그만큼 d T7 고수율 RNA 합성 키트 설명
T7 고수율 RNA 합성 키트는 전사 반응 시스템을 최적화합니다. 이 키트는 T7 RNA 중합효소, T7 프로모터 서열을 템플릿으로 하는 선형화된 이중 가닥 DNA, 프로모터 하류의 DNA 서열을 전사하기 위한 기질인 NTP를 사용하여 단일 가닥 RNA를 효율적으로 합성할 수 있습니다. 전사 중에 변형된 뉴클레오타이드를 기질 로 추가하여 바이오틴 또는 염료 표지된 RNA를 생산할 수도 있습니다.
이 키트는 긴 전사본과 짧은 전사본을 모두 합성할 수 있으며 , 1μg의 DNA 템플릿 입력으로 100-200μg의 RNA를 생산할 수 있습니다. 전사에 의해 합성된 RNA는 RNA 구조 및 기능 연구, RNase 보호, 프로브 하이브리다이제이션, RNAi, 마이크로주입 및 시험관 내 번역과 같은 다양한 다운스트림 애플리케이션에 사용할 수 있습니다 .
합성 원리
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그림 1: 시험관 내 RNA 전사 과정
제품의 장점
고수율 : 전사반응을 통해 2시간 내에 최대 200μg 생산 가능
더 나은 다용성: 20nt-10000nt RNA 전사에 적합
우수한 성능: IVT 과정 중 전사 부산물을 효과적으로 감소시킵니다.
다양한 응용 분야: 일반, 표지 및 수정 RNA 합성에 사용 가능
제품 속성
그림 2: 다양한 길이의 전사본 수율
그림 3: 다양한 길이의 필사본 품질
그림 4: HEK-293 세포에서 전사된 mRNA의 발현
참고사항: mRNA는 Vaccinia Capping Enzyme(
실험 방법
시약 해동T7 RNA Polymerase Mix를 잠시 원심분리하고 얼음 위에 놓습니다 . 10×Transcription Buffer와 리보뉴클레오타이드(ATP, CTP, GTP, UTP)를 녹이고 , 튜브 바닥까지 섞고 원심분리하고, 10×Transcription Buffer를 실온에 두고, 4가지 유형의 리보뉴클레오타이드를 얼음 위에 놓습니다.
B. 실온에서의 조립전사 반응다음 시스템에 따라 반응 시스템을 준비하세요.
구성 요소 |
용량(µL) |
최종 농도 |
RNase가 없는 H 2 O |
최대 20개 |
- |
10×전사 버퍼 |
2 |
1× |
CTP / GTP / ATP / UTP (각각 100 mM) |
각각 2개씩 |
각각 10 mM |
템플릿 DNA |
1마이크로그램 |
- |
T7 RNA 중합효소 혼합물 |
2 |
- |
참고사항:
-
반응은 실온에서 구성됩니다. 10× 전사 완충액에는 스페르미딘이 포함되어 있으므로, 고농도의 스페르미딘은 낮은 온도에서 DNA 템플릿 침전을 일으킬 수 있습니다.
짧은 전사본(<100nt)의 경우, 2 µg 템플릿을 사용할 수 있으며, 전사 시간은 4~8시간으로 연장됩니다.
3. 긴 전사본(>1000nt)의 경우 전사를 위한 템플릿으로 선형화된 플라스미드를 사용하는 것이 좋습니다.
4. 증발을 방지하기 위해 뜨거운 뚜껑을 열어둔 상태에서 PCR 기기에서 반응을 수행합니다.
5. 반응 생성물은 흰색 침전물을 가질 수 있습니다. 침전물은 반응 용액에서 자유 피로인산염과 마그네슘 이온에 의해 생성된 피로인산 마그네슘으로, 후속 실험에 영향을 미치지 않습니다. 이를 제거하고 싶다면 EDTA를 추가할 수 있습니다. EDTA를 추가하여 후속 실험에 영향을 미치는 경우 원심분리로 상층액을 회수할 수도 있습니다.
6. 시약과 용기를 RNase 오염 없이 보관하세요.
