لطالما شكّل تلوث الأحماض النووية عائقًا كبيرًا أمام تطوير تقنيات التشخيص الجزيئي. ومع تطور أساليب التشخيص الأكثر حساسية، ازداد الطلب على إنزيمات وبروتينات أكثر نقاءً. ومن التحديات الرئيسية في إنتاج البروتين إزالة تلوث الأحماض النووية بفعالية. إذ يمكن أن يُضعف وجود الأحماض النووية وظيفة البروتين ونشاطه، مما قد يؤدي إلى مشاكل مثل الارتباط غير النوعي، أو تثبيط نشاط الإنزيم، أو زيادة الإشارات الخلفية، مما يؤثر في النهاية على دقة نتائج التشخيص.

ونتيجة لذلك، فإن تطوير عمليات فعالة لإزالة الأحماض النووية أثناء إنتاج البروتين يعد أمرا بالغ الأهمية وأساسيا.

بعد سنوات من البحث التكنولوجي، Yeasen طورت التكنولوجيا الحيوية طريقةً متكاملةً مغلقةً لإزالة الأحماض النووية بكفاءة. تُحسّن هذه العملية نفاذية الخلايا، وتتضمن تنقيةً بعمود تبادل الأنيونات والكاتيونات، والترشيح الدقيق، والترشيح الفائق، وتشمل مراقبةً كاملةً للمخلفات. يضمن هذا النهج المتكامل أقصى إزالةٍ لتلوث الأحماض النووية، مما يُتيح تنقية الإنزيمات الجزيئية ذات بقايا الحمض النووي المنخفضة للغاية.

استراتيجيات شاملة لمنع تلوث الحمض النووي في إنتاج البروتين

يُعد تلوث الحمض النووي تحديًا شائعًا في إنتاج المنتجات البيولوجية، مما يؤثر بشكل كبير على نقائها وجودتها ودقة نتائج التجارب. قد يؤدي وجود الحمض النووي في مُستحضرات البروتين إلى استنتاجات تجريبية غير دقيقة، وتشويه البيانات، وزيادة احتمالية ظهور نتائج إيجابية خاطئة. يُعدّ تطبيق استراتيجيات فعالة لمنع تلوث الحمض النووي والحد منه أمرًا بالغ الأهمية للباحثين والمُصنّعين المشاركين في إنتاج البروتين. تستكشف هذه المقالة كيفية تجنب تلوث الحمض النووي، وخاصةً التلوث الجوي، وتُحدد طرقًا فعالة لإزالة الحمض النووي من عينات البروتين.


أنا. منع تلوث الحمض النووي المحمول جوًا

لا يزال تلوث الحمض النووي المحمول جوًا يُشكل مصدر قلق بالغ في إنتاج البروتين، لا سيما في البيئات التي تُعد فيها مكافحة الميكروبات والجسيمات أمرًا بالغ الأهمية. وللحد من خطر تلوث الحمض النووي المحمول جوًا، ينبغي اتباع الاستراتيجيات التالية:

1. إنشاء بيئة غرفة نظيفة

يوفر إنتاج البروتين في غرفة نظيفة البيئة المُتحكم بها اللازمة للحد من الجسيمات والميكروبات المحمولة جوًا والتي قد تُسبب تلوث الحمض النووي. يجب أن تستوفي الغرف النظيفة معايير نظافة محددة لضمان بيئة خالية من الملوثات.

2. تنفيذ أنظمة ترشيح الهواء عالي الكفاءة (HEPA)

أنظمة تنقية الهواء المجهزة بفلاتر HEPA ضرورية لاحتجاز الجسيمات العالقة في الهواء، بما في ذلك الغبار والملوثات الميكروبية وشظايا الحمض النووي. تساعد هذه الفلاتر في الحفاظ على هواء نقي في جميع أنحاء منشأة الإنتاج.

3. الحفاظ على بيئة الضغط الإيجابية

تمنع بيئات الضغط الإيجابي دخول الهواء الملوث من خارج المساحة المُتحكم بها. ويضمن الحفاظ على ضغط هواء أعلى داخل منطقة الإنتاج مقارنةً بالبيئات الخارجية أن أي تسرب يؤدي إلى تسرب الهواء، وليس دخوله.

4. بروتوكولات التنظيف والتطهير الروتينية

التنظيف المنتظم لمنطقة الإنتاج باستخدام المطهرات المناسبة - مثل النوكليازات أو المنظفات القائمة على الكلور - يُحلل الحمض النووي المحمول جوًا، مما يُقلل من خطر التلوث. وهذا مهم بشكل خاص في المناطق التي تُلامس بكثرة وعلى الأسطح القريبة من معدات إنتاج البروتين.

