لقد كان تلوث الأحماض النووية عقبة كبيرة في طريق تقدم تقنيات التشخيص الجزيئي. ومع تطوير أساليب تشخيص أكثر حساسية، تزايد الطلب على نقاء أعلى للإنزيمات والبروتينات. ومن التحديات الرئيسية في إنتاج البروتين إزالة تلوث الأحماض النووية بشكل فعال. إن وجود الأحماض النووية يمكن أن يعرض وظيفة البروتين ونشاطه للخطر، مما قد يؤدي إلى مشاكل مثل الارتباط غير المحدد، أو تثبيط نشاط الإنزيم، أو زيادة الإشارات الخلفية، مما يؤثر في النهاية على دقة نتائج التشخيص.
ونتيجة لذلك، فإن تطوير عمليات فعالة لإزالة الأحماض النووية أثناء إنتاج البروتين يعد أمرا بالغ الأهمية وأساسيا.
بعد سنوات من البحث التكنولوجي، طورت شركة Yeasen Biotechnology طريقة متكاملة مغلقة لإزالة الأحماض النووية بكفاءة. تعمل هذه العملية على تحسين نفاذية الخلايا، وتتضمن خطوات تنقية عمود تبادل الأنيونات والكاتيونات، والترشيح الدقيق، والترشيح الفائق، وتتضمن مراقبة كاملة للعملية للمخلفات. يضمن هذا النهج المتكامل إزالة التلوث بالأحماض النووية إلى أقصى حد، مما يتيح تنقية الإنزيمات الجزيئية ذات بقايا الحمض النووي المنخفضة للغاية.

استراتيجيات شاملة لمنع تلوث الحمض النووي في إنتاج البروتين
يعد تلوث الحمض النووي تحديًا شاملاً في إنتاج المنتجات البيولوجية، مما يؤثر بشكل كبير على نقائها وجودتها ودقة النتائج التجريبية. يمكن أن يؤدي وجود الحمض النووي في مستحضرات البروتين إلى استنتاجات تجريبية غير دقيقة، وتشويه البيانات وزيادة احتمالية ظهور نتائج إيجابية كاذبة. بالنسبة للباحثين والمصنعين المشاركين في إنتاج البروتين، فإن تنفيذ استراتيجيات فعالة لمنع وتخفيف تلوث الحمض النووي أمر ضروري. تستكشف هذه المقالة كيفية تجنب تلوث الحمض النووي، وخاصة التلوث المحمول جوًا، وتحدد طرق إزالة الحمض النووي بفعالية من عينات البروتين.
أنا. منع تلوث الحمض النووي المحمول جوًا
تظل تلوثات الحمض النووي المحمولة جوًا مصدر قلق بالغ الأهمية في إنتاج البروتين، وخاصة في البيئات التي يكون فيها التحكم في الميكروبات والجسيمات أمرًا ضروريًا. لتقليل مخاطر تلوث الحمض النووي المحمولة جوًا، يجب استخدام الاستراتيجيات التالية:
1. إنشاء بيئة غرفة نظيفة إن إجراء إنتاج البروتين في غرفة نظيفة يوفر البيئة الخاضعة للرقابة اللازمة لتقليل الجسيمات والميكروبات المحمولة جوًا والتي قد تؤدي إلى تلوث الحمض النووي. يجب أن تلبي الغرف النظيفة معايير نظافة محددة لضمان جو خالٍ من الملوثات. | 2. تنفيذ أنظمة الترشيح HEPA تعتبر أنظمة تنقية الهواء المجهزة بمرشحات HEPA ضرورية لاحتجاز الجسيمات المحمولة جوًا، بما في ذلك الغبار والمواد الملوثة الميكروبية وشظايا الحمض النووي. تساعد هذه المرشحات في الحفاظ على الهواء النظيف في جميع أنحاء منشأة الإنتاج. |
3. الحفاظ على بيئة الضغط الإيجابي تمنع بيئات الضغط الإيجابي دخول الهواء الملوث من خارج المساحة الخاضعة للرقابة. ويضمن الحفاظ على ضغط هواء أعلى داخل منطقة الإنتاج مقارنة بالبيئات الخارجية أن أي تسرب يؤدي إلى هروب الهواء وليس دخوله. | 4. بروتوكولات التنظيف والتطهير الروتينية إن التنظيف المنتظم لمنطقة الإنتاج باستخدام المطهرات المناسبة - مثل النوكليازات أو المنظفات القائمة على الكلور - يمكن أن يؤدي إلى تحلل الحمض النووي المحمول جواً، مما يقلل من خطر التلوث. وهذا مهم بشكل خاص في المناطق التي يتم لمسها بشكل متكرر وعلى الأسطح القريبة من معدات إنتاج البروتين. |
