I. Principi del Western Blot

Western Blot (WB), o immunoblotting proteico, è una tecnica classica per rilevare proteine ​​specifiche in base alle interazioni antigene-anticorpo, ampiamente utilizzata in biologia molecolare, immunologia e campi correlati. I suoi passaggi principali includono:

  • Separazione delle proteine:

- La tecnica SDS-PAGE separa le proteine ​​denaturate in base al peso molecolare.

- L'SDS ricopre le proteine ​​con una carica negativa uniforme, eliminando le influenze strutturali.

  • Trasferimento a membrana:

- Le proteine ​​vengono trasferite dal gel a una membrana (ad esempio, PVDF o nitrocellulosa).

  • Rilevamento degli anticorpi:

- Gli anticorpi primari legano specificamente la proteina bersaglio, seguiti da anticorpi secondari coniugati con enzimi (ad esempio HRP) che generano un segnale rilevabile, come la chemiluminescenza.

II. Flusso di lavoro standard Western Blot

Fare un passo

Procedure chiave

Reagenti consigliati

(Prodotti Yeasen)

1. Preparazione del campione

Estrarre le proteine ​​con il tampone di lisi RIPA; aggiungere PMSF per inibire le proteasi attività.

Serie di tamponi di lisi RIPA, PMSF

2. Quantificazione delle proteine

Utilizzare il metodo BCA (Cat#20200ES) per la quantificazione; abbinare il tampone di diluizione standard al tampone campione.

Kit di quantificazione BCA (Cat#20200ES/20201ES)

3. Elettroforesi SDS-PAGE

Utilizzare gel precolati e farli funzionare a 150 V finché il colorante non raggiunge il fondo del gel.

Gel pre-colati, tampone di caricamento SDS-PAGE

4. Trasferimento e blocco della membrana

Attivare la membrana PVDF (Cat#36125ES) immergendo in metanolo per 1 min; trasferire a 300 mA per 60 min in un bagno di ghiaccio; bloccare a temperatura ambiente (TA) per 1 h o utilizzare una soluzione di bloccaggio rapido (Cat#36122ES) per 10 min.

Traansfer Buffer, serie membrana PVDF

5. Incubazione degli anticorpi

Incubare con l'anticorpo primario a 4°C durante la notte; anticorpo secondario a temperatura ambiente per 1-2 ore; lavare accuratamente con TBST 3 volte.

Diluente per anticorpi

6.Rilevamento delle proteine

Sviluppare con ECL (Cat#36208ES).

Serie di chemiluminescenza ECL

Figure 1: Western Blot Workflow

Figura 1: Flusso di lavoro Western Blot

III. Problemi comuni e soluzioni

Problema

Possibili cause

Soluzioni

Background elevato

High Background

Blocco incompleto

Utilizzare una soluzione di bloccaggio fresca e prolungare il tempo di bloccaggio.

Lavaggio inadeguato

Aumentare la frequenza e la durata dei lavaggi per rimuovere i legami non specifici.

Concentrazione eccessiva di anticorpi primari

Diluire l'anticorpo fino a raggiungere la concentrazione appropriata.

Problemi di qualità del campione

Controllare la purezza e la qualità del campione; utilizzare campioni freschi.

Essiccazione a membrana

Assicurarsi che la membrana rimanga idratata durante le fasi di incubazione; garantire il contatto completo con le soluzioni di reazione.

Segnale debole o assente

Weak or No Signal

Trasferimento incompleto

Verificare l'efficienza del trasferimento e regolare i tempi secondo necessità.

Membrana PVDF non attivata

Immergere il PVDF nel metanolo per attivarlo prima di trasferirlo nel tampone.

Incompatibilità dell'anticorpo primario con la specie bersaglio

Controllare la scheda tecnica, confrontare le sequenze di immunogeni e proteine ​​e includere un controllo positivo ampiamente utilizzato (ad esempio, β-actina nelle cellule dei mammiferi).

Incompatibilità degli anticorpi primari e secondari

Assicurarsi che l'anticorpo secondario corrisponda alla specie ospite dell'anticorpo primario.

Legame insufficiente degli anticorpi

Aumentare la concentrazione degli anticorpi e prolungare l'incubazione a 4°C (ad esempio, durante la notte).

Bassi livelli di antigene

Caricare almeno 20-30 μg di proteine ​​per corsia; utilizzare inibitori della proteasi e un controllo positivo.

Bassa espressione della proteina bersaglio

Confermare l'espressione nel campione tramite letteratura/database; concentrare il campione o utilizzare un controllo ad alta espressione.

Bande non specifiche/Bande multiple

Non-Specific Bands/Multiple Bands

Linee cellulari sottoposte a passaggi eccessivi che alterano i profili proteici

Utilizzare celle a basso passaggio (<15 passaggi) ed eseguire controlli paralleli con ceppi a passaggio precoce.

Degradazione delle proteine

Includere gli inibitori della proteasi nel tampone di lisi; conservare a -80°C, evitare il congelamento-scongelamento, utilizzare campioni freschi.

