全轉錄組研究

【全轉錄組定序-非編碼RNA與mRNA的標靶調控及交互作用關係研究】

全轉錄組高通量定序採用核醣體耗竭的鏈特異性文庫建構方法及小片段富集篩選文庫建構方法,可實現編碼RNA及非編碼RNA的文庫建構、定序、資訊分析、聯合分析及ceRNA等,因此 這樣就可以 獲得 快速、全面、準確地獲取特定生物過程(如發育、疾病等)相關的整個RNA轉錄本資料資訊。透過資料分析,生物調控機制可以研究拓展至「網絡化、多層次」結合的三維模型,有助於全面解釋生物現象。

全轉錄組定序有兩種方式,一種是LncRNA-Seq+Small RNA,另一種是LncRNA-Seq+Small RNA+CircRNA,可以獲得更全面的CircRNA資訊。

1.全轉錄組定序,包含兩個文庫:LncRNA-Seq + Small RNA

2.使用三個文庫進行全轉錄組定序:LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA

全轉錄組原料解決方案

分類

動物類別

植物類別

細菌和真菌類別

樣品類型

動物組織/細胞

細胞

全血

植物組織

真菌組織

培養細菌和真菌

RNA萃取

磁珠法:18605/18607/18606;柱法:19221/19211;

Trizol 方法:10606/19202

磁珠法:18600/18604;列方法:19231

柱法:19241;

Trizol方法:19201

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

柱法:19301(真菌需加溶菌酶 10403)

miRNA萃取

列方法:19331

列方法:19331

列方法:19332

列方法:19331

miRNA文庫建構

值得期待

rRNA去除

核糖核酸酶 H酶去除:12257; 3分鐘快速移除:12258(人源移除);磁珠法去除:12266(哺乳類通用型)/12267鳥類通用型/12268家雞/12269斑馬魚/12270果蠅/12275牡蠣/12278渦蟲/122855/12286金絲桃網蜘蛛/122898渦蟲/12285年蜜蜂/12286金絲桃網蜘蛛/12289989707897897897/1289897/12899897/12899899

核糖核酸酶 H酶去除:12257; 3分鐘快速去除:12258(人體去除,適合病原體)

核糖核酸酶 H酶去除,包括珠蛋白去除:12257 + 12806;核糖核酸酶H 酵素法去除珠蛋白:13572; 3分鐘快速清除:12258 + 12260

核糖核酸酶 H酶去除:12254;磁珠法去除:12262被子植物

磁珠法去除:12271真菌通用型

磁珠法去除:12264細菌通用型/12265原核通用型

圖書館建設

非預混RNA文庫建構試劑盒:12308雙模式RNA文庫建構試劑盒(相容Illumina、MGI);

預混合RNA文庫建構試劑盒:12310雙模式RNA文庫建構試劑盒(相容Illumina和MGI)/12340(不含放線菌素D、dUTP)/12341(不含放線菌素D、dTTP)

LncRNA研究

長鏈非編碼RNA(LncRNA)是一類具有獨特調控功能的非編碼RNA,近年來受到廣泛關注。 LncRNA長度大於200nt,不編碼蛋白質,物種間保守性較差。其序列結構有些與mRNA相似(含有polyA尾部和可變剪接),有些則不具備這些特徵。目前,LncRNA的產生和功能機制尚未完全清楚,然而, 許多具有重要生物學功能(如癌症發生、X染色體沉默以及與其他調控因子形成複雜的調控網絡)的LncRNA被發現。

LncRNA定序技術路線

LncRNA定序原料解決方案

分類

動物類別

植物

類別

細菌和真菌類別

樣品類型

動物組織/細胞

細胞

全血

植物組織

真菌組織

培養細菌和真菌

RNA萃取

磁珠法:18605/18607/18606;柱法:19221/19211; Trizol 方法:10606/19202

磁珠法:18600/18604;列方法:19231

柱法:19241; Trizol方法:19201

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

柱法:19301(真菌需加溶壁酶10403)

rRNA去除

核糖核酸酶H 酵素去除:12257; 3分鐘快速移除:12258(人源移除);磁珠法去除:12266(哺乳類通用型)/12267鳥類通用型/12268家雞/12269斑馬魚/12270果蠅/12275牡蠣/12278渦蟲/122855/12286金絲桃網蜘蛛/122898渦蟲/12285年蜜蜂/12286金絲桃網蜘蛛/12289989707897897897/1289897/12899897/12899899

