هل سبق لك أن واجهت شكوكًا أثناء إنشاء مكتبة RNA؟ يمكن أن تكون المخاوف بشأن سمية بعض الكواشف والحاجة إلى العمل في بيئة خالية من الضوء محيرة للغاية، خاصة عند التعامل مع العديد من العينات. غالبًا ما كان الأكتينوميسين د مصدرًا لهذه المخاوف، لأنه معروف بسميته وحساسيته للضوء. ولكن لماذا يتم تضمين الأكتينوميسين د في مجموعات المكتبة؟

كشفت النتائج الحديثة أن الأكتينوميسين د يمتلك القدرة على تثبيط النسخ. ويحقق ذلك من خلال الارتباط بالحمض النووي في مجمع بدء النسخ، وبالتالي منع استطالة سلاسل الحمض النووي الريبي بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبي. وبشكل أساسي، يتداخل الأكتينوميسين د مع نشاط البوليميراز، مما يعيق التخليق المتزامن للشريط الثاني أثناء عملية تخليق الحمض النووي الريبي التكميلي. وهذا يسمح باستخدام dUTP بدلاً من dTTP في التخليق ثنائي الشريط، مما يؤدي إلى تحسين خصوصية السلسلة في بناء مكتبة الحمض النووي الريبي.

لا شك أن دمج الأكتينوميسين د في مجموعات بناء مكتبة الحمض النووي الريبي قد أدى إلى تحسين بناء المكتبات الخاصة بالسلاسل، مما أدى إلى تحسين خصوصية السلسلة بشكل كبير. وقد أدى هذا الابتكار إلى تبسيط العملية التجريبية وتبسيطها للباحثين. وعلاوة على ذلك، فقد أدى إلى تحسين خصوصية السلسلة بشكل كبير، وهو جانب محوري في الاستفسارات العلمية المتعلقة بالحمض النووي الريبي.

الشكل 1: نتائج الاختبار المقارنة حسب شركة NEB: تأثير أكتينوميسين د.
تكشف البيانات الموضحة في الرسم البياني عن نتيجة ملحوظة. فقد تم محاذاة أكثر من 90% من القراءات مع السلسلة ذات المعنى الإيجابي المتوقعة، مما يوضح خصوصية السلسلة الممتازة لمكتبة التسلسل التي تتضمن الأكتينوميسين د. (من موقع NEB على الويب)

ومع ذلك، فإن الأكتينوميسين د له عيوبه: فهو يظهر سمية ويتطلب الحماية من الضوء. وفي ظل المشهد الحالي الذي يشهد زيادة في الطلب على مجموعات بناء المكتبات الجاهزة والألواح، فإن ضرورة الحماية من الضوء تفرض قيودًا على تطورات مجموعات الألواح.

لحسن الحظ، لم يعد هناك داعٍ للقلق بشأن الأكتينوميسين د. فقد قدمت منصة Yeasen ZymeEditor طفرة إنزيمية رائدة في MMLV تحل محل وظيفة الأكتينوميسين د. المجموعة خالية من الرائحة وغير سامة وغير ضارة.أوه بحاجة إلى تجنب الضوء. فهو يوفر خصوصية فائقة للسلسلة، مما يزيل المخاوف المتعلقة بالصحة وحساسية الضوء.

الشكل 2: هندسة MMLV لتحديد طفرات MMLV التي يمكن أن تساهم في Standed RNA-seq

12301ES

12308ES

12310ES

12340ES

أكتينوميسين د

×

إم جي آي

×

إلومينا

خليط مسبق

×

×

كمية المكونات

10

10

6

5

سنة الإصدار

2017

2021

2022

2023

الجدول 1: السمات المميزة لمجموعات تحضير مكتبة RNA من Yeasen

الشكل 3. عند استخدام الطقم الذي يحتوي على أكتينوميسين د إلى جانب الطقم الجديد الذي يفتقر إلى أكتينوميسين د، كانت النتائج متشابهة لكلا الطقمين عند مدخلات RNA بمقدار 10 نانوجرام و1 ميكروجرام. ومع ذلك، عند مدخلات RNA بمقدار 4 ميكروجرام، أظهرت الطقم الجديد الذي لا يحتوي على أكتينوميسين د نتائج أعلى.

الشكل 4. يؤدي استخدام المجموعة الجديدة، التي تحتوي على طفرة MMLV دون إضافة أكتينوميسين د، إلى تحقيق خصوصية فائقة للخيوط مقارنة بالمجموعة التي تحتوي على أكتينوميسين د. ويصبح هذا التمييز أكثر وضوحًا، وخاصة عند مدخلات RNA المنخفضة البالغة 10 نانوغرام.

تستمر شركة Yeasen، المتخصصة في تحسين تجربة العملاء، في فتح آفاق جديدة في مجال مجموعات مكتبة RNA.

توصية المنتج

اسم

قطة#

مقاس

مجموعة تحضير مكتبة Hieff NGS ® EvoMax RNA (خاصة بالسلسلة)

12340ES24/96

24 طن/ 96 طن

هييف الجيل التالي من نظام الجيل التالي من أنظمة ... ألتيما الوضع المزدوج الرنا المرسال مكتبة التحضير عدة

12308ES24/96

24 طن/ 96 طن

مجموعة عزل mRNA من Hieff NGS® الإصدار 2

12629ES24/96

24 طن/ 96 طن

مجموعة استنفاد الرنا البشري Hieff NGS MaxUp (الإنسان/الفأر/الجرذ)

12257ES24/96

24 طن/ 96 طن

مجموعة استنفاد rRNA من Hieff NGS® MaxUp (نبات)

12254ES24/96

24 طن/ 96 طن

مسبار استنفاد mRNA للغلوبين (البشري)

12806ES24/96

24 طن/ 96 طن

سؤال