大腸桿菌 宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒2G

資格摘要(類別編號:41308ES60)

  1. 背景

本報告中總結的數據由 Yeasen '大腸桿菌宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒(2G)'產品的生物技術。匯總資料僅供用戶參考,用戶需自行驗證宿主細胞殘留 DNA方法透過使用自己的樣本來確認該方法是否可以滿足使用者的要求。建議所有使用此試劑盒的實驗室驗證以下參數:線性、範圍、準確度、精確度、定量限、特異性和穩健性。

Yeasen 生物技術可以提供此試劑盒的詳細鑑定報告。如果使用者使用此報告,則只有適用性(包括精確度、 準確性 應驗證其有效性和特異性。

  1. 實驗材料與方法

2.1 大腸桿菌宿主細胞 DNA 殘留檢測試劑盒 (2G),供應商: Yeasen,貨號:41308ES60。

2.2 MolPure® 磁性殘留 DNA 樣本製備試劑盒,供應商: Yeasen,貨號:18461ES60。

2.3 大腸桿菌DNA含量國家標準:Cat. 270027,批號:201101,濃度:96.2 μg/mL,儲存條件:-70℃,購自:中國食品藥品檢驗研究院。

2.4 原文資料:電子版記錄於《實驗報告》 父親文件「大腸桿菌宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒(2G)」的子文件。

2.5 方法:實驗所用材料及操作方法基本由 Yeasen 經過長期評估和驗證的生物技術,試劑盒的開發和生產均遵循ISO 13485系統。

  1. 資格審查內容及結果

3.1 檢測範圍

試劑盒的線性範圍為30 fg/μL~300 pg/μL,R2=1,擴增效率為101.74%,各濃度實驗CV<15%。

圖 1 大腸桿菌 DNA (2G) qPCR 標準曲線

3.2 準確性

3.2.1 偏離 大腸桿菌DNA含量國家標準

試劑盒中每批大腸桿菌DNA標準物質均以大腸桿菌DNA含量國家標準進行校正。 Yeasen DNA標準物質與大腸桿菌DNA含量國家標準基本無偏差 校準曲線,測定值偏差<5%。

3.22 R生態恢復

3.2.2.1 空白樣品加標回收率實驗

分別製備高、低濃度E.coli DNA標準樣本:300 pg/μL、3 pg/μL、30 fg/μL,以磁珠法殘留DNA樣本前處理試劑盒萃取後測定(每個樣本重複2次萃取,每次萃取重複3次測定),分析樣本回收率及CV。

對於不同濃度的DNA樣品,回收率為70%~130%,CV均<20%。

樣品類型

理論濃度

提取 1 個均值

提取 2 個均值

平均濃度

履歷

恢復

空白樣品

/

/

/

/

/

/

恢復範例 1

300 皮克/微升

250.56 皮克/微升

262.11 皮克/微升

256.33 皮克/微升

4.41%

85.44%

恢復範例 2

3皮克/微升

2.29 皮克/微升

2.56 皮克/微升

2.42 皮克/微升

7.09%

80.77%

恢復範例 3

30 微克/微升

33.62 克/微升

32.61 克/微升

33.12 克/微升

14.28%

110.39%

表1 空白樣品加標回收率

3.2.2.2 模擬樣品加標回收實驗

以5種不同的背景溶液(高蛋白、高核酸、高和低pH、高鹽)萃取相同濃度(3 pg/μL E.coli DNA)的樣本(每個樣本進行2次重複萃取,每次萃取進行3次重複測定),並分析樣本回收率和CV。

不同背景溶液的 DNA 樣本回收率範圍為 70% 至 130%,所有 CV 均 <20%。

樣品類型

理論濃度

提取 1 個均值

提取 2 個均值

平均濃度

履歷

恢復

基本範例

/

/

/

/

/

/

高蛋白

3皮克/微升

2.25

2.23

2.24

1.09%

74.74%

高核酸

3.93

3.96

3.95

1.56%

131.52%

高鹽

2.69

2.67

2.68

2.63

89.20%

高 pH 值

2.90

3.67

3.二十九

13.82%

109.55%

低 pH 值

2.77

2.87

2.82

3.41%

94.01%

表 2 基本樣品加標回收率

3.3 精度

3.3.1 重複性

濃度為 3 pg/μL 的 E.coli DNA 標準重複測定 10 次,CV <15%。

重複

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

意思是

履歷

檢測值 (fg/μL)

