鼠 RNase 抑制劑-避免 RNase 污染

在進行涉及 RNA 的實驗時,RNase 污染始終是一個令人擔憂的問題。即使採用最乾淨的技術,也可能發生 RNase 污染,並且可能對下游應用的資料產生深遠影響。高品質、完整的 RNA 對於敏感應用的成功至關重要。那麼,有沒有試劑可以防止RNA降解呢?Yeasen,鼠 RNase 抑制劑 Yeasen 是解決該問題的最佳選擇。

1. 如何防止RNA降解?

2. 什麼是RNase抑制劑?

3. RNase抑制劑有什麼作用?

4. 鼠 RNase 抑制劑有哪些特性?

5. 相關產品及業績

6. 相關產品

7. 常見問題

1. 如何防止RNA降解?

RNase在核酸代謝中起著重要作用,幾乎存在於任何類型的原核生物和真核生物中。淚液、唾液、汗水等體液中會分泌RNase,以防禦微生物的入侵,皮膚碎屑中也存在RNase。然而大多數環境中RNase的主要來源是微生物,即細菌、真菌。 RNase極難失活,且穩定性高,具有耐熱、耐酸、耐鹼性。熱變性後能很快恢復原有結構。 RNase通常非常活躍,廣泛分佈於真核生物和原核生物的細胞和組織中。樣本中的RNA只需極少量的RNase污染就能完全降解。研究中 RNase 污染可能來自內部和外部來源。細胞中的RNase主要是內源性污染源,外源性污染源包括實驗用品、實驗室環境、以及實驗者本身。 RNases,尤其是 RNase A 家族的成員,是小而緊湊的蛋白質,含有一些半胱氨酸殘基,能夠形成許多分子內二硫鍵。恢復至室溫後,在沒有變性劑的情況下,變性的RNase會恢復其天然結構和部分功能。因此,經過反覆的凍融循環,甚至高壓滅菌後,RNases 仍然保留相當高的活性。這些酶的穩定性使得它們能夠抵抗許多淨化方法,這些方法通常需要採取激進的化學方法來消除表面和溶液中的 RNases。

為了避免脆弱的 RNA 降解,處理 RNA 時必須採取特別預防措施。為了控制外源性RNase,操作者在實驗過程中需戴手套,並在接觸皮膚、門把手、普通物品表面後更換手套。且操作者需使用專門針對RNA操作的移液槍,並使用RNase-free的壁吸頭、離心管、化合物、試劑。遠離或遮住通風孔和打開的窗戶,並使用人跡罕至的區域作為無 RNase 區域。並且在RNA萃取和分析過程中,請勿進行其他可能導致RNase污染的實驗。
抑制內源性RNase活性的方法首先是保存樣本。組織取樣後,不應直接萃取 RNA。而應及時用液態氮迅速凍存於-80℃環境中,並儘快進行實驗,以最大程度減少RNA的降解。在細胞裂解液中添加RNase抑制劑,同時破碎細胞並滅活RNase,最大限度地降低細胞破碎過程中釋放的RNase活性。 所有試劑和設備在使用前都必須經過特殊處理以滅活 RNases。

此外,可以使用RNA抑制劑來抑制RNase活性,防止RNase降解RNA。 RNA 抑制劑有以下幾種類型:

  • 二乙基焦碳酸(DEPC):它是一種強效但不完全的RNase抑制劑。它透過與RNase活性基因組中的組胺酸的咪唑環結合,使蛋白質變性,從而抑制酵素的活性。
  • 異硫氰酸胍:目前被認為是最有效的RNase抑制劑,它在裂解組織的同時,也能使RNase失活,能破壞細胞結構,使核酸與核蛋白解離,同時對RNase也有一定的變性作用。
  • 釩核糖核苷複合物:釩氧離子與核苷形成的複合物,能與RNase結合形成過渡類似物,幾乎完全抑制RNase的活性。
  • RNase蛋白抑制劑(RNasin):RNasin是從大鼠肝臟或人類胚盤中提取的一種酸性糖蛋白,是一種非競爭性的RNase抑制劑,能與多種RNase結合,使其失去活性。
  • 其他:SDS、尿素、矽藻土等對RNase也有一定的抑製作用。

2. 什麼是RNase抑制劑?

RNase抑制劑是一類能夠抑制RNase活性的物質。常見的RNase抑制劑包括二乙基焦碳酸PC(DEPC)、異硫氰酸胍、核糖核苷釩複合物(RVC)、RNase蛋白抑制劑(RNasin)。其中DEPC和異硫氰酸胍具有一定的毒性,RVC對PCR聚合酶有抑製作用,不利於後續實驗。 RNasin無毒,是一種非競爭性的RNase抑制劑,能與多種RNase結合,使其失去活性。

3. RNase抑制劑有什麼作用?

RNase抑制劑通常用作RNA酶操作中的預防措施,以抑制和控制此類污染物。 RNasin是從大鼠肝臟或人類胚盤中提取的一種酸性糖蛋白,它可以非共價方式與RNase特異性結合,形成複合物,導致RNase失活,從而保護RNA的完整性。目前,RNase抑制劑有助於防止cDNA合成、RT-PCR、體外轉錄/翻譯反應或RNA純化等應用中的RNA降解。

4. 鼠 RNase 抑制劑有哪些特性?