5. الحد من حركة الموظفين يؤدي تقليل حركة الأفراد داخل بيئات الغرف النظيفة إلى تقليل احتمالية إدخال الملوثات من خلال التفاعل البشري. يجب على الأفراد المعينين اتباع بروتوكولات صارمة فيما يتعلق بالدخول والخروج للسيطرة على التعرض. | 6. مراقبة جودة الهواء إن مراقبة جودة الهواء داخل الغرفة النظيفة، بما في ذلك عدد الميكروبات ومستويات الجسيمات، أمر ضروري لضمان الامتثال المستمر لمعايير الإنتاج. يمكن استخدام أجهزة أخذ عينات الهواء وعدادات الجسيمات لتقييم نظافة البيئة. |
7. اعتماد المواد ذات الاستخدام الواحد يؤدي استخدام المواد الاستهلاكية ذات الاستخدام الواحد لإنتاج البروتين إلى تقليل خطر التلوث المتبادل بشكل كبير، وهو أمر شائع مع المعدات القابلة لإعادة الاستخدام. | 8. عمليات الإنتاج المغلقة تعمل الأنظمة المغلقة، مثل المفاعلات الحيوية أو الغرف المغلقة، على تقليل التعرض للبيئة المفتوحة. وهذا يقلل من خطر تلوث الحمض النووي من الهواء، وخاصة أثناء المراحل الحرجة مثل التخمير وتنقية البروتين. |
9. تجنب توليد الهباء الجوي يمكن أن يؤدي تكوين الهباء الجوي أثناء إنتاج البروتين إلى تسهيل انتشار الحمض النووي المحمول جوًا. يمكن أن تقلل التدابير الاحترازية، مثل التعامل الدقيق ونقل السوائل دون تحريك، من تكوين الهباء الجوي. | 10. استخدام النوكليازات إن معالجة الأسطح والمعدات بالنوكليازات قبل الاستخدام وبعده يمكن أن تؤدي إلى تحلل الحمض النووي المتبقي الذي قد يتبقى بعد عمليات مثل تحلل الخلايا أو الترشيح. |
11. تنفيذ العزل البيئي بالنسبة للعمليات عالية المخاطر مثل تنقية البروتين وصياغته، فإن استخدام العوازل أو صناديق القفازات يوفر طبقة إضافية من الحماية، ويعزل العملية عن الملوثات المحمولة جواً. | 12. المعدات والأدوات المخصصة إن استخدام المعدات المخصصة لإنتاج البروتين حصريًا يمنع التلوث المتبادل من الأدوات والأجهزة التي ربما تعرضت للحمض النووي أو الأحماض النووية في عمليات أخرى. |
13. خطة الاستجابة لحالات التلوث الطارئة يجب وضع خطة استجابة فعّالة لإدارة التلوث العرضي للحمض النووي. ويجب أن يتضمن البروتوكول خطوات سريعة لتحديد التلوث واحتوائه وإصلاحه لمنع انتشاره والحد من تأثير التلوث. | 14. تدريب الموظفين ويضمن التدريب المستمر للموظفين حول مخاطر تلوث الحمض النووي وأهمية تقنيات التعامل السليمة تنفيذ أفضل الممارسات والالتزام ببروتوكولات مكافحة التلوث. |

ثانيا. إزالة تلوث الحمض النووي من البروتينات
أثناء تنقية البروتين، يعد إزالة أي تلوث متبقي للحمض النووي أمرًا بالغ الأهمية للحفاظ على جودة البروتين. تُستخدم العديد من التقنيات بشكل شائع لإزالة الحمض النووي من عينات البروتين:
1. طرق تحلل الخلايا الخفيفة تسمح مخازن التحلل غير المدمرة بإطلاق البروتينات مع تقليل تكسر الحمض النووي. يتجنب هذا النهج التدمير العشوائي للحمض النووي، مما يقلل من احتمالية تلويث عينة البروتين. | 2. ظروف التحلل الأمثل إن تعديل العوامل مثل الرقم الهيدروجيني والقوة الأيونية أثناء تحلل الخلايا يمكن أن يمنع ذوبان الحمض النووي، وبالتالي تقليل كمية الحمض النووي الملوث في العينة الناتجة. |
3. تثبيط النوكلياز إن استخدام مثبطات البروتيناز، مثل فينيل ميثيل سلفونيل فلوريد (PMSF)، يمكن أن يمنع نشاط النوكليازات داخل الخلايا، مما يسمح بتحلل الحمض النووي بشكل أكثر تحكمًا وانتقائية أثناء التحلل. | 4. صدمة تناضحية الصدمة الأسموزي هي طريقة لطيفة لتحلل الخلايا عن طريق وضعها في محلول به فرق مفاجئ في الضغط الأسموزي. يمكن أن يساعد هذا في تقليل إطلاق الحمض النووي، مما يؤدي إلى تحضيرات بروتينية أنظف. |