5. الحد من حركة الأفراد

إن تقليل حركة الأفراد داخل بيئات الغرف النظيفة يقلل من احتمالية دخول الملوثات عبر التفاعل البشري. يجب على الأفراد المعينين اتباع بروتوكولات صارمة فيما يتعلق بالدخول والخروج للسيطرة على التعرض.

6. مراقبة جودة الهواء

تُعد مراقبة جودة الهواء داخل الغرفة النظيفة، بما في ذلك تعداد الميكروبات ومستويات الجسيمات، أمرًا بالغ الأهمية لضمان الالتزام المستمر بمعايير الإنتاج. ويمكن استخدام أجهزة أخذ عينات الهواء وعدادات الجسيمات لتقييم نظافة البيئة.

7. اعتماد المواد ذات الاستخدام الواحد

يؤدي استخدام المواد الاستهلاكية ذات الاستخدام الواحد لإنتاج البروتين إلى تقليل خطر التلوث المتبادل بشكل كبير، وهو أمر شائع مع المعدات القابلة لإعادة الاستخدام.

8. عمليات الإنتاج المغلقة

تُقلل الأنظمة المغلقة، مثل المفاعلات الحيوية أو الغرف المغلقة، من التعرض للبيئة المفتوحة. وهذا يُقلل من خطر تلوث الحمض النووي من الهواء، خاصةً خلال المراحل الحرجة كالتخمير وتنقية البروتين.

9. تجنب توليد الهباء الجوي

يمكن أن يُسهّل تكوّن الهباء الجوي أثناء إنتاج البروتين انتشار الحمض النووي المحمول جوًا. ويمكن للتّدابير الاحترازية، كالتّعامل بحذر ونقل السوائل دون تحريك، أن تُقلّل من تكوّن الهباء الجوي.

10. استخدام النوكليازات

إن معالجة الأسطح والمعدات بالنوكليازات قبل الاستخدام وبعده يمكن أن تؤدي إلى تدهور الحمض النووي المتبقي الذي قد يتبقى بعد عمليات مثل تحلل الخلايا أو الترشيح.

11. تنفيذ العزل البيئي

بالنسبة للعمليات عالية المخاطر مثل تنقية البروتين وتكوينه، فإن استخدام العوازل أو صناديق القفازات يوفر طبقة إضافية من الحماية، ويعزل العملية عن الملوثات المحمولة جواً.

12. المعدات والأدوات المخصصة

إن استخدام المعدات المخصصة لإنتاج البروتين حصريًا يمنع التلوث المتبادل من الأدوات والأجهزة التي ربما تعرضت للحمض النووي أو الأحماض النووية في عمليات أخرى.

13. خطة الاستجابة لحالات التلوث الطارئة

ينبغي وضع خطة استجابة فعّالة لإدارة التلوث العرضي بالحمض النووي. وينبغي أن يشمل البروتوكول خطوات سريعة للتحديد والاحتواء والمعالجة لمنع انتشار التلوث وتقليل آثاره.

14. تدريب الموظفين

ويضمن التدريب المستمر للموظفين حول مخاطر تلوث الحمض النووي وأهمية تقنيات التعامل السليمة تنفيذ أفضل الممارسات والالتزام ببروتوكولات مكافحة التلوث.

الثاني إزالة تلوث الحمض النووي من البروتينات

أثناء تنقية البروتين، يُعدّ إزالة أي تلوث متبقٍّ بالحمض النووي أمرًا بالغ الأهمية للحفاظ على جودة البروتين. تُستخدم عدة تقنيات شائعة لإزالة الحمض النووي من عينات البروتين:

1. طرق تحلل الخلايا الخفيفة

تسمح محاليل التحلل غير المدمرة بإطلاق البروتينات مع تقليل تكسر الحمض النووي. يتجنب هذا النهج التدمير العشوائي للحمض النووي، مما يقلل من احتمالية تلويث عينة البروتين.

2. ظروف التحلل الأمثل

إن تعديل العوامل مثل الرقم الهيدروجيني والقوة الأيونية أثناء تحلل الخلايا يمكن أن يمنع ذوبان الحمض النووي، وبالتالي تقليل كمية الحمض النووي الملوث في العينة الناتجة.

3. تثبيط النوكلياز

إن استخدام مثبطات البروتيناز، مثل فينيل ميثيل سلفونيل فلوريد (PMSF)، يمكن أن يمنع نشاط النوكليازات داخل الخلايا، مما يسمح بتحلل الحمض النووي بشكل أكثر تحكمًا وانتقائية أثناء التحلل.

