这 d描述 T7 高产量 RNA 合成试剂盒
T7高产RNA合成试剂盒优化了转录反应体系,利用T7 RNA聚合酶、 升以T7启动子序列为模板,以NTP为底物,将双链DNA线性化,转录成启动子下游的DNA序列。在转录过程中,修饰的核苷酸可以 还 作为底物添加以产生生物素或染料标记的RNA。
该试剂盒可以合成 两个都 长转录本和短转录本,每1 μg DNA模板输入即可产生100-200 μg RNA。转录合成的RNA可用于各种下游应用,例如RNA结构和功能研究时长es、RNase保护、探针杂交、RNAi、显微注射和体外翻译。
合成原理
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图1:体外RNA转录过程
产品优势
高产: 通过转录反应,2小时内可生产高达200 μg
更好的多功能性: 适用于20nt-10000nt RNA的转录
优异的性能: 有效减少IVT过程中转录的副产物
多种应用: 可用于普通、标记和修饰的RNA合成
产品特性
图 2:不同长度的转录本产量
图 3:不同长度的转录本的质量
图4: 表达 誊寫 信使核糖核酸 在 HEK-293 细胞
注:mRNA已用痘苗加帽酶加帽(
实验方法
解冻试剂将 T7 RNA 聚合酶混合物短暂离心,然后放置 它 冰上解冻10×转录缓冲液和核苷酸s (ATP、CTP、GTP、UTP),混匀离心至管底,将10×Transcription Buffer放置室温,将4种核苷酸放置冰上。
B.室温下组装转录反应按照下列体系制备反应体系:
成分 | 容量 (µL) | 最终浓度 |
无 RNase H2哦 | 最多 20 | - |
10×转录缓冲液 | 2 | 1× |
CTP / GTP / ATP / UTP (各 100 mM) | 各 2 个 | 每个 10 毫米 |
模板DNA | 1 微克 | - |
T7 RNA 聚合酶混合物 | 2 | - |
笔记:
- 反应在室温下配置,由于10×Transcription Buffer中含有亚精胺,低温下亚精胺浓度过高可能会造成DNA模板沉淀。
对于短转录本(<100 nt),可以使用2 µg 模板,转录时间延长至 4-8 小时。
3. 对于长转录本(>1000 nt),建议使用线性化质粒作为转录模板。
4. 在PCR仪上进行反应时,请打开热盖,以防止蒸发。
5. 反应产物可能有白色沉淀。该沉淀是由 反应液中游离的焦磷酸根和镁离子不影响后续实验,若要除去可加入适量EDTA,若加入EDTA影响后续实验,也可离心回收上清液。
6.保持试剂和容器不受RNase污染。
混匀各组分溶液,短暂离心至管底,37°C 反应 2h,若转录本长度不足 100nt,则延长反应时间至 4-8h。
D.DNase I 处理(可选)反应完成后,每管加入2 μL DNase I(无RNase),37°C 孵育15分钟,以去除模板DNA。
常见问题
- 转录产量低
模板质量与产量密切相关,实验组产量明显低于对照组,可能原因有:
- 实验模板中含有抑制成分;
- 模板可能有问题。
建议:①重新纯化模板;②确定模板定量及其完整性;③延长反应时间;④增加模板投入量;⑤使用其他启动子及 其他 RNA 聚合酶。
- 短转录本产量低
模板片段太短会抑制反应,当转录产物小于100nt时,若想提高产量,可延长反应时间为4-8h或增加模板用量至2μg。
- RNA转录长度为 更大 比预期的
若电泳结果显示产物条带大于预期大小,可能的原因有:①质粒模板没有完全线性化;②正义链的3’端有突出的结构;③RNA有未完全变性的二级结构。
建议:①检查模板是否完全线性化,必要时进行额外的线性化;②选择合适的限制性内切酶,避免3'悬垂,或使用Klenow Fragment /T4 DNA聚合酶完成转录后再进行操作;③使用变性凝胶检测RNA产物。
- RNA转录长度为 更小 比预期的
如果电泳结果显示产物条带小于预期大小,可能的原因 结论: 1、模板中含有与T7 RNA聚合酶终止子相似的终止序列; 2、模板中GC含量 模板太高。
建议: ①降低反应温度(例如30℃)。有时降低温度有助于延长转录长度,但可能 降低产量。尝试其他 RNA聚合酶进行转录;②若模板GC含量高,可在42℃下反应,或加入SSB以增加产量和转录长度。
- 转录产物电泳拖尾
电泳过程中出现拖尾现象可能的原因有: ① 实验操作过程中RNase污染; ②DNA模板被RNases污染。
建议: ①使用无RNase的枪头和EP管,佩戴一次性乳胶手套和口罩,所有试剂均用无RNase的H2O.②重新纯化模板DNA。
订购信息
产品名称 | 目录编号 | 年代规格 |
10623ES | 50/100/500 吨 | |
10625ES | 10千单位/100千单位/2500千单位/25万单位 | |
10620ES | 10U/100U/1000U | |
10621ES | 10千单位/20千单位/100千单位/100万单位 | |
10614ES | 2KU/10KU/100KU | |
10612ES | 10千单位/50千单位/250千单位 | |
10611ES | 500/2000/10000 美国 | |
12603ES | 24/96 吨 |