3.16

2.87

2.97

2.86

2.81

2.97

3.14

3.21

3.14

3.1

3.02

4.78%

表3 重複性結果

3.32 中間精度

三位實驗人員獨立檢測了高、低濃度300 pg/μL、3 pg/μL、30 fg/μL的E.coli DNA標準樣品,每個濃度做了三次重複實驗,所得9個數據的CV均<15%。

經驗值

實際濃度

理論濃度

大腸桿菌 DNA (2G)

300 皮克/微升

3皮克/微升

30 微克/微升

實驗 1

決定 1

295.65

3.22

26.90

決定 2

287.71

3.24

32.00

決定 3

300.23

3.17

27.50

實驗 2

決定 4

306.06

3.13

37.30

決定 5

299.76

3.02

32.70

決定 6

299.63

3.02

34.00

實驗 3

決定 7

266.70

3.01

35.90

決定 8

272.89

3.09

40.70

決定 9

276.51

3.01

35.20

/

意思是

289.46

3.10

33.60

/

履歷

4.89%

3.02%

13.18%

表4 中間精密度結果

3.4 特異性

對生物製品生產中常用的細胞基因組DNA對大腸桿菌DNA檢測試劑的干擾進行了評價,幹擾組與對照組重疊,未見到干擾(下圖依次為HEK293、Vero、CHO基因組DNA對大腸桿菌DNA檢測試劑的干擾數據)。

圖2 幹擾實驗結果

3.5 定量限

以 50 fg/μL、40 fg/μL、30 fg/μL、10 fg/μL 和 5 fg/μL 的濃度檢測大腸桿菌 DNA,每個濃度重複 10 次。結果表明,濃度為30 fg/μL及以上時,CV<20%。即E.coli宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒(2G)的定量極限為30fg/μL。

重複

測試項目

大腸桿菌 DNA (2G) (fg/μL)

數量

重新計算比率

1

29.43

98.09%

2

29.51

98.35%

3

32.04

106.79%

4

26.07

86.89%

5

34.06

113.53%

6

33.54

111.79%

7

26.95

89.82%

8

27.38

91.26%

9

27.04

90.13%

10

26.10

87.02%

意思是

29.21

/

履歷

10.40%

/

圖3 30fg/μL E.coli DNA(2G)qPCR檢測結果

3.6 穩健性

本套件經過測試,適用於(但不限於)以下儀器:

小販

儀器型號

擴增效率

R2

定量極限(fg/μL)

履歷

澳洲商業資訊局 7500

101.74%

1

三十

13.30%

ABI QuantStudio5

100.46%

1

三十

12.40%

伯樂

CFX96

99.20%

0.999

三十

13.76%

上海紅石

斯蘭

100.40%

0.999

三十

11.67%

表5 儀器適用性試驗結果

3.7 穩定性

3.7.1 凍融穩定性

大腸桿菌宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒(2G)經10次重複凍融測試,試劑盒性能未受影響。

測試指標

凍融時間

範圍

T0時間

凍融10次

標準曲線參數

擴增效率

98.23%

100.20%

R2

1

0.999

定量限(30 fg/μL)

履歷

15.07%

9.66%

表6 凍融穩定性結果分析

3.72 加速穩定性

E.coli宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒(2G)分別在2~8°C保存30天和37°C保存14天。該套件的所有性能均未受到影響。

測試指標

加速溫度和時間

範圍

實驗 1

實驗 2

T0時間

2~8℃ 30 天

T0時間

37℃ 14天

標準曲線參數

擴增效率

97.77%

99.81%

98.39%

98.65%

R2

1

1

1

1

定量限(30 fg/μL)

履歷

11.04%

13.79%

9.55%

14.55%

表7 加速穩定性結果分析

  1. 4參考

4.1 國家藥典委員會(ChPC)。中華人民共和國藥典(三部)[S].北京:中國醫藥科技出版社,p.542-543,2020年。

4.2國家藥品監督管理局,2007年:《生物製品品質管制分析方法驗證技術審查通則》。

4.3 ICH(2022)《分析方法驗證Q2》,徵求意見稿。

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