重組鼠RNase抑制劑不含有人源RNase抑制劑中所含的2個氧化敏感的半胱胺酸。因此,鼠RNase抑制劑具有較高的抗氧化活性,且對於低DTT實驗更為穩定。此外,鼠 RNase 抑制劑 Yeasen 具有以下特點:
1)全方位RNase抑制:鼠RNase抑制劑 Yeasen 特異性抑制RNase A、RNase B、RNase C等。
2)反應條件多樣:RNase抑制劑在pH 5.0-9.0、25℃-55℃下有活性,適用於耐熱逆轉錄酶。
3) 可進行多個下游實驗:當 RNase 抑制劑與 Taq DNA 聚合酶、AMV 或 M-MuLV 逆轉錄酶或噬菌體 RNA 聚合酶(SP6、T7 或 T3)一起使用時,未觀察到聚合酶活性的抑制。
4)量產商品:單筆製造能力20億U,確保產品同質化、供應穩定性、時效性,有利成本管理。
5)批次間一致性:成熟的蛋白質表現及純化平台,透過ISO13485品質管理體系,依品質需求進行品管檢測,確保產品批次間穩定性。

5. 相關產品及業績

A. RNase抑制劑阻斷RNase活性

1μg HEK細胞總RNA,1μL RNase抑制劑可有效抑制5ng RNase。

Inhibitory effect of Murine RNase Inhibitor.

圖1. 鼠RNase抑制劑的抑制效果。

B. RNase Inhibitor在qPCR檢測中超越國外產品

抑製作用 Yeasen 在相同的實驗環境下,採用 qPCR 技術測定了 R* Company 小鼠來源的 RNase 抑制劑 (MRI) 的含量,其中 RNase 抑制劑 Yeasen 鼠源有效抑制了系統中的RNase A。抑制的效果優於競爭對手。

圖 2. R* MRI RNase 抑制試驗

註:圖中曲線由左至右分別為:陽性對照(僅RNA,無RNase和MRI)、40 U MRI、30 U MRI、20 U MRI、10 U MRI、和陰性對照(RNA+RNase,無MRI)。

Yeasen MRI RNase inhibition test

圖 3. Yeasen MRI RNase 抑制試驗

註:圖中曲線由左至右分別為:陽性對照(僅RNA,無RNase和MRI)、80 U MRI、60 U MRI、40 U MRI、30 U MRI、20 U MRI、10 U MRI、陰性對照(RNA+RNase,無MRI)。

The CT of RT-qPCR results of Yeasen MRI and R* MRI

圖 4. RT-qPCR 結果的 CT Yeasen MRI 和 R* MRI

6. 相關產品

相關產品 Yeasen 可以提供如表1所示:

表 1.產品列表

產品名稱

庫存單位

規格

小鼠 RNase 抑制劑 (40 U/µL)

10603ES05

2 庫

10603ES10

10 庫

10603ES20

20 庫

10603ES60

100 庫

10603ES94

20,000 庫拉索

小鼠 RNase 抑制劑 (200 U/μL) (查詢

10610ES03

1 毫升

10610ES50

50 毫升

10610ES76

500 毫升

小鼠 RNase 抑制劑(200 U/µL,不含甘油)

10703ES05

2 庫

10703ES10

10 庫

10703ES60

100 庫

10703ES70

200 庫

10703ES80

1,000 庫拉索

7. 常見問題

Q1:Murine RNase抑制劑裡會有RNase嗎?
答:每個試劑都會檢測RNase活性,確保Murine RNase抑制劑不會帶來RNase污染。
Q2:鼠RNase抑制劑會對下游PCR實驗產生影響嗎?
答:不會有什麼影響。每批鼠 RNase 抑制劑經過品質檢測均無基因組污染,可用於 RT-PCR 和 RT-qPCR 研究。
Q3:Murine RNase抑制劑會失去活性嗎?
答:抑制劑在65°C以上會失活,劇烈攪拌也會導致失活。
Q4: 使用Murine RNase抑制劑配製反應系統時應注意事項為何?
答:在製備體系時,可以先加入RNase抑制劑,再加入其他可能引入RNase污染源的成分。
Q5:鼠 RNase 抑制劑是否具有內切酶和外切酶活性?
答:不具有內切酶和外切酶活性,有助於提高產品產量。

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