Modifiche post-traduzionali

Controllare la letteratura per le modifiche che influenzano la dimensione della banda (ad esempio, ubiquitinazione, glicosilazione).

Molteplici varianti di giunzione

Verificare le varianti di splicing tramite letteratura o database.

Dimeri/multimeri proteici

Aggiungere β-mercaptoetanolo fresco o DTT al tampone di caricamento SDS.

Contaminazione proteica esogena

Controllare la presenza di proteine ​​esogene; cambiare linea cellulare se necessario.

Caricamento eccessivo del campione

Ottimizzare il caricamento (20-30 μg) in base all'espressione target tramite test del gradiente.

Formazione di multimeri

Far bollire i campioni per 10 minuti per dissociare i multimeri

Elevata concentrazione di anticorpi primari

Ridurre la concentrazione e/o il tempo di incubazione per evitare bande extra.

Elevata concentrazione di anticorpi secondari

Ridurre la concentrazione e includere un controllo solo secondario per ridurre il legame non specifico.

Rilevamento di proteine ​​non segnalate o membri della famiglia

Rivedere la letteratura o BLAST; utilizzare linee cellulari/tessuti consigliati.

Se ciò fosse verificato, potresti aver scoperto una nuova proteina!

Fasce sorridenti

Smiling Bands

Migrazione rapida, temperatura elevata del buffer, sovraccarico, buffer basso

Migrazione lenta, preraffreddamento del tampone, riduzione del carico proteico, verifica che il tampone copra completamente i pozzetti.

Fasce accigliate

Frowning Bands

Problemi del dispositivo (ad esempio, bolle sotto il gel)

Regolare l'impostazione per eliminare le bolle e garantire una polimerizzazione uniforme del gel.

Fasce di coda

Tailing Bands

Scarsa solubilità del campione, degradazione, tampone riutilizzato

Mescolare bene i campioni, utilizzare campioni freschi, preparare un tampone di corsa fresco.

Fasce a forma di manubrio

Dumbbell-Shaped Bands

Gel non uniforme polimerizzazione, campioni impuri

Rifondere il gel per uniformità; centrifugare i campioni prima dell'uso.

Sbavatura della banda

Band Smearing

Carico eccessivo, scarsa qualità del gel

Ridurre il volume del campione, migliorare la preparazione del gel.

Segni di bolle

Bubble Marks

Aria intrappolata durante il trasferimento

Eliminare le bolle durante l'assemblaggio del sandwich di trasferimento.

Punti neri irregolari

Uneven Black Spots

Soluzione bloccante non disciolta, distribuzione non uniforme degli anticorpi

Sciogliere completamente la soluzione bloccante, lavare 3 volte con TBST, agitare durante l'incubazione.

Macchie bianche

White Patches

Elevata concentrazione di anticorpi che impoverisce il substrato

Concentrazioni inferiori di anticorpi primari/secondari.

Ⅳ.Strumenti di selezione e ottimizzazione del prodotto

Yeasen offre una suite completa di reagenti per semplificare il flusso di lavoro

Prodotti correlati:

Procedure

N. di cat.

Nome del prodotto

Specifiche

Preparazione del campione

20101ES

Tampone di lisi RIPA (forte)

100 ml

20115ES

Tampone di lisi RIPA (terreno)

100 ml

20114ES

Tampone di lisi RIPA (debole)

100 ml

20118ES

Tampone di lisi per saggi WB/IP

100 ml

20201ES

Kit di quantificazione delle proteine ​​BCA (migliorato)

500 tonnellate/2500 tonnellate/5000 tonnellate

20200ES

Kit di quantificazione delle proteine ​​BCA (pronto all'uso)

500 tonnellate

Elettroforesi SDS-PAGE

20350ES

Marcatore proteico Gold Band Plus a 3 colori per intervalli regolari (8-180 kDa)

250 μL/2×250 μL/10×250 μL

20352ES

Marcatore proteico ad alto raggio GoldBand™ a 3 colori (10-245 KDa)

2×250 μL/10×250 μL

20328ES

Kit di preparazione del gel SDS-PAGE

1 kit (30~50 gel)/ 1 kit (150~250 gel)

20324ES- 20327ES

Kit di preparazione rapida per gel PAGE

Concentrazioni: 8%, 10%, 12,5%, 15%

36259ES-36280ES

Gel proteico prefabbricato Plus

Concentrazioni: 8%、10%、12%、4-12%、4-20%

Opzioni di caricamento: 10 pozzi, 12 pozzi, 15 pozzi

Trasferimento e blocco della membrana

36125ES

Membrana PVDF da 0,45 μm (1 rotolo, 30 cm × 3 m)

1 rotolo

36126ES

Membrana PVDF da 0,22 μm (1 rotolo, 30 cm × 3 m)

1 rotolo

Incubazione degli anticorpi

36206ES

Diluente per anticorpi primari e secondari per WB

100 ml/500 ml

Rilevamento delle proteine

36208ES

Reagente di rilevamento Super ECL

100 ml/500 ml

36222ES

Kit substrato chemiluminescente ECL migliorato

100 ml/500 ml

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