大肠杆菌 宿主细胞DNA残留检测试剂盒2G

资格概要(类别编号:41308ES60)

  1. 背景

本报告中总结的数据由 Yeasen 生物技术针对“大肠杆菌宿主细胞DNA残留检测试剂盒(2G)”产品。摘要数据仅供用户参考,用户需自行验证宿主细胞残留 DNA方法通过使用自己的样本来确认该方法是否符合用户的要求。建议所有使用该试剂盒的实验室验证以下参数:线性、范围、准确度、精密度、定量限、特异性和稳健性。

Yeasen 生物技术公司可以提供该试剂盒的详细鉴定报告。如果用户使用此报告,则仅需评估其适用性(包括精密度、 准确性 应验证其有效性和特异性。

  1. 实验材料和方法

2.1 大肠杆菌宿主细胞 DNA 残留检测试剂盒 (2G),供应商: Yeasen,货号:41308ES60。

2.2 MolPure® 磁性残留 DNA 样本制备试剂盒,供应商: Yeasen,货号:18461ES60。

2.3 大肠杆菌DNA含量国家标准:Cat.270027,批号:201101,浓度:96.2μg/mL,保存条件:-70℃,购自:中国食品药品检定研究院。

2.4 原始资料:电子版记录于《实验报告》 父文件“大肠杆菌宿主细胞DNA残留检测试剂盒(2G)”的子文件。

2.5 方法:实验所用材料及操作方法基本由 Yeasen 经过长期评估和验证的生物技术,试剂盒的开发和生产均遵循ISO 13485体系。

  1. 资格审查内容及结果

3.1 检测范围

试剂盒的线性范围为30 fg/μL~300 pg/μL,R2=1,扩增效率为101.74%,各浓度实验CV<15%。

图 1 大肠杆菌 DNA (2G) qPCR 标准曲线

3.2 准确性

3.2.1 偏离 大肠杆菌DNA含量国家标准

试剂盒中每批大肠杆菌DNA标准物质均采用大肠杆菌DNA含量国家标准进行校准。 Yeasen DNA标准物质与大肠杆菌DNA含量国家标准基本无偏差 校准曲线,测定值偏差<5%。

3.22 R生态恢复

3.2.2.1 空白样品加标回收率实验

分别制备高、低浓度E.coli DNA标准样品:300 pg/μL、3 pg/μL、30 fg/μL,采用磁珠法残留DNA样品前处理试剂盒提取后进行测定(每个样品重复2次提取,每次提取重复3次测定),并分析样品回收率及CV。

对于不同浓度的DNA样品,回收率为70%~130%,CV均<20%。

样品类型

理论浓度

提取 1 个均值

提取 2 个均值

平均浓度

简历

恢复

空白样品

/

/

/

/

/

/

恢复示例 1

300 皮克/微升

250.56 皮克/微升

262.11 皮克/微升

256.33 皮克/微升

4.41%

85.44%

恢复示例 2

3皮克/微升

2.29 皮克/微升

2.56 皮克/微升

2.42 皮克/微升

7.09%

80.77%

恢复示例 3

30 微克/微升

33.62 克/微升

32.61 克/微升

33.12 克/微升

14.28%

110.39%

表1 空白样品加标回收率

3.2.2.2 模拟样品加标回收实验

用5种不同的背景溶液(高蛋白、高核酸、高和低pH、高盐)提取相同浓度(3 pg/μL E.coli DNA)的样品(每个样品进行2次重复提取,每次提取进行3次重复测定),并分析样品回收率和CV。

不同背景溶液的 DNA 样本回收率范围为 70% 至 130%,所有 CV 均 <20%。

样品类型

理论浓度

提取 1 个均值

提取 2 个均值

平均浓度

简历

恢复

基本示例

/

/

/

/

/

/

高蛋白

3皮克/微升

2.25

2.23

2.24

1.09%

74.74%

高核酸

3.93

3.96

3.95

1.56%

131.52%

高盐

2.69

2.67

2.68

2.63

89.20%

高 pH 值

2.90

3.67

3.二十九

13.82%

109.55%

低 pH 值

2.77

2.87

2.82

3.41%

94.01%

表 2 基本样品加标回收率

3.3 精度

3.3.1 重复性

对浓度为 3 pg/μL 的 E.coli DNA 标准重复测定 10 次,CV <15%。

重复

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

意思是

简历

检测值 (fg/μL)

