Yeasen と Molefuture が分子生物学の課題を克服する先進的な T4 DNA リガーゼを導入

Yeasen と Molefuture は、ZymeEditor プラットフォームを使用して最先端の T4 DNA リガーゼを共同開発し、次世代シーケンシング (NGS) 用の分子生物学と DNA ライブラリ構築における重要な問題に取り組んでいます。従来の T4 DNA リガーゼは、安定性の低さ、アダプター ダイマー形成の多さ、DNA フラグメントの自己連結の多さなどの課題に直面しています。この新しい酵素は、これらの制限を克服することを目指しています。

ATP 依存性酵素である T4 DNA リガーゼは、コンパクトらせん DNA 結合ドメイン (DBD)、ヌクレオチジルトランスフェラーゼ (NTase) ドメイン、および OB フォールドドメインを特徴としています。タンパク質構造を分析することで、研究者は DNA 基質の 5 ~ 20 Å 以内の重要な残基を特定しました。高度な計算ツール、in silico スクリーニング、構造機能分析を使用して、構造機能の洞察を組み込んだコンセンサス配列アライメントを通じて変異体を設計しました。

チームは合理的な設計に加えて、指向性進化に MTPS 法を採用し、10,000 を超える変異体の安定性、活性、残留活性をスクリーニングしました。有望な候補は、厳格な精製とテストを受けました。その後、詳細な特性評価が行われ、活性、安定性、アダプターの自己連結、DNA フラグメントの自己連結、DNA 収量が評価されました。

研究者らは、DNA の合理的設計と G1 変異体の誘導変異を組み合わせて、多様な用途に適した優れた変異体を開発しました。この包括的なアプローチにより、非常に効率的で信頼性の高い T4 DNA リガーゼが誕生し、NGS における分子生物学研究と DNA ライブラリ構築の強化が期待されます。

図 1. Versatility T4 DNA リガーゼの進化を示しています。(A) T4 DNA リガーゼの合理的な設計。(B) 45℃ での耐熱性 T4 DNA リガーゼ変異体のスクリーニング。これにより、比活性が大幅に向上した変異体が特定されました。(C) DNA ライブラリ調製中のアダプター二量体形成を減らすことを目的とした T4 DNA リガーゼ変異体のスクリーニング。(D) DNA ライブラリ調製法を使用して 42℃ で 1 時間熱処理した後のライブラリ収量保持の評価。
表 1. Yeasen Versatile T4 DNA リガーゼは耐熱性があります。酵素を 30℃ で 5 日間処理し、DNA Lib Prep 法で分析しました。
図 2. Yeasen Versatile T4 DNA リガーゼは、野生型 (WT) T4 DNA リガーゼと比較して忠実度が高く、自己ミスライゲーションによるアダプター二量体形成が少ないことが DNA Lib Prep 法で分析された (A) および (B) で示されています。
図 3. Yeasen Versatile T4 DNA リガーゼは、DNA Lib Prep 法で分析された耐熱性リガーゼを含む市販の T4 DNA リガーゼと比較して、アダプター二量体形成が最も低いことを示しています。
 
この画期的な成果は、Yeasen 氏と Molefuture 社の酵素工学における革新と卓越性への取り組みを実証しています。

注文情報

名前 猫# 注記
酵素 Hieff™ 多用途 T4 DNA リガーゼ (600 U/µL) 12996ES 耐熱性と高い忠実性を備えた腫瘍遺伝子検出
DNA Hieff NGS® DNA ライブラリ準備キット 13577ES 腫瘍/メカニック法
Hieff NGS® OnePot Pro DNA ライブラリ準備キット V2 12194ES 腫瘍/酵素法
Hieff NGS® OnePot II DNA ライブラリ準備キット(Illumina 用) 13490ES Pathgen/酵素/通常時間(140分)
Hieff NGS® OnePot フラッシュ DNA ライブラリ準備キット 12316ES Pathgen/酵素/超高速(100分)
Hieff NGS® DNA&RNA ライブラリー Co-Prep キット V2 12305ES Pathgen/酵素/DNAとRNAの共同調製
RNA Hieff NGS® Ultima デュアルモード mRNA ライブラリ調製キット 12308ES オリゴdT磁気ビーズなし、チューブ11本
Hieff NGS® Ultima デュアルモード mRNA ライブラリ調製キット 12309ES オリゴ dT 磁気ビーズ プラス、14 チューブ
Hieff NGS® Ultima デュアルモード RNA ライブラリ調製キット 12310ES プレミックスバージョン、5本入り
Hieff NGS ® EvoMax RNA ライブラリ調製キット(プレミックス版)(アクチノマイシン D フリー) 12340ES プレミックスバージョン(アクチノマイシンDフリー)
Hieff NGS® MaxUp rRNA 除去キット (植物) 12254ES 植物
Hieff NGS® MaxUp ヒト rRNA 除去キット (rRNA & ITS/ETS) 12257ES 人間

この酵素と他のトップクラスの耐熱性および従来の T4 DNA リガーゼとの性能比較データについてお問い合わせいただくには、メッセージを残してください。

Molefuture Biotechnologyについて

Molefuture Biotechnology は Yeasen Biotechnology (Shanghai) Co., Ltd. の子会社で、酵素進化技術を駆使したカスタマイズされた酵素修飾ソリューションの提供を専門としています。 Yeasen Biotechnology のリソースを活用し、Molefuture は 6 つの主要な技術プラットフォームを運営しています。革新的な酵素進化プラットフォーム ZymeEditor、マルチホスト高効率発現プラットフォーム、発酵プロセス開発プラットフォーム、精製プロセス開発プラットフォーム、超クリーン酵素生産プラットフォーム、酵素分析および品質管理プラットフォームです。 これら 6 つの技術プラットフォームにより、Molefuture は酵素指向進化、新しい酵素開発、酵素プロセス開発、GMP レベルのスケールアップ生産など、カスタマイズされたソリューションの完全なセットを提供でき、体外診断、バイオメディカル、合成生物学、医療美容、医薬品中間体などの分野における酵素のアプリケーション需要を満たすことができます。

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