1、Bối cảnh
rRNA chiếm tỷ lệ cao trong Tổng RNA trong sinh vật, nhưng nó có thể cung cấp ít thông tin hiệu quả. Các RNA này sẽ tạo ra một lượng lớn dữ liệu không hợp lệ, không có ý nghĩa gì đối với nghiên cứu thu thập thông tin sinh học. Trong khi đó, rRNA có tỷ lệ cao làm cho mRNA tương đối dồi dào trong các bản sao thấp, do đó ảnh hưởng đến việc phát hiện các bản sao có độ dồi dào thấp. Do đó, trong giải trình tự RNA thông thường (RNA-SEQ), việc loại bỏ rRNA hiệu quả là điều cần thiết để đạt được giải trình tự RNA hiệu quả về mặt chi phí.
2、Mô tả sản phẩm
（1）Dòng MaxUp，Bộ dụng cụ làm suy giảm rRNA
Dòng thuốc thử loại bỏ rRNA MaxUp dựa trên quá trình tiêu hóa RNase H để loại bỏ RNA ribosome (rRNA) khỏi Tổng RNA của mẫu để giữ lại RNA thông tin (mRNA) và các RNA không mã hóa khác. Các loại mẫu phong phú, lượng ban đầu lớn, toàn bộ quá trình mất chưa đến 2 giờ và thời gian vận hành thủ công dưới 10 phút. Đồng thời, rRNA có thể được loại bỏ hiệu quả đối với cả mẫu thông thường và mẫu chất lượng thấp (như FFPE), cải thiện đáng kể thông tin dữ liệu hiệu quả trong dữ liệu giải trình tự và thực hiện giải trình tự hiệu quả về chi phí của các mẫu RNA.
（2）Quy trình loại bỏ rRNA của loạt MaxUp
Hiện nay, việc loại bỏ RNase là phương pháp chính để loại bỏ rRNA, đặc biệt đối với một số mẫu phân hủy RNA (như mẫu FFPE), việc loại bỏ RNase có thể thể hiện được ưu điểm của nó.
Hình 1. Sơ đồ nguyên lý loại bỏ rRNA của dòng MaxUp
3、Hiển thị hiệu suất sản phẩm
（1）Mẫu thực vật
RNase H được sử dụng để tiêu hóa và loại bỏ RNA ribosome khỏi RNA tổng số từ thực vật, và qPCR được sử dụng để so sánh sự thay đổi biểu hiện của gen rRNA và gen mRNA trước và sau khi loại bỏ. Kết quả cho thấy sản phẩm này có thể loại bỏ rRNA khỏi thực vật một cách hiệu quả.
HÌNH 2. 1μg RNA lá Arabidopsis được sử dụng để loại bỏ rRNA và qPCR được sử dụng để so sánh sự thay đổi biểu hiện của gen rRNA và gen mRNA trước và sau khi loại bỏ
（2）Mẫu người/chuột/chuột nhắt
RNase H được sử dụng để tiêu hóa và loại bỏ RNA ribosome khỏi RNA tổng số từ thực vật, xây dựng thư viện và gửi giải trình tự. Phân tích dữ liệu cho thấy sản phẩm này có thể loại bỏ hiệu quả rRNA khỏi các mẫu như vậy.
Hình 3. 1μg tổng RNA của người, chuột và chuột cống được lấy làm mẫu và các dư lượng rRNA được phân tích bằng cách giải trình tự sau khi loại bỏ rRNA
（3）Mẫu RNA chất lượng thấp (ví dụ RNA FFPE)
Các mẫu chất lượng thấp có xu hướng có tỷ lệ lớn các trình tự ITS/ETS (tham khảo RNA FFPE: DV200=20% trong hình sau) và phần trình tự này cũng sẽ tạo ra một lượng lớn dữ liệu không hợp lệ, do đó, bằng cách thêm các đầu dò ITS/ETS vào các mẫu chất lượng thấp, các trình tự mục tiêu có thể được làm giàu hiệu quả hơn nữa. Ngoài đầu dò cho Pre-rRNA 45S thông thường, thiết kế đầu dò cho vùng ITS/ETS 45S của Người cũng được thêm vào sản phẩm này, đảm bảo rằng việc loại bỏ rRNA trong các mẫu chất lượng thấp có thể hiệu quả hơn mà không ảnh hưởng đến hiệu ứng loại bỏ rRNA trong các mẫu thông thường.
Hình 4.So sánh các gốc rRNA và gốc ITS/ETS trước và sau khi thêm đầu dò ITS/ETS
4、Thông tin đặt hàng
| Tvâng | Ptên sản phẩm | Mã sản phẩm | Thông số kỹ thuật sản phẩm |
| loại bỏ rRNA bộ dụng cụ | Hieff NGSTM Bộ dụng cụ làm suy giảm rRNA của con người MaxUp (rRNA & ITS/ETS) | 12257ES08/24/96 | 24/8/96T |
| 12254ES08/24/96 | 8/24T/96T |