Вы когда-нибудь сталкивались с сомнениями при создании библиотеки РНК? Опасения по поводу токсичности некоторых реагентов и необходимости работать в среде без света могут быть довольно озадачивающими, особенно при работе с многочисленными образцами. Актиномицин D часто был источником этих опасений, так как он известен своей токсичностью и светочувствительностью. Но почему актиномицин D включен в наборы библиотек?
Недавние открытия показали, что актиномицин D обладает способностью ингибировать транскрипцию. Он достигает этого, связываясь с ДНК в комплексе инициации транскрипции, тем самым предотвращая удлинение цепей РНК РНК-полимеразой. По сути, актиномицин D препятствует активности полимеразы, препятствуя одновременному синтезу второй цепи в процессе синтеза кДНК. Это позволяет использовать dUTP вместо dTTP в двухцепочечном синтезе, что приводит к повышению специфичности цепи при построении библиотеки РНК.
Включение актиномицина D в наборы для создания библиотек РНК, несомненно, улучшило создание библиотек, специфичных для цепей, значительно повысив специфичность цепи. Это нововведение упростило экспериментальный процесс, упростив его для исследователей. Более того, оно существенно улучшило специфичность цепи, ключевой аспект научных исследований, связанных с РНК.

Однако у актиномицина D есть свои недостатки: он токсичен и требует защиты от света. В сегодняшнем ландшафте растущего спроса на предварительно смешанные и пластинчатые наборы для создания библиотек необходимость защиты от света накладывает ограничения на развитие пластинчатых наборов.
К счастью, больше нет необходимости беспокоиться об актиномицине D. Платформа Yeasen ZymeEditor представила новаторский мутант фермента MMLV, который заменяет функцию актиномицина D. Этот новый Комплект не имеет запаха, нетоксичен и не содержитo нужно избегать свет. Он обеспечивает превосходную специфичность цепи, устраняя проблемы, связанные со здоровьем и чувствительностью к свету.

12301ES | 12308ES | 12310ES | 12340ES | |
Актиномицин D | √ | √ | √ | × |
МГИ | × | √ | √ | √ |
Иллюмина | √ | √ | √ | √ |
Премикс | × | × | √ | √ |
Количество компонентов | 10 | 10 | 6 | 5 |
Год выпуска | 2017 | 2021 | 2022 | 2023 |
Таблица 1: Отличительные особенности наборов RNA Lib Prep от Yeasen
Рисунок 3. При использовании набора, содержащего актиномицин D, вместе с новым набором, не содержащим актиномицин D, выходы обоих наборов были сопоставимы при вводе РНК 10 нг и 1 мкг. Однако при вводе РНК 4 мкг новый набор без актиномицина D показал более высокие выходы.
Рисунок 4. Использование нового набора, включающего мутант MMLV без добавления актиномицина D, обеспечивает более высокую специфичность цепи по сравнению с набором, включающим актиномицин D. Это различие становится более выраженным, особенно при более низких концентрациях РНК — 10 нг.
Компания Yeasen, стремящаяся улучшить качество обслуживания клиентов, продолжает открывать новые горизонты в области наборов для создания библиотек РНК.
Рекомендация по продукту
Имя | Кот# | Размер |
Набор для подготовки библиотеки РНК Hieff NGS ® EvoMax (специфичный для цепи) | 12340ES24/96 | 24 Т/ 96 Т |
Хифф НГС™ Ультима Двойной режим мРНК Библиотека Подготовка Набор | 12308ES24/96 | 24 Т/ 96 Т |
12629ES24/96 | 24 Т/ 96 Т | |
Набор для истощения человеческой рРНК Hieff NGS MaxUp (человек/мышь/крыса) | 12257ES24/96 | 24 Т/ 96 Т |
12254ES24/96 | 24 Т/ 96 Т | |
12806ES24/96 | 24 Т/ 96 Т |