4. الصدمة التناضحية

الصدمة التناضحية هي طريقة لطيفة لتحليل الخلايا بوضعها في محلول ذي فرق مفاجئ في الضغط التناضحي. يساعد هذا على تقليل إطلاق الحمض النووي، مما يؤدي إلى تحضيرات بروتينية أنظف.

5. التحلل الأنزيمي

يعد استخدام الإنزيمات مثل الليزوزيم لتحلل جدران الخلايا البكتيرية طريقة خاضعة للرقابة للتحلل تستهدف غشاء الخلية فقط، مما يقلل من خطر تلوث الحمض النووي أثناء إطلاق محتويات الخلية.

6. العلاج بعد التحلل

بمجرد تحلل الخلايا، يمكن أن يساعد التبريد الفوري للعينة على تقليل نشاط النوكلياز، والذي من شأنه أن يؤدي إلى المزيد من تدهور الحمض النووي في المحلول.

ثالثا. طرق متقدمة لإزالة الأحماض النووية

يمكن أن يؤدي استخدام الكروماتوغرافيا، أو الطرق القائمة على التقارب في المعالجة اللاحقة، إلى إزالة المزيد من ملوثات الحمض النووي من مستحضرات البروتين. كروماتوغرافيا تبادل الأنيونات والكاتيونات تقنيتان راسختان لإزالة تلوث الحمض النووي من عينات البروتين. تعتمد كلتاهما على التفاعل بين الأحماض النووية والأسطح المشحونة لإزالة الحمض النووي بشكل انتقائي.

1. أعمدة تبادل الأنيونات

تستخدم أعمدة تبادل الأنيونات أطوارًا ثابتة موجبة الشحنة لجذب الأحماض النووية سالبة الشحنة وربطها. بتعديل تركيز ملح محلول الإيلوشن، يمكن إزالة الأحماض النووية بشكل انتقائي من مستحضر البروتين.

2. أعمدة تبادل الكاتيون

في ظروف محددة، يمكن أيضًا استخدام أعمدة تبادل الكاتيون لإزالة الأحماض النووية. بزيادة تركيز الملح أو تعديل الرقم الهيدروجيني، يمكن استخلاص الأحماض النووية بشكل تنافسي من العمود.

3. الترشيح الفائق

تستخدم تقنية الترشيح الفائق الترشيح الغشائي الانتقائي لفصل البروتينات عن الأحماض النووية، مما يضمن إزالة الحمض النووي بشكل فعال أثناء خطوات التنقية.

4. كروماتوغرافيا الترشيح الهلامي

ترشيح الهلام هو تقنية كروماتوغرافيا استبعادية الحجم، تفصل الجزيئات بناءً على حجمها. ولأن الأحماض النووية أكبر حجمًا من البروتينات، يتم فصلها بفعالية، تاركةً عينات بروتينية نقية.

الرابع الحد من تلوث الحمض النووي من الموظفين

يلعب الموظفون دورًا هامًا في احتمالية تلوث الحمض النووي (DNA) بعمليات إنتاج البروتين. ويمكن للتدابير التالية أن تساعد في التخفيف من هذا الخطر:

1. التدريب الشامل للموظفين

ينبغي لجميع الموظفين الخضوع للتدريب حول أهمية التحكم في تلوث الحمض النووي وأفضل الممارسات لمنع التلوث.

2. معدات الحماية الشخصية (PPE)

يجب على الموظفين ارتداء معدات الحماية الشخصية المناسبة، مثل المعاطف المخبرية والقفازات والأقنعة والنظارات الواقية، لتقليل مخاطر تلوث الحمض النووي من الاتصال البشري.

3. بروتوكولات نظافة اليدين

يعد غسل اليدين بشكل متكرر واستخدام المطهرات التي تحتوي على الكحول أمرًا ضروريًا للحد من انتقال الحمض النووي من اليدين إلى الأسطح والمعدات.

4. تغييرات الملابس والأحذية

يضمن تغيير الملابس والأحذية المخصصة للعمل عدم دخول تلوث الحمض النووي من خارج منطقة الإنتاج.

5. قواعد صارمة لسلوك العمل

يجب على الموظفين الامتناع عن الأكل أو الشرب أو التحدث في منطقة إنتاج البروتين لمنع دخول الحمض النووي عن طريق اللعاب أو جزيئات الطعام أو القطرات.

6. الرصد البيئي

يجب إجراء مراقبة بيئية منتظمة، بما في ذلك فحوصات الهواء والسطح والمعدات، للتأكد من عدم وجود تلوث الحمض النووي في منطقة الإنتاج.

