——更多基因分型,更少时间和更少试剂

PCR基因分型等实验通常需要从样本中纯化基因组DNA。当需要检测的样本较多时,纯化基因组DNA的过程耗时、重复且成本高昂。 Yeasen 生物通过改造Taq DNA聚合酶、优化PCR反应体系,无需进行基因组纯化,开发了一系列Direct PCR Kit产品。

智能 PCR:直接 PCR

Yeasen公司的直接PCR试剂盒直接从样本开始,使用极少量的原始样本(图1-A)或其裂解产物(图1-B)而无需基因组纯化作为基于PCR的基因分型的模板(图1)。与传统的基于PCR的基因分型相比,直接PCR试剂盒使用样本量少,操作简单,实验成本低,并可进行高通量样本检测。

图1 直接PCR扩增工作流程

A.直接法:取少量样本直接加入PCR Master Mix中进行PCR鉴定。
B.裂解法:取样后,将样本加入裂解液中,裂解并释放基因组DNA,取少量裂解上清加入PCR Master Mix中进行PCR鉴定。

技术优势

直接:无需耗时且昂贵的 DNA 纯化。
快速:10分钟完成模板制备,30分钟完成PCR反应。
简单:无需切割或研磨即可裂解样品,并且 PCR 混合物处于预混合形式,从而减少了移液步骤的数量。
节省:所用材料量少。
高通量:裂解反应可在96孔板中完成。
抗抑制:对各种动物、植物样品有耐受性。

Direct PCR Kit实验流程

该系列产品采用独特的蛋白酶裂解系统对样本进行裂解,裂解液可直接作为模板,搭配试剂盒提供的PCR Master Mix进行基因扩增。

图2 小鼠组织直接PCR实验流程

如图。3 植物组织直接PCR实验流程

直接 PCR 产品选择表

产品系列

小鼠直接PCR第二代

小鼠直接PCR第一代

血液直接 PCR

植物直接PCR

产品编号

10189ES

10185ES

10188ES

10187ES

规格

20 吨/50 吨/200 吨/500 吨

50吨/200吨

20 吨/50 吨/200 吨/500 吨

50吨/200吨

特征

扩增子长度

≤5kb

≤1kb

≤8kb

≤1kb

延伸时间 (s/kb)

3-20秒

30 秒

≤2kb:3-5秒

≤8kb:10秒

60 秒

适用生物

小鼠、大鼠

小鼠、大鼠

人类、老鼠、山羊、鸡、猪等。

大米、玉米、烟草、油菜籽、小麦、大豆等。

适用组织/材料类型

老鼠尾巴、老鼠耳朵、脚趾(带肌肉)等器官

老鼠尾巴、老鼠耳朵、脚趾(带肌肉)等器官

含有常见抗凝剂(如 EDTA、肝素、柠檬酸盐)的新鲜血液、冷藏(冷冻)血液以及商用干血斑(如 Whatman903)® 和自由贸易协定®

嫩叶、老叶、幼苗、嫩茎

示例用法

组织:5 毫克 鼠尾:1-5 毫米

组织:5-10 毫克 鼠尾:1-5 毫米

全血:0。5%-20% 沃特曼® 干血斑:1 mm2

叶:1-10毫米 种子:1-3毫米

基因组释放时间

5-10分钟

15 分钟

0-3分钟

0-10 分钟

产品最终结构

钝端

钝端

钝端

钝端

退火温度

温度-(2~5)℃

温度-(2~5)℃

温度-(1~2)℃

温度-(2~5)℃

GC 裁剪范围

29-70%

30-70%

30-75%

40-65%

5'-3' 核酸外切酶活性

是的

是的

是的

是的

应用

基因分型

是的

是的

是的

是的

多重PCR

最多 5X

最多 3-4 倍

直接样本扩增

是的

是的

是的

是的

其他功能

电泳指示剂

无色

蓝色的

无色

蓝色的

热启动

是的

是的

是的

是的

预混/套装

套件(含混合料)

套件(含混合料)

套件(含混合液+缓冲液)

套件(含混合料)

