1、背景
rRNA在生物體總RNA中佔很高的比例，但所能提供的有效資訊卻很少。這些RNA會產生大量無效數據，對於獲取生物資訊的研究意義不大。同時，rRNA比例較高，使得mRNA在轉錄本中相對豐度較低，進而影響低豐度轉錄本的檢測。因此，在常規RNA定序（RNA-SEQ）中，有效去除rRNA對於實現經濟高效的RNA定序至關重要。
2、產品描述
（1）MaxUp系列，rRNA去除試劑盒
MaxUp系列rRNA去除試劑是基於RNase H消化，從樣本的總RNA中移除核醣體RNA（rRNA），以保留信使RNA（mRNA）和其他非編碼RNA。樣品種類豐富，起始量廣，整個過程耗時小於2h，人工操作時間小於10min。同時，無論是對於常規樣本還是低品質樣本（如FFPE），都可以高效去除rRNA，顯著提高測序數據中的有效數據信息，實現RNA樣本的經濟高效測序。
（2）MaxUp系列rRNA去除工藝
目前RNase消除是rRNA去除的主要方法，特別是對於一些RNA降解樣本（如FFPE樣本），RNase消除更能反映其優勢。
圖1. MaxUp系列rRNA去除原理示意圖
三、產品性能展示
（1）植物樣本
利用RNase H消化去除植物總RNA中的核醣體RNA，以qPCR比較去除前後rRNA基因和mRNA基因表現的變化。結果顯示該產品能有效去除植物中的rRNA。
圖. 2. 取1μg擬南芥葉片RNA進行rRNA移除，qPCR比較移除前後rRNA基因及mRNA基因表現變化
（2）人/大鼠/小鼠樣本
利用RNase H消化去除植物總RNA中的核醣體RNA，建立文庫並送去定序。數據分析顯示該產品可以有效去除此類樣本中的rRNA。
圖3. 取人、小鼠、大鼠1μg總RNA作為樣品，去除rRNA後定序分析rRNA殘留量
（3）低品質RNA樣本（如FFPE RNA）
低品質樣本中往往會存在較大比例的ITS/ETS序列（參考下圖中FFPE RNA：DV200=20%），而這部分序列也會產生大量的無效數據，因此透過在低品質樣本中添加ITS/ETS探針，可以進一步有效富集目標序列。本產品除了常規的45S Pre-rRNA探針外，還增加了針對Human 45S ITS/ETS區域的探針設計，保證低品質樣本中的rRNA去除更加高效，且不影響常規樣本中rRNA去除效果。
圖 4.加入 ITS/ETS 探針前後 rRNA 殘基與 ITS/ETS 殘基的比較
4.訂購信息
| 電視類型 | 磷產品名稱 | 產品代碼 | 產品規格 |
| rRNA去除 成套工具 | 12257ES08/24/96 | 96年8月24日 | |
| 12254ES08/24/96 | 8/24T/96T |