คุณเคยเผชิญกับข้อสงสัยขณะสร้างคลังข้อมูล RNA หรือไม่? ความกังวลเกี่ยวกับความเป็นพิษของรีเอเจนต์บางชนิดและความจำเป็นในการทำงานในสภาพแวดล้อมที่ไม่มีแสงอาจทำให้สับสนได้ โดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อต้องจัดการกับตัวอย่างจำนวนมาก แอกติโนไมซิน ดี มักเป็นแหล่งที่มาของข้อสงสัยเหล่านี้ เนื่องจากแอกติโนไมซิน ดี เป็นที่รู้จักในเรื่องความเป็นพิษและความไวต่อแสง แต่เหตุใดแอกติโนไมซิน ดี จึงรวมอยู่ในชุดอุปกรณ์ของคลังข้อมูล?

ผลการศึกษาล่าสุดพบว่าแอคติโนไมซิน ดี มีความสามารถในการยับยั้งการถอดรหัส โดยจะจับกับดีเอ็นเอที่บริเวณคอมเพล็กซ์เริ่มต้นการถอดรหัส จึงป้องกันการต่อของโซ่ RNA โดย RNA โพลิเมอเรส โดยพื้นฐานแล้ว แอคติโนไมซิน ดี จะรบกวนกิจกรรมของโพลิเมอเรส ทำให้การสังเคราะห์สายที่สองพร้อมกันระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ cDNA ทำได้ไม่สำเร็จ ซึ่งทำให้สามารถใช้ dUTP แทน dTTP ในการสังเคราะห์สายสองสาย ส่งผลให้มีความจำเพาะของโซ่เพิ่มขึ้นในการสร้างคลัง RNA

การรวมแอคติโนไมซินดีในชุดสร้างไลบรารี RNA ช่วยปรับปรุงการสร้างไลบรารีเฉพาะสายได้อย่างไม่ต้องสงสัย ช่วยเพิ่มความจำเพาะของสายโซ่ได้อย่างมีนัยสำคัญ นวัตกรรมนี้ทำให้กระบวนการทดลองคล่องตัวขึ้น ทำให้นักวิจัยทำได้ง่ายขึ้น นอกจากนี้ ยังช่วยปรับปรุงความจำเพาะของสายโซ่ได้อย่างมาก ซึ่งเป็นประเด็นสำคัญของการค้นคว้าทางวิทยาศาสตร์ที่เกี่ยวข้องกับ RNA

รูปที่ 1: ผลการทดสอบเปรียบเทียบโดยบริษัท NEB: ผลกระทบของ แอกติโนไมซิน ดี.
ข้อมูลที่แสดงในกราฟเผยให้เห็นผลลัพธ์ที่น่าทึ่ง มากกว่า 90% ของการอ่านนั้นสอดคล้องกับสายความรู้สึกเชิงบวกที่คาดไว้ ซึ่งแสดงให้เห็นถึงความจำเพาะของโซ่ที่ยอดเยี่ยมของไลบรารีลำดับที่รวมถึงแอกติโนไมซินดี (จากเว็บไซต์ NEB)

อย่างไรก็ตาม แอกติโนไมซินดีมีข้อเสียคือเป็นพิษและต้องได้รับการปกป้องจากแสง ในปัจจุบันมีความต้องการชุดสร้างเพลทและแบบผสมสำเร็จเพิ่มมากขึ้น ความจำเป็นในการป้องกันแสงทำให้การพัฒนาชุดเพลทมีข้อจำกัด

โชคดีที่ไม่จำเป็นต้องกังวลเกี่ยวกับแอคติโนไมซินดีอีกต่อไป Yeasen แพลตฟอร์ม ZymeEditor ได้เปิดตัวเอนไซม์กลายพันธุ์ MMLV ที่เป็นนวัตกรรมใหม่ซึ่งมาแทนที่ฟังก์ชันของแอกติโนไมซินดี ชุดนี้ไม่มีกลิ่น ไม่เป็นพิษ และo จำเป็นต้องหลีกเลี่ยง แสง ให้คุณสมบัติพิเศษของโซ่ที่เหนือกว่า ขจัดความกังวลเกี่ยวกับสุขภาพและความไวต่อแสง

รูปที่ 2: การออกแบบทางวิศวกรรมของ MMLV เพื่อระบุ MMLV กลายพันธุ์ที่อาจมีส่วนสนับสนุน Standed RNA-seq

12301ES

12308ES

12310ES

12340ES

แอกติโนไมซิน ดี

เอ็มจีไอ

อิลลูมิน่า

พรีมิกซ์

ปริมาณส่วนประกอบ

10

10

6

5

ปีที่ออกจำหน่าย

2017

2021

2022

2023

ตารางที่ 1: ลักษณะเด่นของ Yeasenชุดเตรียม RNA Lib ของ 's

รูปที่ 3. เมื่อใช้ชุดทดสอบที่มีแอคติโนไมซิน ดี ร่วมกับชุดทดสอบใหม่ที่ไม่มีแอคติโนไมซิน ดี ผลผลิตจะใกล้เคียงกันสำหรับชุดทดสอบทั้งสองชุดที่อินพุต RNA คือ 10 นาโนกรัมและ 1 ไมโครกรัม อย่างไรก็ตาม ที่อินพุต RNA คือ 4 ไมโครกรัม ชุดทดสอบใหม่ที่ไม่มีแอคติโนไมซิน ดี ให้ผลผลิตที่สูงกว่า

รูปที่ 4. การใช้ชุดใหม่ซึ่งมีโปรตีนกลายพันธุ์ MMLV โดยไม่เติม Actinomycin D ส่งผลให้มีความจำเพาะต่อสายที่เหนือกว่าเมื่อเปรียบเทียบกับชุดที่มี Actinomycin D ความแตกต่างนี้จะเด่นชัดขึ้น โดยเฉพาะที่ปริมาณอินพุต RNA ต่ำกว่า 10 นาโนกรัม

Yeasenมุ่งมั่นที่จะยกระดับประสบการณ์ของลูกค้า และยังคงบุกเบิกนวัตกรรมใหม่ๆ ในด้านชุดห้องสมุด RNA ต่อไป

คำแนะนำสินค้า

ชื่อ

แมว#

ขนาด

ชุดเตรียมไลบรารี RNA Hieff NGS ® EvoMax (เฉพาะสาย)

12340ES24/96

24 ตัน/ 96 ตัน

ไฮฟ์ เอ็นจีเอส™ อัลติมา โหมดคู่ เอ็มอาร์เอ็นเอ ห้องสมุด การเตรียมตัว ชุด

12308ES24/96

24 ตัน/ 96 ตัน

ชุดมาสเตอร์แยก mRNA Hieff NGS® V2

12629ES24/96

24 ตัน/ 96 ตัน

ชุดกำจัด rRNA ของมนุษย์ Hieff NGS MaxUp (มนุษย์/หนู/หนูทดลอง)

12257ES24/96

24 ตัน/ 96 ตัน

ชุดกำจัด rRNA ของ Hieff NGS® MaxUp (พืช)

12254ES24/96

24 ตัน/ 96 ตัน

โพรบการพร่อง mRNA ของโกลบิน (มนุษย์)

12806ES24/96

24 ตัน/ 96 ตัน

การสอบถาม