产品优势

改良的Taq DNA聚合酶是直接PCR的保证:它对抑制剂有超强的耐受性。

使用未纯化样本作为模板时,会引入许多抑制PCR反应的成分,使用普通的PCR反应体系和Taq DNA聚合酶很难达到理想的结果,甚至无法进行PCR扩增。本系列试剂盒中的PCR Mix是经过配方优化的预混液,采用改良的Taq DNA聚合酶,增加了与模板DNA的结合能力,对常见的PCR抑制剂具有更高的耐受性,从而具有更广泛的模板适应性。

图4 Direct PCR Kit中的PCR Mix对杂质的耐受性较高。 采用相同量的模板,用不同的PCR Mixes进行PCR,并在体系中添加不同浓度的PCR反应抑制剂,比较不同条件下PCR产物的量。

宜生 针对不同的样品开发了一系列的产品:

  • 一、啮齿类特异性:小鼠组织直接 PCR 试剂盒 Plus (10189ES)

适用样本:小鼠组织(如小鼠尾巴、小鼠耳朵、小鼠脚趾等)

  • 扩增效率高(长度、速度、GC 兼容性)

图5 小鼠组织直接PCR试剂盒Plus扩增不同组织裂解物。1:质粒;2:小鼠耳;3:小鼠尾;4:肝脏。裂解条件:70℃裂解10分钟,95℃灭活5分钟。目的片段为1 千字节, 2 千字节, 3 kb和6 kb,延伸时间分别设置为 3、5、10 和 20 秒/kb。M: 10510ES60 (Yeasen)。

  • 广泛的模板兼容性(10189ES)

图6 使用小鼠组织直接 PCR 试剂盒 Plus 直接裂解(70°C,10 分钟)并扩增人 293 细胞 (1)、唾液 (2)头皮组织 (3)所有样品均显示出清晰的目标条带,M:10510ES60(Yeasen)。

  • II. 多物种血液通用型:血液高级直接PCR试剂盒(10188ES)
  • 扩增长度可达 8 kb

图7 使用Blood Advanced Direct PCR Kit从人全血中直接扩增不同长度的DNA片段。血液样本保存在-20℃,以EDTA为抗凝剂。血液模板浓度为10%,延伸时间设置为10秒/kb。M:10510ES60(Yeasen)。

  • 高耐受性

图8A: 使用Blood Advanced Direct PCR Kit从人EDTA抗凝全血中直接扩增2kb、GC含量71%的DNA片段,血液模板浓度0.5-50%梯度设置,延伸时间设置为10sec/kb。B: Blood Advanced Direct PCR Kit用于从小鼠EDTA抗凝全血中直接扩增GC含量为67%的2.2kb DNA片段。血液模板浓度设置为0.5-50%,延伸时间为10秒/kb。M:10510ES60 (Yeasen)。

  • III. 植物特异性类型:植物组织直接 PCR 试剂盒(10187ES)
  • 已通过多种植物样本验证

图9 不同植物叶片组织直接扩增结果。M:100 bp DNA ladder。C:以相应植物的纯化基因组DNA为模板。1-2:以叶片组织裂解液为模板。循环数:30个循环。

客户案例

  • 一、小鼠基因型鉴定

广州某生物公司:

图10 使用Mouse Direct PCR Kit (10189ES) 扩增小鼠尾部。目的基因:500 bp;裂解时间:10 min;PCR反应体系:25 μL,延伸时间:5 sec/kb。

  • 二、水稻基因直接扩增

二十 大学

图11 使用Plant Direct PCR Kit(10187ES)扩增水稻相关基因。

R兴高采烈 产品

产品定位

产品名称

产品编号

产品规格

高品质琼脂糖

琼脂糖

10208ES60/76

100克/500克

核酸染色(紫外光下)

YeaRed 核酸凝胶染色剂(10,000× 水中)

10202ES76

500 μL

PCR快速升级,可进行菌落PCR,适合复杂模板扩增

2×希夫商标 超快速 II 热启动 PCR 预混液

10167ES03/08

1毫升/5×1毫升

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