3.16

2.87

2.97

2.86

2.81

2.97

3.14

3.21

3.14

3.1

3.02

4.78%

表3 重复性结果

3.32 中间精度

三位实验人员独立检测了高、低浓度300 pg/μL、3 pg/μL、30 fg/μL的E.coli DNA标准样品,每个浓度做了三次重复实验,所得9个数据的CV均<15%。

经验值

实际浓度

理论浓度

大肠杆菌 DNA (2G)

300 皮克/微升

3皮克/微升

30 微克/微升

实验 1

决定 1

295.65

3.22

26.90

决定 2

287.71

3.24

32.00

决定 3

300.23

3.17

27.50

实验 2

决定 4

306.06

3.13

37.30

决定 5

299.76

3.02

32.70

决定 6

299.63

3.02

34.00

实验 3

决定 7

266.70

3.01

35.90

决定 8

272.89

3.09

40.70

决定 9

276.51

3.01

35.20

/

意思是

289.46

3.10

33.60

/

简历

4.89%

3.02%

13.18%

表4 中间精密度结果

3.4 特异性

对生物制品生产中常用的细胞基因组DNA对大肠杆菌DNA检测试剂的干扰进行了评价,干扰组与对照组重叠,未见到干扰(下图依次为HEK293、Vero、CHO基因组DNA对大肠杆菌DNA检测试剂的干扰数据)。

图2 干扰实验结果

3.5 定量限

对大肠杆菌DNA进行50 fg/μL、40 fg/μL、30 fg/μL、10 fg/μL、5 fg/μL的检测,每个浓度重复10次,结果显示30 fg/μL及以上浓度的CV<20%,即大肠杆菌宿主细胞DNA残留检测试剂盒(2G)的定量限为30 fg/μL。

重复

测试项目

大肠杆菌 DNA (2G) (fg/μL)

数量

重新计算比率

1

29.43

98.09%

2

29.51

98.35%

3

32.04

106.79%

4

26.07

86.89%

5

34.06

113.53%

6

33.54

111.79%

7

26.95

89.82%

8

27.38

91.26%

9

27.04

90.13%

10

26.10

87.02%

意思是

29.21

/

简历

10.40%

/

图3 30fg/μL E.coli DNA(2G)qPCR检测结果

3.6 稳健性

本套件已经过测试,适用于(但不限于)以下仪器:

小贩

仪器型号

扩增效率

R2

定量限(fg/μL)

简历

澳大利亚商业信息局 7500

101.74%

1

三十

13.30%

ABI QuantStudio5

100.46%

1

三十

12.40%

伯乐

CFX96

99.20%

0.999

三十

13.76%

上海红石

斯兰

100.40%

0.999

三十

11.67%

表5 仪器适用性试验结果

3.7 稳定性

3.7.1 冻融稳定性

大肠杆菌宿主细胞DNA残留检测试剂盒(2G)经10次反复冻融测试,试剂盒性能未受影响。

测试指标

冻融时间

范围

T0时间

冻融10次

标准曲线参数

扩增效率

98.23%

100.20%

R2

1

0.999

定量限(30 fg/μL)

简历

15.07%

9.66%

表6 冻融稳定性结果分析

3.72 加速稳定性

E.coli 宿主细胞 DNA 残留检测试剂盒(2G)分别在 2~8°C 下保存 30 天和在 37°C 下保存 14 天。试剂盒的性能均未受到影响。

测试指标

加速温度和时间

范围

实验 1

实验 2

T0时间

2~8℃ 30 天

T0时间

37℃ 14天

标准曲线参数

扩增效率

97.77%

99.81%

98.39%

98.65%

R2

1

1

1

1

定量限 (30 fg/μL)

简历

11.04%

13.79%

9.55%

14.55%

表7 加速稳定性结果分析

  1. 4参考

4.1 国家药典委员会. 中华人民共和国药典(三部)[S]. 北京:中国医药科技出版社,p.542-543, 2020.

4.2国家药品监督管理局,2007年:《生物制品质量控制分析方法验证技术审查通则》。

4.3 ICH(2022)《分析方法验证Q2》,征求意见稿。

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