خاتمة

لضمان إنتاج بروتينات عالية الجودة وخالية من التلوث، لا بد من اتباع نهج شامل لمكافحة تلوث الحمض النووي. ومن خلال تطبيق ضوابط بيئية صارمة، واستخدام أساليب تنقية مُحسّنة، والتركيز على تدريب الكوادر، يمكن تقليل المخاطر المرتبطة بتلوث الحمض النووي بشكل كبير.وتعتبر هذه الممارسات ضرورية للحفاظ على سلامة وموثوقية المنتجات البروتينية في التطبيقات البحثية والصناعية، مما يساهم في نهاية المطاف في تقدم تطوير المنتجات البيولوجية.

المنتجات ذات الصلة

1. جليكوزيلاز اليوراسيل DNA UCF.ME (UDG/UNG)، غير قابل للتأثر بالحرارة

2. مثبط RNase الفأري UCF.ME

مزايا المنتج

  • بقايا منخفضة للغاية من الحمض النووي الجينومي UCF.ME—E. coli <0.1 نسخة/ وحدة؛
  • بقايا نوكلياز منخفضة - لا يوجد نوكلياز خارجي متبقي، أو إنزيم التكسير، أو RNase؛
  • قدرة هضم قوية - 0.05 وحدة/طن يمكنها هضم 105 نسخة/طن من منتجات dU-DNA؛
  • قابلية حرارية جيدة - إبطال كامل في أي حالة من درجات الحرارة 50 درجة مئوية لمدة 10 دقائق، أو 55 درجة مئوية لمدة 5 دقائق، أو 95 درجة مئوية لمدة 5 دقائق؛
  • متوافق مع أنظمة تفاعل RT-qPCR - لا يؤثر على نظام الكشف حتى عند مستويات الإدخال العالية (نظام تفاعل 2U/20μL).

(1) نوكليازات متبقية منخفضة: لا يوجد نوكليازات خارجية متبقية، أو إنزيمات التكسير، أو RNases

الشكل 1. نتائج اختبار بقايا النوكلياز

(2) بقايا الحمض النووي الجينومي لبكتيريا الإشريكية القولونية < 0.1 نسخة/ وحدة

الشكل 2. نتائج اختبار بقايا الحمض النووي الجينومي لبكتيريا الإشريكية القولونية

معلومات الطلب

قطة:

اسم

طلب

14321

بوليميراز الحمض النووي Hieff UNICON UCF. ME™ المتقدم Hotstart Taq

تفاعل البوليميراز المتسلسل

14608

إنزيم النسخ العكسي Hifair UCF.ME™ V (200 وحدة/ميكرولتر)

تفاعل البوليميراز المتسلسل العكسي العكسي

14466

UCF.ME™ Uracil DNA Glycosylase (UDG/UNG)، غير قابل للتغير بالحرارة، 1 وحدة/ميكرولتر

تفاعل البوليميراز المتسلسل العكسي العكسي

14672

جامعة وسط فلوريدا.مثبط RNase الفأري ME™ (40 وحدة/ميكرولتر)

تفاعل البوليميراز المتسلسل العكسي العكسي

16630

مجموعة مسبار RT-qPCR متعدد المراحل Hifair™ V2 (UDG Plus، معزز GC Plus)

تفاعل البوليميراز المتسلسل العكسي العكسي

16713

مزيج Hieff Unicon® Pure Pro U+ qPCR (أنبوب واحد)

تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي

13488

مجموعة تركيب Hieff NGS™ ds-cDNA

الجيل التالي من الجيل التالي

13501

مجموعة تركيب Hieff NGS™ ds-cDNA (جهاز هضم gDNA بالإضافة إلى)

الجيل التالي من الجيل التالي

12316

مجموعة تحضير مكتبة Hieff NGS™ OnePot Flash DNA

الجيل التالي من الجيل التالي

13490

مجموعة تحضير مكتبة الحمض النووي Hieff NGS™ OnePot ll لـ Illumina

الجيل التالي من الجيل التالي

12946

مجموعة تركيب الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين Hieff NGS™ الأولى (10x)

tNGS لمسببات الأمراض

12950

مجموعة Hieff™ Multiplex RT-PCR رباعية الأبعاد

tNGS لمسببات الأمراض

12948

4x Hieff™ Multiplex PCR Master Mix

NGS لمسببات الأمراض

12977

4x Hieff™ Multiplex PCR Master Mix 2.0

NGS لمسببات الأمراض

41308

مجموعة الكشف عن بقايا الحمض النووي للخلية المضيفة لبكتيريا الإشريكية القولونية (2G)

مراقبة الجودة

18461

مجموعة تحضير عينات الحمض النووي المغناطيسي المتبقي MolPure™

مراقبة الجودة

سؤال