核糖核酸酶H 酵素去除:12257; 3分鐘快速去除:12258(人體去除,適合病原體)

核糖核酸酶H 酵素法去除,包括珠蛋白去除:12257 + 12806;核糖核酸酶H 酵素法去除珠蛋白:13572; 3分鐘快速清除:12258 + 12260

核糖核酸酶H 酵素去除:12254;磁珠法去除:12262被子植物

磁珠法去除:12271真菌通用型

磁珠法去除:12264細菌通用型/12265原核通用型

圖書館建設

非預混RNA文庫建構試劑盒:12308雙模式RNA文庫建構試劑盒(相容Illumina、MGI);

預混合RNA文庫建構試劑盒:12310雙模式RNA文庫建構試劑盒(相容Illumina和MGI)/12340(不含放線菌素D、dUTP)

真核轉錄組研究

真核轉錄組研究利用RNA-seq技術取得特定細胞在某一功能狀態下可轉錄的總mRNA。然後對下載的原始資料進行拼接組裝,統計基因表現水平,並進行差異分析和功能富集分析。它不僅可以獲得物種的大部分基因訊息,還可以在整體層面上研究基因表現差異、功能路徑變化,揭示特定生物過程的分子機制。

真核生物轉錄組定序技術路線

真核轉錄組定序原料解決方案

分類

動物類別

植物類別

真菌種類

樣品類型

動物組織/細胞

細胞

全血

植物組織

真菌組織

培養真菌

RNA萃取

磁珠法:18605/18607/18606;柱法:19221/19211; Trizol 方法:10606/19202

磁珠法:18600/18604;列方法:19231

柱法:19241; Trizol方法:19201

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

柱法:19301(添加溶菌酶10403)

mRNA捕獲

12629 mRNA 分離主試劑盒

12629 mRNA 分離主試劑盒

12629 mRNA 分離主試劑盒

12629 mRNA 分離主試劑盒

12629 mRNA 分離主試劑盒

12629 mRNA 分離主試劑盒

圖書館建設

非預混 RNA 文庫試劑盒: 12308 雙模式 RNA 文庫試劑盒(相容於 Illumina 和 MGI)

具有 mRNA 捕獲功能的非預混 RNA 文庫試劑盒:12309 雙模式 RNA 文庫試劑盒(相容於 Illumina 和 MGI)

預混合RNA文庫試劑盒:12310雙模式RNA文庫試劑盒(相容Illumina和MGI)/12340(不含放線菌素D、dUTP)

circRNA 研究

【circRNA定序-研究circRNA的差異表現如何影響生物過程】

環狀RNA(circRNA)是一種特殊類型的非編碼RNA。利用定序平台進行定序,針對有參考基因組的樣本進行circRNA的精準鑑定與源基因分析。 circRNA定序在醫學和農業研究領域的應用越來越廣泛。基於高通量定序,依托主流資料庫及circRNA鑑定軟體,對專案物種的circRNA資訊進行分析,深入探討circRNA在轉錄調控上的重要角色。

circRNA研究原料解決方案

分類

動物類別

植物類別

細菌和真菌類別

樣品類型

動物組織/細胞

細胞

全血

植物組織

真菌組織

培養細菌和真菌

RNA萃取

磁珠法:18605/18607/18606;柱法:19221/19211; Trizol 方法:10606/19202

磁珠法:18600/18604;列方法:19231

柱法:19241; Trizol方法:19201

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

柱法:19301(真菌需加溶菌酶10403)

rRNA去除

核糖核酸酶H 酵素去除:12257; 3分鐘快速移除:12258(人源移除);磁珠法去除:12266(哺乳類通用型)/12267鳥類通用型/12268家雞/12269斑馬魚/12270果蠅/12275牡蠣/12278渦蟲/122855/12286金絲桃網蜘蛛/122898渦蟲/12285年蜜蜂/12286金絲桃網蜘蛛/12289989707897897897/1289897/12899897/12899899

