологии; беременные женщины с показаниями или необходимостью проведения интервенционной пренатальной диагностики

Пациенты, у которых не может быть проведена клиническая диагностика и у которых есть высокое подозрение на генетические заболевания; люди с семейным анамнезом моногенных генетических заболеваний; пациенты с существенным семейным анамнезом, но не знающие, какое именно заболевание; пациенты с отклонениями в психическом статусе, такими как необъяснимая задержка развития и умственная отсталость; и пациенты с высоким клиническим подозрением на заболевания, вызванные генетическими мутациями.

Повторные аборты с пересадкой плода и женщины пожилого возраста; пары являются носителями одного и того же аутосомно-рецессивного заболевания.

Имеются родственники с подозрением на наследственные заболевания; обратите внимание на здоровье потомства, пары с желанием иметь детей и т. д.

Решения для репродуктивного генетического тестирования NGS

Решение 1. Амплификация всего генома одной клетки эффективный фермент переваривание и построение библиотеки, что способствует более точному обнаружению ПГТ

Комплект Hieff NGS Single Cell/Low Input WGA (Cat12510) + комплект Hieff NGS C169P1 OnePot Pro DNA Library Prep Kit (Cat13570)

Презентация выступления:

Комплект библиотеки

Образцы ДНК и исходные данные

Условия библиотеки

Соединитель

Количество циклов

12570 + ферментативная библиотека построение 13570

Продукт WGA

Ввод 100 нг

Фрагмент ДНК 30℃ в течение 25 мин, dA-хвост в течение 20 мин и перевязка адаптера на 15 мин

MGI-адаптер

6цикл

Производительность Производительность

Решение 2. Извлечение cfDNA + создание высокопроизводительной библиотеки ДНК для более эффективного неинвазивного обнаружения пренатальной ДНК

Набор для магнитной циркулирующей бесклеточной ДНК MolPure (каталожный номер 18382ES) + Набор для подготовки библиотеки ДНК Hieff NGS (Cat12927)

Рабочий процесс здания библиотеки

Презентация производительности

Набор

Образец

Условия эксперимента

Количество циклов

Библиотечное учреждение 12927

образец cfDNA

Входное количество составляло 0,1–5 нг, с длинными адаптерами Illumina, 1,0 × очищенными после лигирования адаптеров, библиотека была амплифицирована в течение 15 циклов, и амплифицированные продукты были отсортированы 0,8/0,15 ×.

15 циклов

Производительность Производительность

Решение 3.Продукт многофункционален и синхронно реализует обнаружение WGS, WES и CNV-seq.

Комплект для подготовки библиотеки ДНК Hieff NGS OnePot Pro V3 (Cat12194)

Презентация производительности

Набор

ОБРАЗЦЫ И ВХОДНОЙ ОБЪЕМ

Условия эксперимента

Количество циклов

Библиотечный реагент 12194

Стандарт: образец NA12878 500 нг

Время прерывания 15 мин; 0,3/0,1 × сортировка после лигирования адаптера; продукт амплификации 0,9 × очищение

7 циклов

Производительность Производительность

Решение 4. Реагент для захвата всего экзома для поддержания репродуктивного здоровья

Hieff NGS Human All Exon Probes (Cat12244)

Процесс строительства библиотеки

Презентация производительности

Набор

ОБРАЗЦЫ И ВХОДНОЙ ОБЪЕМ

Условия эксперимента

Количество циклов

Библиотечный реагент 12194 + зонд захвата 12244

Стандарт: образец NA12878 500 нг

Гибридизационный захват зондов целого экзома: 1) анализы секвенирования конструкции библиотеки Illumina и MGI; 2) анализы реагентов захвата WES от разных производителей; 3) данные о стабильности от партии к партии; 4) гибридизация в течение ночи и быстрые тесты на последовательность различных эффектов

7 циклов

Производительность Производительность

Решение 5. Мультиплексная ПЦР-амплификация для точного обнаружения известных локусов

2 × Hieff NGS HG Мультиплекс ПЦР Мастер Микс (Cat13283)

Презентация производительности

Набор

Образец

Условия эксперимента

Количество циклов

Мультиплекс 13283

Образцы человеческой генной ДНК

1) Объединить с человеческой 10-плексной панелью и Система объемом 30 мкл для оценки однородности амплификации; 2) Объедините человеческую геномную ДНК (10 нг) с панелью генов горячих точек примерно в 200 весах для оценки охвата теста.

20-30циклов

Производительность Производительность

В области репродуктивной генетики маркетинг продукции постепенно «нормализуется», что является важным признаком стандартизации и зрелости отрасли.Наборы для множественного репродуктивного генетического тестирования Yisheng отвечают различным потребностям многих клиентов и помогают точнее и удобнее выявлять и контролировать врожденные дефекты!

Руководство по выбору продуктов для тестирования NGS в целях охраны репродуктивного здоровья

ПРОДУКТ

Название продукта

Номер по каталогу

Программа НИПТ

Извлечение CfDNA

Магнитный набор для бесклеточной ДНК MolPure

18382ES

Банк ДНК механическим методом

Комплект для подготовки библиотеки ДНК Hieff NGS 2.0

12927ES

Программа ПГТ

Амплификация всего генома одной клетки

Комплект Hieff NGS Single Cell/WGA с низким входным напряжением

12510ES

Библиотека переваривания ДНК

Комплект для подготовки библиотеки ДНК Hieff NGS OnePot Pro V3

12194ES

Мультиплексная ПЦР-амплификация Master Mix

2 × Hieff NGS HG Мультиплекс ПЦР Мастер Микс

13283ES

Тестирование на генетические заболевания

Извлечение ДНК из крови

Магнитный набор ДНК крови MolPure

18504ES

Библиотека переваривания ДНК

Комплект для подготовки библиотеки ДНК Hieff NGS OnePot Pro V3

12194ES

Расследование