یک پیشرفت چشمگیر در آماده سازی کتابخانه RNA خاص رشته

آیا تا به حال هنگام ساخت کتابخانه RNA با شک و تردید مواجه شده اید؟ نگرانی در مورد سمیت معرف های خاص و نیاز به کار در یک محیط بدون نور می تواند کاملاً گیج کننده باشد، به ویژه هنگامی که با نمونه های متعدد سروکار داریم. اکتینومایسین D اغلب منبع این نگرانی ها بوده است، زیرا به دلیل سمیت و حساسیت به نور شناخته شده است. اما چرا اکتینومایسین D در کیت های کتابخانه گنجانده شده است؟

یافته های اخیر نشان داده است که اکتینومایسین D دارای توانایی مهار رونویسی است. این امر با اتصال به DNA در کمپلکس آغاز رونویسی به دست می‌آید و در نتیجه از طویل شدن زنجیره‌های RNA توسط RNA پلیمراز جلوگیری می‌کند. اساسا، اکتینومایسین D با فعالیت پلیمراز تداخل می کند و مانع از سنتز همزمان رشته دوم در طول فرآیند سنتز cDNA می شود. این اجازه می دهد تا از dUTP به جای dTTP در سنتز دو رشته ای استفاده شود که منجر به افزایش ویژگی زنجیره ای در ساخت کتابخانه RNA می شود.

ادغام اکتینومایسین D در کیت های ساخت کتابخانه RNA به طور غیرقابل انکاری ساخت کتابخانه های خاص رشته را بهبود بخشیده است و به طور قابل توجهی ویژگی زنجیره را افزایش می دهد. این نوآوری فرآیند آزمایشی را ساده کرده و آن را برای محققان ساده کرده است. علاوه بر این، ویژگی زنجیره را به طور قابل توجهی بهبود بخشیده است، یک جنبه محوری از تحقیقات علمی مرتبط با RNA.

با این حال، اکتینومایسین D معایبی دارد: سمیت دارد و نیاز به محافظت در برابر نور دارد. در چشم‌انداز امروزی که تقاضای فزاینده برای کیت‌های ساخت کتابخانه پیش‌آمیخته و صفحه‌ای دارد، ضرورت محافظت در برابر نور، محدودیت‌هایی در پیشرفت کیت صفحه ایجاد می‌کند.

خوشبختانه، دیگر نیازی به نگرانی در مورد اکتینومایسین D نیست. پلتفرم Yeasen ZymeEditor یک جهش یافته آنزیم MMLV را معرفی کرده است که جایگزین عملکرد اکتینومایسین D می شود. کیت بی بو، غیر سمی است و no نیاز به اجتناب نور این ویژگی زنجیره ای برتر را ارائه می دهد و نگرانی های مربوط به سلامت و حساسیت به نور را از بین می برد.

جدول 1: ویژگی های متمایز کیت های آماده سازی RNA Lib Yeasen

شکل 3. هنگام استفاده از کیت حاوی اکتینومایسین D در کنار کیت جدید فاقد اکتینومایسین D، بازده برای هر دو کیت در ورودی‌های RNA 10 نانوگرم و 1 میکروگرم قابل مقایسه بود. با این حال، در ورودی RNA 4 میکروگرم، کیت جدید بدون اکتینومایسین D بازده بالاتری را نشان داد.

شکل 4. استفاده از کیت جدید، که دارای یک جهش یافته MMLV بدون افزودن اکتینومایسین D است، منجر به ویژگی رشته برتر در مقایسه با کیتی می شود که اکتینومایسین D را در خود جای داده است. این تمایز، به ویژه در ورودی های RNA کمتر 10 نانوگرم، بارزتر می شود.

Yeasen که به ارتقای تجربه مشتری اختصاص داده شده است، همچنان به پیشرفت در حوزه کیت های کتابخانه RNA ادامه می دهد.

توصیه محصول