Ô nhiễm khí dung trong môi trường hoạt động là nguyên nhân phổ biến nhất gây ra kết quả dương tính giả trong kết quả PCR: Phát hiện tiên phong về Uracil DNA Glycosylase (UDG) của nhà khoa học người Mỹ Lindahl trong E. coli và Bacillus subtilis, và việc thiết lập hệ thống phòng ngừa ô nhiễm PCR thông qua việc sử dụng enzyme UDG với dUTP.
Các enzyme UDG có sẵn trên thị trường chủ yếu bao gồm hai loại: enzyme UDG thông thường có nguồn gốc từ Escherichia coli và Bacillus subtilis, và enzyme UDG không bền nhiệt có nguồn gốc từ vi khuẩn biển ưa lạnh. Các enzyme UDG thông thường có khả năng chịu nhiệt cao hơn, vẫn giữ lại một lượng nhỏ hoạt tính glycosylase uracil-DNA ngay cả sau khi xử lý ở 95°C trong 10 phút, điều này có thể dẫn đến sự phân hủy các sản phẩm khuếch đại mục tiêu có chứa dU. Ngoài ra, do sử dụng các chủng vi khuẩn được thiết kế (như E. coli) để biểu hiện tái tổ hợp các enzyme phân tử, nên có một lượng DNA bộ gen vật chủ còn sót lại trong các enzyme này. Cùng với ảnh hưởng của môi trường sản xuất và nguồn gốc của con người, các sản phẩm enzyme phân tử rất dễ bị nhiễm bẩn DNA. Trong quá trình phát hiện tác nhân gây bệnh, DNA bị nhiễm bẩn có thể che lấp các axit nucleic mục tiêu có hàm lượng thấp hoặc được phát hiện cùng với chúng, do đó ảnh hưởng đến việc giải thích kết quả.
Yeasen Uracil DNA Glycosylase UCF.ME (UDG/UNG), không bền với nhiệt
Sự miêu tả
Uracil DNA Glycosylase UCF.ME (UDG/UNG), không bền với nhiệt, 1 U/μL (Mã số: 14466ES) có nguồn gốc từ vi khuẩn biển ưa lạnh, đây là một loại enzyme UDG không bền nhiệt có dư lượng cực thấp được gọi là UCF.ME. Việc sử dụng sản phẩm này có thể ngăn chặn hoạt động còn lại của các enzyme UDG thông thường sau khi bất hoạt khỏi việc phân hủy các sản phẩm khuếch đại chứa dU ở nhiệt độ phòng. Nó cũng ngăn chặn vi khuẩn nền có trong các enzyme phân tử gây ra kết quả dương tính giả trong kết quả PCR. Do đó, việc đưa vào sử dụng enzyme UDG không bền nhiệt có dư lượng cực thấp UCF.ME® là rất quan trọng để xác định chính xác các tác nhân gây bệnh truyền nhiễm và hỗ trợ chẩn đoán lâm sàng các bệnh nhiễm trùng và bệnh truyền nhiễm.
Ưu điểm của sản phẩm
- Lượng dư UCF.ME cực thấp—Dư lượng DNA bộ gen của E. coli <0,1 bản sao/U;
- Lượng nuclease thấp—Không có exonuclease, enzyme cắt hoặc RNase còn sót lại;
- Khả năng tiêu hóa mạnh—0,05 U/T có thể tiêu hóa 105 bản sao/T sản phẩm dU-DNA;
- Khả năng chịu nhiệt tốt—Bất hoạt hoàn toàn ở bất kỳ điều kiện nào là 50°C trong 10 phút, 55°C trong 5 phút hoặc 95°C trong 5 phút;
- Tương thích với hệ thống phản ứng RT-qPCR—Không ảnh hưởng đến hệ thống phát hiện ngay cả ở mức đầu vào cao (hệ thống phản ứng 2U/20μL).
(1)Độ tinh khiết của protein≥95%

Nhân vật 1. Kết quả phát hiện độ tinh khiết của protein (SDS-PAGE)
(2)Nuclease dư thừa thấp: Không có Exonuclease dư thừa, Enzym cắt hoặc RNase
Nhân vật 2. Kết quả thử nghiệm dư lượng nuclease
(3)Dư lượng DNA bộ gen E. coli < 0,1 bản sao/U,mức dư lượng thấp hơn đáng kể so với thuốc thử thông thường
Nhân vật 3. Kết quả xét nghiệm dư lượng DNA bộ gen E.coli

Nhân vật 4. Tổng cộng 0,05 U enzyme UDG có thể tiêu hóa hoàn toàn 10^5 bản sao/T sản phẩm dU-DNA.

Hình 5. Sau khi xử lý bất hoạt bằng nhiệt ở 50℃,10 phút;55℃,5 phút;55℃,10 phút;95℃,5 phút, 14466ES mất khả năng tiêu hóa.

Hình 6. Hỗn hợp RT-qPCR được chuẩn bị bằng cách sử dụng hai đầu dò mồi của gen ORF1ab và N và 14466ES. Khi 14466ES được tiêm vào hệ thống phản ứng với lượng 2U/20μL, không có sự ức chế RT-qPCR sự phản ứng lại.
Khuyến nghị sản phẩm — Dòng nguyên liệu thô cho enzyme PCR có hàm lượng dư cực thấp
Định vị sản phẩm | Tên sản phẩm | Con mèo |
UDG chống ô nhiễm-nhiệt không ổn định | Uracil DNA Glycosylase UCF.ME (UDG/UNG), không bền với nhiệt, 1 U/μL | 14466ES |
Khởi động nóng Taq DNA Polymerase | Hieff UCF.ME Hotstart Nhạy Cảm Taq DNA Polymerase (5 U/μL) | 14314ES |
Phiên mã ngược | Hifair UCF.ME V Phiên mã ngược (200 U/μL) | 14608ES |
Chất ức chế RNase ở chuột | 14672ES |