核糖核酸酶H 酵素去除:12257; 3分鐘快速去除:12258(人體去除,適合病原體)

核糖核酸酶H 酵素法去除,包括珠蛋白去除:12257 + 12806;核糖核酸酶H 酵素法去除珠蛋白:13572; 3分鐘快速清除:12258 + 12260

核糖核酸酶H 酵素去除:12254;磁珠法去除:12262被子植物

磁珠法去除:12271真菌通用型

磁珠法去除:12264細菌通用型/12265原核通用型

線性 RNA 消化

14606 RNase R 去除線性 RNA 分子

14606 RNase R 去除線性 RNA 分子

14606 RNase R 去除線性 RNA 分子

14606 RNase R 去除線性 RNA 分子

14606 RNase R 去除線性 RNA 分子

14606 RNase R 去除線性 RNA 分子

圖書館建設

非預混RNA文庫建構試劑盒:12308雙模式RNA文庫建構試劑盒(相容Illumina、MGI);

預混合RNA文庫建構試劑盒:12310雙模式RNA文庫建構試劑盒(相容Illumina和MGI)/12340(不含放線菌素D、dUTP)

宏轉錄組

【宏轉錄組-捕捉微生態微環境中活性微生物的動態變化】

宏轉錄組定序:在整體層面研究特定環境下全部基因組的轉錄調控規律。以微生態微環境中所有RNA為研究對象,結合高通量定序,在轉錄層級研究複雜微生物群落的變化,挖掘發揮作用的活性基因。

宏轉錄組研究原料解決方案

樣品類型

培養細菌和真菌

臨床樣本

RNA萃取

柱法:19301(真菌需加溶壁酶10403)

柱法:19321(病毒DNA/RNA萃取);磁珠法:18521(病毒DNA/RNA萃取); 18306(病原體DNA/RNA萃取)

rRNA去除

3分鐘快速清除:12258(人源清除)

3分鐘快速清除:12258(人源清除)

圖書館建設

方案1.總RNA文庫建構:12308ES雙模RNA文庫建構試劑盒(相容Illumina和MGI);方案2. cDNA酶切文庫建構:13488ES cDNA合成模組+12316ES快速酶切文庫建構試劑盒

方案1.總RNA文庫建構:12308ES雙模RNA文庫建構試劑盒(相容Illumina和MGI);選項 2。cDNA酶切文庫建構:13488ES cDNA合成模組+12316ES快速酶切文庫建構試劑盒

產品推薦

產品名稱

目錄編號

規格

希夫NGS 商標 EvoMax RNA文庫製備試劑盒(dUTP)

12340ES24/96

24噸/ 96噸

希夫NGS商標 EvoMax RNA 文庫製備試劑盒 (dNTP)

12341ES24/96

24噸/ 96噸

希夫NGS商標 Ultima 雙模式RNA文庫製備試劑盒(Illumina和MGI)

12308ES24/96

24噸/ 96噸

希夫NGS商標 Ultima 雙模式 RNA 文庫製備試劑盒(預混版)

12310ES24/96

24噸/ 96噸

希夫NGS商標 mRNA 分離主試劑盒 V2

12629ES24/96

24噸/ 96噸

希夫NGS商標 MaxUp 人類 rRNA 耗竭試劑盒 (rRNA 和 ITS/ETS)

12257ES24/96

24噸/ 96噸

希夫NGS商標 MaxUp rRNA 耗竭試劑盒(植物)

12254ES24/96

24噸/ 96噸

希夫NGS商標 一步法rRNA去除試劑盒(人類,100-1,000 ng)

12258ES24/96

24噸/ 96噸

希夫NGS商標 MagSP rRNA 去除試劑盒(細菌(G- 和 G+))帶純化珠

12264ES24/96

24噸/ 96噸

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