5. التحلل الأنزيمي يعد استخدام الإنزيمات مثل الليزوزيم لتحلل جدران الخلايا البكتيرية طريقة خاضعة للرقابة للتحلل تستهدف غشاء الخلية فقط، مما يقلل من خطر تلوث الحمض النووي أثناء إطلاق محتويات الخلية. | 6. العلاج بعد التحلل بمجرد تحلل الخلايا، يمكن أن يساعد التبريد الفوري للعينة على تقليل نشاط النوكلياز، والذي من شأنه أن يؤدي إلى المزيد من تدهور الحمض النووي في المحلول. |

ثالثا. طرق متقدمة لإزالة الأحماض النووية
يمكن أن يؤدي استخدام الكروماتوغرافيا أو الأساليب القائمة على التقارب في المعالجة اللاحقة إلى إزالة المزيد من ملوثات الحمض النووي من مستحضرات البروتين. تعد تقنية تبادل الأنيونات والكروماتوغرافيا التبادلية الكاتيونية تقنيتين راسختين لإزالة تلوث الحمض النووي من عينات البروتين. تعتمد كلتا الطريقتين على التفاعل بين الأحماض النووية والأسطح المشحونة لإزالة الحمض النووي بشكل انتقائي.
1. أعمدة تبادل الأنيونات تستخدم أعمدة تبادل الأنيونات مراحل ثابتة مشحونة إيجابيا لجذب وربط الأحماض النووية المشحونة سلبًا. من خلال ضبط تركيز ملح عازل الإيلوشن، يمكن إزالة الأحماض النووية بشكل انتقائي من مستحضر البروتين. | 2. أعمدة تبادل الكاتيون في ظروف معينة، يمكن أيضًا استخدام أعمدة تبادل الكاتيون لإزالة الأحماض النووية. من خلال زيادة تركيز الملح أو تعديل الرقم الهيدروجيني، يمكن إخراج الأحماض النووية بشكل تنافسي من العمود. |
3. الترشيح الفائق تستخدم عملية الترشيح الفائق الترشيح الغشائي الانتقائي لفصل البروتينات عن الأحماض النووية، مما يضمن إزالة الحمض النووي بشكل فعال أثناء خطوات التنقية. | 4. كروماتوغرافيا الترشيح الهلامي الترشيح الهلامي هو تقنية كروماتوغرافيا استبعادية الحجم تفصل الجزيئات بناءً على حجمها. يتم فصل الأحماض النووية، نظرًا لكبر حجمها مقارنة بالبروتينات، بشكل فعال، مما يترك عينات بروتينية نقية. |

رابعا. الحد من تلوث الحمض النووي من الأفراد
يلعب الموظفون دورًا مهمًا في احتمالية إدخال تلوث الحمض النووي في عمليات إنتاج البروتين. يمكن أن تساعد التدابير التالية في التخفيف من هذا الخطر:
1. التدريب الشامل للموظفين ينبغي لجميع الموظفين الخضوع لتدريب حول أهمية التحكم في تلوث الحمض النووي وأفضل الممارسات لمنع التلوث. | 2. معدات الحماية الشخصية يجب على الموظفين ارتداء معدات الحماية الشخصية المناسبة، مثل المعاطف المخبرية والقفازات والأقنعة والنظارات الواقية، لتقليل مخاطر تلوث الحمض النووي من الاتصال البشري. |
3. بروتوكولات نظافة اليدين يعد غسل اليدين بشكل متكرر واستخدام المطهرات التي تحتوي على الكحول أمرًا ضروريًا لتقليل انتقال الحمض النووي من اليدين إلى الأسطح والمعدات. | 4. تغييرات الملابس والأحذية يضمن تغيير الملابس والأحذية المخصصة للعمل عدم انتقال تلوث الحمض النووي من خارج منطقة الإنتاج. |
5. قواعد صارمة لسلوك العمل يجب على الموظفين الامتناع عن الأكل أو الشرب أو التحدث في منطقة إنتاج البروتين لمنع دخول الحمض النووي عن طريق اللعاب أو جزيئات الطعام أو القطرات. | 6. الرصد البيئي ينبغي إجراء مراقبة بيئية منتظمة، بما في ذلك فحوصات الهواء والسطح والمعدات، للتأكد من عدم وجود تلوث الحمض النووي في منطقة الإنتاج. |
خاتمة
ولضمان إنتاج بروتينات عالية الجودة وغير ملوثة، من الضروري اتباع نهج شامل للسيطرة على تلوث الحمض النووي.من خلال تبني ضوابط بيئية صارمة، واستخدام أساليب تنقية محسنة، والتركيز على تدريب الموظفين، يمكن تقليل المخاطر المرتبطة بتلوث الحمض النووي بشكل كبير. تعد هذه الممارسات ضرورية للحفاظ على سلامة وموثوقية منتجات البروتين في التطبيقات البحثية والصناعية، مما يساهم في نهاية المطاف في تقدم تطوير المنتجات البيولوجية.