성분 용액을 섞고, 튜브 바닥까지 잠시 원심분리하고, 37°C에서 2시간 동안 배양합니다. 전사 길이가 100nt 미만이면 반응 시간을 4-8시간으로 늘립니다.
D.DNase I 처리 (선택)반응이 완료되면 각 튜브에 DNase I(RNase free) 2 μL를 첨가하고 37°C에서 15분 동안 배양하여 템플릿 DNA를 제거합니다.
자주 묻는 질문
- 낮은 전사 수율
템플릿의 품질은 수율과 밀접한 관련이 있습니다. 실험군의 수율은 대조군보다 상당히 낮습니다. 가능한 이유는 다음과 같습니다.
- 실험 템플릿에는 억제 구성 요소가 포함되어 있습니다.
- 아마도 템플릿에 문제가 있을 겁니다.
제안: ① 템플릿 재정제; ② 템플릿 정량 및 무결성 확인; ③ 반응 시간 연장; ④ 템플릿 입력량 증가; ⑤ 다른 프로모터 및 다른 RNA 중합효소 사용.
- 짧은 필사본의 수율이 낮음
짧은 템플릿 단편은 반응을 억제할 수 있습니다. 전사 산물이 100nt 미만일 때 수율을 높이려면 반응 시간을 4-8hs로 늘리거나 템플릿 양을 2μg로 늘리십시오.
- RNA 전사 길이가 예상보다 깁니다
전기영동 결과에서 생산물 밴드가 예상 크기보다 큰 경우, 다음과 같은 이유가 있을 수 있습니다. ① 플라스미드 템플릿이 완전히 선형화되지 않았을 수 있습니다. ② 센스 가닥의 3' 말단이 눈에 띄는 구조를 가지고 있습니다. ③ RNA가 완전히 변성되지 않은 2차 구조를 가지고 있습니다.
제안: ①템플릿이 완전히 선형화되었는지 확인하고 필요한 경우 추가 선형화를 수행합니다. ②3' 오버행을 피하기 위해 적절한 제한 효소를 선택하거나 Klenow Fragment/T4 DNA 중합효소를 사용하여 계속 진행하기 전에 전사를 완료합니다. ③변성된 젤을 사용하여 RNA 생성물을 검출합니다.
- RNA 전사 길이가 예상보다 짧습니다.
전기영동 결과, 생산물 밴드가 예상 크기보다 작은 경우 다음과 같은 이유가 있을 수 있습니다. ① 템플릿에 T7 RNA 중합효소 종결자와 유사한 종결 서열이 포함되어 있음 ② 템플릿의 GC 함량이 너무 높음.
제안: ① 반응 온도를 낮추세요(예: 30°C). 때로는 온도를 낮추면 전사 길이를 늘리는 데 도움이 될 수 있지만 수율이 감소할 수 있습니다. 전사를 위해 다른 RNA 중합효소를 시도하세요. ② 템플릿 GC 함량이 높으면 42℃에서 반응을 수행하거나 SSB를 추가하여 수율과 전사 길이를 늘리세요.
- 전사산물의 전기영동 테일링
전기영동 중 테일링 현상은 다음과 같은 이유로 발생할 수 있습니다. ① 실험 작업 중 RNase 오염 ② DNA 템플릿이 RNase로 오염됨.
제안: ① RNase가 없는 피펫 팁과 EP 튜브를 사용하고, 일회용 라텍스 장갑과 마스크를 착용하고, 모든 시약은 RNase가 없는 H 2 O로 준비합니다. ② 템플릿 DNA를 재정제합니다.
주문 정보
제품 이름 |
카탈로그 번호 |
사양 |
10623ES |
50/100/500톤 |
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10625ES |
10KU/100KU/2500KU/25MU |
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10620ES |
10U/100U/1000U |
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10621ES |
10KU/20KU/100KU/1MU |
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10614ES |
2KU/10KU/100KU |
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10612ES |
10KU/50KU/250KU |
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10611ES |
500/2000/10000유로 |
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12603ES |
24/96티 |