d描述 T7 高产量 RNA 合成试剂盒

T7高产RNA合成试剂盒优化了转录反应体系,利用T7 RNA聚合酶、 以T7启动子序列为模板,以NTP为底物,将双链DNA线性化,转录成启动子下游的DNA序列。在转录过程中,修饰的核苷酸可以作为底物添加以产生生物素或染料标记的RNA。

该试剂盒可以合成 两个都 长转录本和短转录本,每1 μg DNA模板输入即可产生100-200 μg RNA。转录合成的RNA可用于各种下游应用,例如RNA结构和功能研究时长es、RNase保护、探针杂交、RNAi、显微注射和体外翻译。

合成原理

图1:体外RNA转录过程

产品优势

高产: 通过转录反应,2小时内可生产高达200 μg

更好的多功能性: 适用于20nt-10000nt RNA的转录

优异的性能: 有效减少IVT过程中转录的副产物

多种应用: 可用于普通、标记和修饰的RNA合成

产品特性

图 2:不同长度的转录本产量

图 3:不同长度的转录本的质量

图4: 表达 誊寫 信使核糖核酸 在 HEK-293 细胞

注:mRNA已用痘苗加帽酶加帽(Yeasen#10614/10615)。

实验方法

解冻试剂

    将 T7 RNA 聚合酶混合物短暂离心,然后放置 冰上解冻10×转录缓冲液和核苷酸s (ATP、CTP、GTP、UTP),混匀离心至管底,将10×Transcription Buffer放置室温,将4种核苷酸放置冰上。

    B.室温下组装转录反应

      按照下列体系制备反应体系:

      成分

      容量 (µL)

      最终浓度

      无 RNase H2

      最多 20

      -

      10×转录缓冲液

      2

      CTP / GTP / ATP / UTP (各 100 mM)

      各 2 个

      每个 10 毫米

      模板DNA

      1 微克

      -

      T7 RNA 聚合酶混合物

      2

      -

      笔记:

      1. 反应在室温下配置,由于10×Transcription Buffer中含有亚精胺,低温下亚精胺浓度过高可能会造成DNA模板沉淀。
        对于短转录本(<100 nt),可以使用2 µg 模板,转录时间延长至 4-8 小时。
        3. 对于长转录本(>1000 nt),建议使用线性化质粒作为转录模板。
        4. 在PCR仪上进行反应时,请打开热盖,以防止蒸发。
        5. 反应产物可能有白色沉淀。该沉淀是由 反应液中游离的焦磷酸根和镁离子不影响后续实验,若要除去可加入适量EDTA,若加入EDTA影响后续实验,也可离心回收上清液。
        6.保持试剂和容器不受RNase污染。
      C.37°C孵育2小时

      混匀各组分溶液,短暂离心至管底,37°C 反应 2h,若转录本长度不足 100nt,则延长反应时间至 4-8h。

      D.DNase I 处理(可选)

      反应完成后,每管加入2 μL DNase I(无RNase),37°C 孵育15分钟,以去除模板DNA。

      常见问题

      1. 转录产量低

      模板质量与产量密切相关,实验组产量明显低于对照组,可能原因有:

      • 实验模板中含有抑制成分;
      • 模板可能有问题。

      建议:①重新纯化模板;②确定模板定量及其完整性;③延长反应时间;④增加模板投入量;⑤使用其他启动子及 其他 RNA 聚合酶。

      1. 短转录本产量低

      模板片段太短会抑制反应,当转录产物小于100nt时,若想提高产量,可延长反应时间为4-8h或增加模板用量至2μg。

      1. RNA转录长度为 更大 比预期的

      若电泳结果显示产物条带大于预期大小,可能的原因有:①质粒模板没有完全线性化;②正义链的3’端有突出的结构;③RNA有未完全变性的二级结构。

      建议:①检查模板是否完全线性化,必要时进行额外的线性化;②选择合适的限制性内切酶,避免3'悬垂,或使用Klenow Fragment /T4 DNA聚合酶完成转录后再进行操作;③使用变性凝胶检测RNA产物。

      1. RNA转录长度为 更小 比预期的

      如果电泳结果显示产物条带小于预期大小,可能的原因 结论: 1、模板中含有与T7 RNA聚合酶终止子相似的终止序列; 2、模板中GC含量 模板太高。

      建议: ①降低反应温度(例如30℃)。有时降低温度有助于延长转录长度,但可能 降低产量。尝试其他 RNA聚合酶进行转录;②若模板GC含量高,可在42℃下反应,或加入SSB以增加产量和转录长度。

      1. 转录产物电泳拖尾

      电泳过程中出现拖尾现象可能的原因有: ① 实验操作过程中RNase污染; ②DNA模板被RNases污染。

      建议: ①使用无RNase的枪头和EP管,佩戴一次性乳胶手套和口罩,所有试剂均用无RNase的H2O.②重新纯化模板DNA。

      订购信息

      产品名称

      目录编号

      年代规格

      T7 高产量 RNA 合成试剂盒

      10623ES

      50/100/500 吨

      T7 RNA 聚合酶 GMP 级(250 U/μL)

      10625ES

      10千单位/100千单位/2500千单位/25万单位

      焦磷酸酶,无机 GMP 级 (1 U/μL)

      10620ES

      10U/100U/1000U

      小鼠 RNase 抑制剂 GMP 级 (40 U/μL)

      10621ES

      10千单位/20千单位/100千单位/100万单位

      mRNA痘苗加帽酶GMP级

      10614ES

      2KU/10KU/100KU

      mRNA Cap 2'-O-甲基转移酶 GMP 级

      10612ES

      10千单位/50千单位/250千单位

      脱氧核糖核酸酶 I (DNase I) GMP 级

      10611ES

      500/2000/10000 美国

      Hieff NGS® mRNA 分离主试剂盒

      12603ES

      24/96 吨

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