المنتجات ذات الصلة
1. جليكوزيلاز اليوراسيل DNA UCF.ME (UDG/UNG)، قابل للتأثر بالحرارة
2. مثبط الريبونوكلياز الفأري UCF.ME
مزايا المنتج
- بقايا منخفضة للغاية من الحمض النووي الجينومي UCF.ME—E. coli <0.1 نسخة/ وحدة؛
- بقايا نوكلياز منخفضة - لا يوجد بقايا نوكلياز خارجي، أو إنزيم نخر، أو RNase؛
- قدرة هضم قوية - 0.05 وحدة/طن يمكنها هضم 105 نسخة/طن من منتجات dU-DNA؛
- قابلية حرارية جيدة - تعطيل كامل تحت أي ظرف من الظروف مثل 50 درجة مئوية لمدة 10 دقائق، أو 55 درجة مئوية لمدة 5 دقائق، أو 95 درجة مئوية لمدة 5 دقائق؛
- متوافق مع أنظمة تفاعل RT-qPCR - لا يؤثر على نظام الكشف حتى عند مستويات الإدخال العالية (نظام تفاعل 2U/20μL).
(1) نوكليازات متبقية منخفضة: لا يوجد نوكليازات خارجية متبقية، أو إنزيمات التكسير، أو RNases
الشكل 1. نتائج اختبار بقايا النوكلياز
(2) بقايا الحمض النووي الجينومي لـ E. coli < 0.1 نسخة / وحدة
الشكل 2. نتائج اختبار بقايا الحمض النووي الجينومي لبكتيريا الإشريكية القولونية
معلومات الطلب
قطة: | اسم | طلب |
14321 | بوليميراز الحمض النووي Hieff UNICON UCF. ME™ Advanced Hotstart Taq | تفاعل البوليميراز المتسلسل |
14608 | إنزيم النسخ العكسي Hifair UCF.ME™ V (200 وحدة/ميكرولتر) | تفاعل البوليميراز المتسلسل العكسي العكسي |
UCF.ME™ Uracil DNA Glycosylase(UDG/UNG)، قابل للتغير بالحرارة، 1 وحدة/ميكرولتر | تفاعل البوليميراز المتسلسل العكسي العكسي | |
جامعة وسط فلوريدا.مثبط الريبونوكلياز الفأري ME™ (40 وحدة/ميكرولتر) | تفاعل البوليميراز المتسلسل العكسي العكسي | |
طقم اختبار RT-qPCR من Hifair™ V2 Multiplex One Step (UDG Plus، GC enhancer plus) | تفاعل البوليميراز المتسلسل العكسي العكسي | |
مجموعة تركيب Hieff NGS™ ds-cDNA | م ن ج س | |
13501 | مجموعة تركيب Hieff NGS™ ds-cDNA (جهاز هضم gDNA بالإضافة إلى ذلك) | م ن ج س |
مجموعة أدوات تحضير مكتبة Hieff NGS™ OnePot Flash DNA | م ن ج س | |
13490 | مجموعة تحضير مكتبة الحمض النووي Hieff NGS™ OnePot ll لـ Illumina | م ن ج س |
12946 | 10x مجموعة تركيب الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين Hieff NGS™ 1st | tNGS لمسببات الأمراض |
مجموعة 4x Hieff™ Multiplex RT-PCR | tNGS لمسببات الأمراض | |
4x Hieff™ Multiplex PCR Master Mix | NGS لمسببات الأمراض | |
12977 | 4x Hieff™ Multiplex PCR Master Mix 2.0 | NGS لمسببات الأمراض |