环状RNA(circRNA)是一类独特的非编码RNA分子,它们通过一种称为反向剪接的机制形成,前体mRNA的两个外显子在剪接过程中连接成闭环结构,从而避免了线性RNA分子中常见的5'帽子和3'尾巴结构。 这种环状结构赋予circRNA较高的稳定性,使其在细胞内不易被核酸酶降解,因此在细胞内具有较长的半衰期,在实际应用中可以实现低剂量、长效的作用。 此外,circRNA 具有生产过程相对简单的优势,因为它不需要 这 修饰核苷酸 封端或多聚腺苷酸化,使环状RNA成为药物开发的热点。

在药物开发方面具有显著优势,具体包括: 上市 以下:

01 更高的稳定性

circRNA 的结构使其能够抵抗核酸酶的降解,因此 它具有较长的半衰期和在细胞内较高的稳定性,这对于药物的持续作用至关重要。

02 低免疫原性

与线性RNA相比,circRNA的免疫原性更低,降低了发生免疫反应的可能性,使其更适合作为药物载体。

03 高效蛋白质表达

研究表明,工程化的环状RNA可以在真核细胞中稳定高效地表达蛋白质,这对于蛋白质替代疗法尤为重要。

04 潜在的疾病治疗应用

circRNA已显示出在各种疾病的治疗中发挥的潜力,包括罕见疾病、癌症治疗以及作为疫苗开发的一部分。

05 创新交付系统

新开发的递送系统,如脂质纳米颗粒(LNPs),可以有效地将circRNA递送至靶细胞,这对于药物的靶向和疗效至关重要。

06 疫苗研发

circRNA疫苗在COVID-19疫苗研发中展现出潜力,能够诱导产生更多的中和抗体和有效的T细胞反应,并且与线性mRNA相比在常温下更稳定,有助于简化储存和运输条件。

07 基因编辑

circRNA在基因编辑领域也展现出潜力,能够作为基因编辑系统的模板,提供更持久、稳定的蛋白质表达。

circRNA的生产过程包括:模板准备、体外转录、DNA模板的去除、环化、纯化。 RNA环化后,非环化的RNA需要用核糖核酸酶R(RNase R)消化以富集circRNA。

Yeasen 拥有双向分子酶合理设计及定向进化平台,以及专门针对GMP级别产品设计的分子酶生产基地开发生产纯度高、消化活性强的GMP级RNase R产品,为新型RNA疫苗/药物的上市提供支持。

图1:环状RNA生产过程图

(来源:Front Immunol 2023 年 1 月 12 日:13:1091797。doi:10.3389/fimmu.2022.1091797。eCollection 2022。)

RNase R (核糖核酸酶 R, RNase R) 是一种 Mg2+ 依赖性的 3'→5' 外切核糖核酸酶,来源于 大肠杆菌它可以消化所有线性RNA,但难以消化circRNA、Lasso RNA、 或3'端突出的核苷酸少于7个的双链RNA分子。 RNase R通常用于去除线性RNA分子,达到富集环状RNA、套索RNA等非线性RNA的目的。

主要应用 区域 是:

  • 基因表达研究;
  • 可变剪接的研究;
  • 从生物样本中富集circRNA;
  • 识别内含子套索结构RNA;
  • 识别外显子环状RNA。

产品特性

  • 蛋白纯度(SDS-PAGE)≥95%;
  • 无外切酶残留;
  • 与竞争对手相比,该产品具有同等的线性RNA消化能力;
  • 与竞争对手相比,该产品对circRNA富集具有相似的效果。

性能演示

蛋白纯度(SDS-PAGE)≥95%

图2:蛋白质纯度测试: 从左到右,结果为同一产品浓度的不同体积(1 μL、2 μL、3 μL)。结果表明, Yeasen RNase R产物≥95%。

无外切酶残基

图3:核酸外切酶残留检测: 添加 20 U Yeasen 将0.5 μg λDNA-Hind III消化液加入RNase R中,37℃孵育4小时,然后进行琼脂糖凝胶电泳,结果显示DNA条带没有变化,说明DNA片段中没有残留的外切酶。 Yeasen RNase R 产品。

与进口品牌RNase R产品在消化线性RNA方面相当

图 4: Yeasen RNase R产品和进口厂家的RNase R产品消化线性RNA时: Yeasen 将RNase R产品和进口厂家A的RNase R产品分别加入到含有线性RNA底物的反应体系中,结果发现当RNase R产品加入量达到2~4 U时,RNA条带开始变弱甚至消失,说明RNase R对线性RNA分子有消化作用。此外,RNase R的消化能力 Yeasen RNase R产品与进口厂家A的RNase R产品对线性RNA分子的检测结果相当。

相当于A家进口品牌RNase R产品的circRNA富集效果

图5:circRNA的富集效果比较 Yeasen RNase R产品与进口厂家RNase R产品A:含circRNA底物的反应体系与 Yeasen 分别用进口厂家A的RNase R产品和纯化的RNA酶处理后, RNA条带的亮度无明显变化。 Yeasen公司的RNase R产品与进口厂家A的RNase R产品进行比较,表明circRNA能够耐受RNase R的消化。 上述结果证实了 Yeasen 产品与进口厂家的RNase R产品均可有效用于circRNA的富集。

客户反馈

宜生 RNase R对线性RNA的切割效果相较于其他品牌有更好的表现。

图6:RNase R消化对线性mRNA分子的影响比较 Yeasen 产品和制造商A和B:反应是通过添加 Yeasen 将RNase R产品与A、B厂商的RNase R产品分别加入到含有1 μg线性mRNA底物的反应体系中,结果表明 Yeasen RNase R产品对线性RNA的消化效率与厂家A和B的RNase R产品相比有更好的表现。

产品信息

产品名称

产品代码

产品规格

RNase R GMP 级(20 U/μL)

14615ES

500U/5000U/20KU/200KU

10×RNase R反应缓冲液GMP级

14616ES

500 微升/1 毫升/5 毫升/10 毫升/100 毫升

参考

1.曲丽,易志,沉Y,等。针对 SARS-CoV-2 和新出现变种的环状 RNA 疫苗。 Cell. 2022;185(10):1728-1744.e16. doi:10.1016/j.cell.2022.03.044

2.Chen L, Wang C, Sun H, et al. 用于发现和分析circRNA的生物信息学工具箱。 简报生物信息。2021;22(2):1706-1728。doi:10.1093/bib/bbaa001

询问